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分子生物學(xué)PCR檢測技術(shù)

來源: 發(fā)布時間:2022-09-02

聚合酶鏈式反應(yīng):定量PCR允許實時定量和檢測特定的DNA序列,,因為它在合成過程中測量濃度。有兩種方法可以同時檢測和定量,。種方法是使用在DNA雙鏈之間非特異性保留的熒光染料,。第二種方法涉及編碼特定序列并被熒光標記的探針。只有在探針與其互補DNA雜交后,,才能使用這些方法檢測DNA,。一種有趣的技術(shù)組合是實時PCR和逆轉(zhuǎn)錄。這種復(fù)雜的技術(shù)被稱為RT-qPCR,,允許定量少量RNA,。通過這種組合技術(shù),mRNA被轉(zhuǎn)化為cDNA,,并用qPCR進一步定量,。這種技術(shù)降低了聚合酶鏈反應(yīng)終點出錯的可能性,增加了檢測與遺傳疾病如病癥相關(guān)的基因的機會,。實驗室使用RT-qPCR來靈敏地測量基因調(diào)控,。聚合酶鏈式反應(yīng):模板的制備,PCR的模板可以是DNA,,也可以是RNA,。分子生物學(xué)PCR檢測技術(shù)

分子生物學(xué)PCR檢測技術(shù),Real-timePCR技術(shù)服務(wù)

聚合酶鏈式反應(yīng)的特點:特異性強,PCR反應(yīng)的特異性決定因素為:引物與模板DNA特異正確的結(jié)合,;堿基配對原則,;Taq DNA聚合酶合成反應(yīng)的忠實性;靶基因的特異性與保守性,。其中引物與模板的正確結(jié)合是關(guān)鍵,。引物與模板的結(jié)合及引物鏈的延伸是遵循堿基配對原則的。聚合酶合成反應(yīng)的忠實性及TaqDNA聚合酶耐高溫性,,使反應(yīng)中模板與引物的結(jié)合(復(fù)性)可以在較高的溫度下進行,,結(jié)合的特異性增加,被擴增的靶基因片段也就能保持很高的正確度,。再通過選擇特異性和保守性高的靶基因區(qū),,其特異性程度就更高。分子生物學(xué)PCR檢測技術(shù)聚合酶鏈式反應(yīng)中的DMSO,、甘油等,,主要用來保持酶的活性和幫助DNA解除纏繞結(jié)構(gòu)。

分子生物學(xué)PCR檢測技術(shù),Real-timePCR技術(shù)服務(wù)

聚合酶鏈式反應(yīng)的步驟:標準的PCR過程分為三步:DNA變性:(90℃-96℃):雙鏈DNA模板在熱作用下,,氫鍵斷裂,,形成單鏈DNA;退火:(60℃-65℃):系統(tǒng)溫度降低,,引物與DNA模板結(jié)合,,形成局部雙鏈。延伸:(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,,活性很好)的作用下,,以dNTP為原料,從引物的3′端開始以從5′→3′端的方向延伸,,合成與模板互補的DNA鏈,。每一循環(huán)經(jīng)過變性、退火和延伸,,DNA含量即增加一倍?,F(xiàn)在有些PCR因為擴增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時間內(nèi)復(fù)制完成,,因此可以改為兩步法,,即退火和延伸同時在60℃-65℃間進行。

PCR的反應(yīng)條件:dNTP濃度過高會加快反應(yīng)速度,,但同時還可以增加堿基的錯誤摻入率,。引物濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴增,。TaqDNA聚合酶濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴增,低則合成產(chǎn)物量減少,。TaqDNA聚合酶無校正功能,,摻入錯誤率達2*E-4個核苷酸,一個30個循環(huán)的擴增反應(yīng)0.1%-0.25%總錯誤率,。在90~95度下可使整個基因組的DNA變性為單鏈,。一般94~95度30~60s。時間過長使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多,。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結(jié)合,。引物長度在15~25時退火溫度。熱啟動/冷完成聚合酶鏈反應(yīng)是通過新的雜合聚合酶實現(xiàn)的,,這些酶在環(huán)境溫度下不活躍,。

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聚合酶鏈式反應(yīng):反應(yīng)的控制:PCR反應(yīng)的緩沖液 提供合適的酸堿度與某些離子;鎂離子濃度 總量應(yīng)比dNTPs的濃度高,,常用1.5mmol/L,;底物濃度 dNTP以等摩爾濃度配制,20~200umol/L,;TaqDNA聚合酶 2.5U(100ul),;引物濃度一般為0.1 ~ 0.5umol/L;反應(yīng)溫度和循環(huán)次數(shù),;變性溫度和時間 95℃,,30s;退火溫度和時間 低于引物Tm值5 ℃左右,,一般在45~55℃,;延伸溫度和時間 72℃,1min/kb(10kb內(nèi)),;Tm值=4(G+C) +2(A+T),;循環(huán)次數(shù) :一般為25 ~ 30次。循環(huán)數(shù)決定PCR擴增的產(chǎn)量,。模板初始濃度低,,可增加循環(huán)數(shù)以便達到有效的 擴增量。但循環(huán)數(shù)并不是可以無限增加的,。一般循環(huán)數(shù)為30個左右,,循環(huán)數(shù)超過30個以后,DNA聚合酶活性逐漸達到飽和,,產(chǎn)物的量不再隨循環(huán)數(shù)的增加而增加,,出現(xiàn)了所謂的“平臺期”。聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)是一種用于放大擴增特定的DN段的分子生物學(xué)技術(shù),。分子生物學(xué)PCR檢測技術(shù)

嵌套聚合酶鏈反應(yīng):通過減少DNA非特異性擴增的背景,,提高DNA擴增的特異性,。分子生物學(xué)PCR檢測技術(shù)

聚合酶鏈式反應(yīng)PCR技術(shù)的基本原理類似于DNA的天然復(fù)制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物,。PCR由變性-退火-延伸三個基本反應(yīng)步驟構(gòu)成:模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準備,;模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合,;引物的延伸:DNA模板-引物結(jié)合物在72℃,、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,,靶序列為模板,,按堿基互補配對與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復(fù)制鏈,,重復(fù)循環(huán)變性-退火-延伸三過程就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2~4分鐘,,2~3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍,。分子生物學(xué)PCR檢測技術(shù)

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