聚合酶鏈式反應準備:PCR所用的酶主要有兩種來源:Taq和Pfu,,分別來自兩種不同的噬熱菌。其中Taq擴增效率高但易發(fā)生錯配,。Pfu擴增效率弱但有糾錯功能,。所以實際使用時根據(jù)需要必須做不同的選擇。模板即擴增用的DNA,,可以是任何來源,,但有兩個原則,純度必須較高,,第二濃度不能太高以免抑制,。緩沖液的成分很為復雜,除水外一般包括四個有效成分:緩沖體系,,一般使用HEPES或MOPS緩沖體系,;一價陽離子,一般采用鉀離子,,但在特殊情況下也可使用銨根離子,;二價陽離子,即鎂離子,,根據(jù)反應體系確定,,除特殊情況外不需調整;輔助成分,,常見的有DMSO,、甘油等,主要用來保持酶的活性和幫助DNA解除纏繞結構,。聚合酶鏈反應非常敏感,,有可能產生數(shù)百萬到數(shù)十億份特定產品的拷貝,用于測序,、克隆和分析,。徐州微量定量PCR原理
聚合酶鏈式反應:反應的控制:PCR反應的緩沖液 提供合適的酸堿度與某些離子;鎂離子濃度 總量應比dNTPs的濃度高,,常用1.5mmol/L,;底物濃度 dNTP以等摩爾濃度配制,20~200umol/L,;TaqDNA聚合酶 2.5U(100ul),;引物濃度一般為0.1 ~ 0.5umol/L,;反應溫度和循環(huán)次數(shù);變性溫度和時間 95℃,,30s,;退火溫度和時間 低于引物Tm值5 ℃左右,一般在45~55℃,;延伸溫度和時間 72℃,,1min/kb(10kb內);Tm值=4(G+C) +2(A+T),;循環(huán)次數(shù) :一般為25 ~ 30次,。循環(huán)數(shù)決定PCR擴增的產量。模板初始濃度低,,可增加循環(huán)數(shù)以便達到有效的 擴增量,。但循環(huán)數(shù)并不是可以無限增加的。一般循環(huán)數(shù)為30個左右,,循環(huán)數(shù)超過30個以后,,DNA聚合酶活性逐漸達到飽和,產物的量不再隨循環(huán)數(shù)的增加而增加,,出現(xiàn)了所謂的“平臺期”,。莆田骨頭定量PCR現(xiàn)在有些PCR因為擴增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時間內復制完成,。
聚合酶鏈式反應的特點:特異性強,,PCR反應的特異性決定因素為:引物與模板DNA特異正確的結合;堿基配對原則,;Taq DNA聚合酶合成反應的忠實性,;靶基因的特異性與保守性。其中引物與模板的正確結合是關鍵,。引物與模板的結合及引物鏈的延伸是遵循堿基配對原則的,。聚合酶合成反應的忠實性及TaqDNA聚合酶耐高溫性,使反應中模板與引物的結合(復性)可以在較高的溫度下進行,,結合的特異性增加,被擴增的靶基因片段也就能保持很高的正確度,。再通過選擇特異性和保守性高的靶基因區(qū),,其特異性程度就更高。
基于聚合酶鏈反應的遺傳(或脫氧核糖核酸)指紋圖譜協(xié)議的發(fā)展已在法醫(yī)學中得到較廣應用:遺傳指紋以其辨別力的形式,,可以從世界上所有人群中獨特地區(qū)分任何一個人,。微小的DNA樣本可以從犯罪現(xiàn)場,和比較的從嫌疑人那里,,或者從DNA資料庫早期的證據(jù)或罪犯,。這些測試的簡單版本通常用于在刑事調查中快速排除嫌疑人,。幾十年前的犯罪證據(jù)可以被檢驗,確認或免責很初被定罪的人,。脫氧核糖核酸指紋中較小的區(qū)別有助于親子鑒定,,在親子鑒定中,一個人和他的近親相匹配,??梢詼y試未知人類遺骸的DNA,并與可能的父母,、兄弟姐妹或兒童進行比較,。類似的測試可以用來確認被收養(yǎng)(或)孩子的親生父母。新生兒的實際生父也可以被確認(或排除),。序列間特異性聚合酶鏈反應是一種用于DNA指紋識別的聚合酶鏈反應方法,。
聚合酶鏈反應:嵌套聚合酶鏈反應:通過減少DNA非特異性擴增的背景,提高DNA擴增的特異性,。兩組引物用于兩個連續(xù)的PCR,。在個反應中,一對引物用于產生DNA產物,,除了預期的靶之外,,該產物可能仍然由非特異性擴增的DN段組成。然后用一組引物將產物用于第二次聚合酶鏈反應,,所述引物的結合位點完全或部分不同于次反應中使用的每個引物,,并且位于其中的3’。嵌套式PCR在特異性擴增長DN段方面通常比傳統(tǒng)PCR更成功,,但它需要更詳細的目標序列知識,。重疊延伸聚合酶鏈反應或者通過重疊延伸拼接(SOEing):一種用于將兩個或多個含有互補序列的DN段拼接在一起的基因工程技術。它用于連接含有基因,、調節(jié)序列或突變的DN段,;這項技術可以創(chuàng)造特定的長DNA構建體。它還可以將缺失,、插入或點突變引入DNA序列,。聚合酶鏈反應應經(jīng)常使用帶有一次性柱塞和超長移液器吸頭的移液器。莆田骨頭定量PCR
重疊延伸聚合酶鏈反應用于連接含有基因,、調節(jié)序列或突變的DN段,。徐州微量定量PCR原理
聚合酶鏈式反應的步驟:標準的PCR過程分為三步:DNA變性:(90℃-96℃):雙鏈DNA模板在熱作用下,氫鍵斷裂,,形成單鏈DNA,;退火:(60℃-65℃):系統(tǒng)溫度降低,引物與DNA模板結合,形成局部雙鏈,。延伸:(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,,活性很好)的作用下,以dNTP為原料,,從引物的3′端開始以從5′→3′端的方向延伸,,合成與模板互補的DNA鏈。每一循環(huán)經(jīng)過變性,、退火和延伸,,DNA含量即增加一倍。現(xiàn)在有些PCR因為擴增區(qū)很短,,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時間內復制完成,,因此可以改為兩步法,即退火和延伸同時在60℃-65℃間進行,。徐州微量定量PCR原理
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