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南通分子生物學(xué)熒光PCR研究方案

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-10-09

聚合酶鏈反應(yīng):流聚合酶鏈反應(yīng):一種偽等溫PCR方法,。將溶液置于熱梯度下,,而不是反復(fù)加熱和冷卻聚合酶鏈反應(yīng)混合物,。由此產(chǎn)生的熱不穩(wěn)定性驅(qū)動(dòng)對(duì)流流動(dòng)自動(dòng)將聚合酶鏈反應(yīng)試劑從熱區(qū)域和冷區(qū)域打亂,從而反復(fù)啟動(dòng)聚合酶鏈反應(yīng),。通過(guò)利用混沌流場(chǎng)的出現(xiàn),可以?xún)?yōu)化熱邊界條件和PCR外殼的幾何形狀等參數(shù),,以產(chǎn)生特異和快速的PCR,。這種對(duì)流聚合酶鏈反應(yīng)設(shè)置明顯降低了設(shè)備功率需求和操作時(shí)間。逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)):用于從RNA中擴(kuò)增DNA,。逆轉(zhuǎn)錄酶將核糖核酸逆轉(zhuǎn)錄成cDNA ,,然后通過(guò)聚合酶鏈反應(yīng)進(jìn)行擴(kuò)增。逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)較廣用于表達(dá)譜,,以確定基因的表達(dá)或鑒定RNA轉(zhuǎn)錄物的序列,,包括轉(zhuǎn)錄起始和終止位點(diǎn)。如果基因的基因組DNA序列是已知的,,逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)可以用來(lái)繪制基因中外顯子和內(nèi)含子的位置,。基因的5’端(對(duì)應(yīng)于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn))通常通過(guò) RACE-PCR (快速擴(kuò)增cDNA末端)中,。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):模板的制備,,PCR的模板可以是DNA,也可以是RNA,。南通分子生物學(xué)熒光PCR研究方案

南通分子生物學(xué)熒光PCR研究方案,Real-timePCR技術(shù)服務(wù)

聚合酶鏈反應(yīng)的常見(jiàn)問(wèn)題分析與解決方法:無(wú)擴(kuò)增條帶:酶失活或在反應(yīng)體系中未加入酶,。Taq DNA聚合酶因保存或運(yùn)輸不當(dāng)而失活,往往通過(guò)更換新酶或用另一來(lái)源的酶以獲得滿(mǎn)意的結(jié)果,。模板含有雜質(zhì),。特別是對(duì)甲醛固定及石蠟包埋的組織常含甲酸,造成DNA脫嘌呤而影響PCR的結(jié)果,。變性溫度是否準(zhǔn)確:PCR儀指示溫度與實(shí)際溫度是否相符,,過(guò)高酶在前幾個(gè)循環(huán)就迅速失活;過(guò)低則模板變性不徹底,。反應(yīng)系統(tǒng)中污染了蛋白酶及核酸酶,,應(yīng)在未加Taq酶以前,,將反應(yīng)體系95℃加熱5-10 min。引物變質(zhì)失效,。人工合成的引物是否正確,。是否純化,或因儲(chǔ)存條件不當(dāng)而失活,。引物錯(cuò)誤,。利用BLAST檢查引物特異性或重新設(shè)計(jì)引物。 DNA凝膠電泳時(shí)加入陽(yáng)性對(duì)照,,確保不是DNA凝膠和PCR程序的問(wèn)題,。武漢分子生物學(xué)PCR檢測(cè)技術(shù)供應(yīng)商PCR由變性-退火-延伸三個(gè)基本反應(yīng)步驟構(gòu)成。

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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:10×擴(kuò)增緩沖液,、4種dNTP混合物(終濃度),、引物(終濃度)、模板DNA,、Taq DNA聚合酶,、Mg2+(終濃度)、補(bǔ)加雙蒸水等,。其中dNTP,、引物、模板DNA,、Taq DNA聚合酶以及Mg2+的加量(或濃度)可根據(jù)實(shí)驗(yàn)調(diào)整,,以上表格只提供大致參考值。PCR反應(yīng)五要素:參加PCR反應(yīng)的物質(zhì)主要有五種即:引物(PCR引物為DN段,,細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制的引物為一段RNA鏈),、酶、dNTP,、模板和緩沖液(其中需要Mg2+),。引物有多種設(shè)計(jì)方法,由PCR在實(shí)驗(yàn)中的目的決定,,但基本原則相同,。

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):模板的制備,PCR的模板可以是DNA,,也可以是RNA,。模板的取材主要依據(jù)PCR的擴(kuò)增對(duì)象,可以是病原體標(biāo)本如病毒,、細(xì)菌,、菌類(lèi)等。也可以是病理生理標(biāo)本如細(xì)胞,、血液,、羊水細(xì)胞等。法醫(yī)學(xué)標(biāo)本有血斑,、精斑,、毛發(fā)等。標(biāo)本處理的基本要求是除去雜質(zhì),,并部分純化標(biāo)本中的核酸,。多數(shù)樣品需要經(jīng)過(guò)SDS和蛋白酶K處理。難以破碎的細(xì)菌,,可用溶菌酶加EDTA處理,。所得到的粗制DNA,經(jīng)酚,、氯仿抽提純化,,再用乙醇沉淀后用作PCR反應(yīng)模板。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)是80年代中期發(fā)展起來(lái)的體外核酸擴(kuò)增技術(shù),。

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聚合酶鏈反應(yīng)的一個(gè)主要限制是,,為了產(chǎn)生允許其選擇性擴(kuò)增的引物,需要關(guān)于目標(biāo)序列的先前信息,。這意味著,,通常情況下,PCR用戶(hù)必須知道兩個(gè)單鏈模板中每個(gè)模板上目標(biāo)區(qū)域上游的精確序列,,以確保DNA聚合酶正確結(jié)合引物-模板雜交體,,并隨后在DNA合成過(guò)程中產(chǎn)生整個(gè)目標(biāo)區(qū)域。像所有酶一樣,,DNA聚合酶也容易出錯(cuò),,這反過(guò)來(lái)會(huì)導(dǎo)致產(chǎn)生的PCR片段發(fā)生突變。PCR的另一個(gè)限制是,,即使是很少量的污染DNA也可以被擴(kuò)增,,導(dǎo)致誤導(dǎo)或模糊的結(jié)果。為了很大限度地減少污染的可能性,,調(diào)查人員應(yīng)該為試劑制備,、聚合酶鏈反應(yīng)和產(chǎn)品分析預(yù)留單獨(dú)的房間。試劑應(yīng)分配到一次性的等分試樣中,。應(yīng)經(jīng)常使用帶有一次性柱塞和超長(zhǎng)移液器吸頭的移液器,。嵌套式PCR在特異性擴(kuò)增長(zhǎng)DN段方面通常比傳統(tǒng)PCR更成功,但它需要更詳細(xì)的目標(biāo)序列知識(shí),。莆田細(xì)胞Real-time PCR原理

PCR的另一個(gè)限制是,,即使是很少量的污染DNA也可以被擴(kuò)增,導(dǎo)致誤導(dǎo)或模糊的結(jié)果。南通分子生物學(xué)熒光PCR研究方案

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的試驗(yàn)污染:PCR反應(yīng)的很大特點(diǎn)是具有較大擴(kuò)增能力與極高的靈敏性,,但令人腦袋不適的問(wèn)題是易污染,,極其微量的污染即可造成假陽(yáng)性的產(chǎn)生。 污染原因:標(biāo)本間交叉污染:標(biāo)本污染主要有收集標(biāo)本的容器被污染,,或標(biāo)本放置時(shí),,由于密封不嚴(yán)溢于容器外,或容器外粘有標(biāo)本而造成相互間交叉污染,;標(biāo)本核酸模板在提取過(guò)程中,,由于吸樣污染導(dǎo)致標(biāo)本間污染;有些微生物標(biāo)本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴(kuò)散,,導(dǎo)致彼此間的污染,。PCR試劑的污染:主要是由于在PCR試劑配制過(guò)程中,由于加樣,、容器,、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染。南通分子生物學(xué)熒光PCR研究方案

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