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南京分子生物學(xué)數(shù)字PCR原理

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-02-03

Real-time PCR:實(shí)時(shí)熒光定量PCR是目前確定樣品中DNA(或cDNA)拷貝數(shù)較敏感、較準(zhǔn)確的方法。如果用于RNA檢測(cè),,這被稱(chēng)為逆轉(zhuǎn)錄實(shí)時(shí)PCR即(Real-timeRT-PCR)是實(shí)時(shí)PCR法,它是指對(duì)DNA或經(jīng)過(guò)反轉(zhuǎn)入(RT-PCR)的RNA通過(guò)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)并實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)DNA的放大過(guò)程,,在擴(kuò)增的指數(shù)增長(zhǎng)期就測(cè)量擴(kuò)增產(chǎn)物,因?yàn)閿U(kuò)增指數(shù)增長(zhǎng)期測(cè)量值與特異DNA(RNA)起始量存在相關(guān)性,從而實(shí)現(xiàn)定量檢測(cè)。Real-time PCR的基本目標(biāo)是精確測(cè)量和鑒別非常微量的特異性核酸,,從而可通過(guò)監(jiān)測(cè)CT值而實(shí)現(xiàn)對(duì)原始目標(biāo)基因的含量定量,。實(shí)時(shí)熒光定量PCR法較大的優(yōu)點(diǎn)是克服了終點(diǎn)PCR法進(jìn)入平臺(tái)期或叫飽和期后定量的較大誤差,,實(shí)現(xiàn)DNA/RNA的精確定量。該技術(shù)不單單實(shí)現(xiàn)了對(duì)DNA/RNA模板的定量,,而且具有靈敏度和特異性高,、能實(shí)現(xiàn)多重反應(yīng)、自動(dòng)化程度高,、無(wú)污染,、實(shí)時(shí)和準(zhǔn)確等特點(diǎn),該技術(shù)在醫(yī)學(xué)臨床檢驗(yàn)及臨床醫(yī)學(xué)研究方面有著重要的意義,。聚合酶鏈反應(yīng)具有定量合成產(chǎn)物的優(yōu)點(diǎn),。南京分子生物學(xué)數(shù)字PCR原理

南京分子生物學(xué)數(shù)字PCR原理,Real-timePCR技術(shù)服務(wù)

聚合酶鏈反應(yīng)同時(shí)擴(kuò)增單個(gè)精子中幾個(gè)基因座的能力增強(qiáng)了極大地增強(qiáng)了通過(guò)研究減數(shù)分裂后染色體交叉來(lái)進(jìn)行基因定位的傳統(tǒng)任務(wù)。通過(guò)分析數(shù)千個(gè)單個(gè)精子,,已經(jīng)直接觀察到非常緊密基因座之間罕見(jiàn)的交叉事件,。類(lèi)似地,可以分析異常的缺失,、插入,、易位或倒位,所有這些都無(wú)需等待(或支付)漫長(zhǎng)而艱苦的受精,、胚胎發(fā)生等過(guò)程,。定點(diǎn)突變:聚合酶鏈反應(yīng)可用于產(chǎn)生突變基因,突變由科學(xué)家隨意選擇,??梢赃x擇這些突變來(lái)理解蛋白質(zhì)是如何完成其功能的,并改變或改善蛋白質(zhì)功能,。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的模板的取材主要依據(jù)PCR的擴(kuò)增對(duì)象,,可以是病原體標(biāo)本如病毒、細(xì)菌,、菌類(lèi)等,。無(wú)錫血液RT-PCR檢測(cè)技術(shù)原理及步驟實(shí)時(shí)熒光定量PCR(QuantitativeReal-time PCR)是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中,。

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Real-time PCR相對(duì)定量中的標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)法如何進(jìn)行:主要是相對(duì)定量標(biāo)準(zhǔn)品的制作,一般有三種方法:1,、比較復(fù)雜的方法:質(zhì)粒,,采用Biotnt提供內(nèi)參基因的特異性Real-time PCRmRNA引物,對(duì)目的基因進(jìn)行Real-time PCR實(shí)驗(yàn),,得到PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,;PCR擴(kuò)增產(chǎn)物轉(zhuǎn)入質(zhì)粒中,得到相對(duì)定量的標(biāo)準(zhǔn)品,;2,、一般采用的方法1:比較強(qiáng)的CDNA模板,3,、一般采用的方法:PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,,如果在方法2中找不到比較強(qiáng)的CDNA模板,則選用PCR產(chǎn)物作為相對(duì)定量的標(biāo)準(zhǔn)品也是可以的,;需要注意的事項(xiàng)是:PCR產(chǎn)物濃度很高,,而Real-time PCR的產(chǎn)物片段比較短,容易在稀釋的過(guò)程中造成PCR污染,,要注意操作,。

為了便于對(duì)所檢測(cè)樣本進(jìn)行比較,在real-timeQ-PCR反應(yīng)的指數(shù)期,,首先需設(shè)定一定熒光信號(hào)的域值,,一般這個(gè)域值(threshold)是以PCR反應(yīng)的前15個(gè)循環(huán)的熒光信號(hào)作為熒光本底信號(hào)(baseline),熒光域值的缺省設(shè)置是3~15個(gè)循環(huán)的熒光信號(hào)的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍,。如果檢測(cè)到熒光信號(hào)超過(guò)域值被認(rèn)為是真正的信號(hào),,它可用于定義樣本的域值循環(huán)數(shù)(Ct)。Ct值的含義是:每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號(hào)達(dá)到設(shè)定的域值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù),。研究表明,,每個(gè)模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的對(duì)數(shù)存在線(xiàn)性關(guān)系,起始拷貝數(shù)越多,,Ct值越小,。利用已知起始拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品可作出標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn),因此只要獲得未知樣品的Ct值,,即可從標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)上計(jì)算出該樣品的起始拷貝數(shù),。PCR反應(yīng)的關(guān)鍵環(huán)節(jié)有模板核酸的制備,引物的質(zhì)量與特異性,,酶的質(zhì)量及溴乙錠的使用,。

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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:PCR引物設(shè)計(jì),PCR反應(yīng)中有兩條引物,,即5′端引物和3′引物,。設(shè)計(jì)引物時(shí)以一條DNA單鏈為基準(zhǔn)(常以信息鏈為基準(zhǔn)),,5′端引物與位于待擴(kuò)增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物與位于待擴(kuò)增片段3′端的一小段DNA序列互補(bǔ),。引物設(shè)計(jì)的基本原則:引物長(zhǎng)度:15-30bp,,常用為20bp左右。引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,,G+C太少擴(kuò)增效果不佳,,G+C過(guò)多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC很好隨機(jī)分布,,避免5個(gè)以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照,。Real-time PCR在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中要防止RNA的降解。南京分子生物學(xué)數(shù)字PCR原理

聚合酶鏈反應(yīng)可以選擇這些突變來(lái)理解蛋白質(zhì)是如何完成其功能的,,并改變或改善蛋白質(zhì)功能,。南京分子生物學(xué)數(shù)字PCR原理

Real-timePCR的反應(yīng)條件:dNTP濃度過(guò)高會(huì)加快反應(yīng)速度,但同時(shí)還可以增加堿基的錯(cuò)誤摻入率,。引物濃度過(guò)高會(huì)引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增,。TaqDNA聚合酶濃度過(guò)高會(huì)引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增,低則合成產(chǎn)物量減少,。TaqDNA聚合酶無(wú)校正功能,摻入錯(cuò)誤率達(dá)2*E-4個(gè)核苷酸,,一個(gè)30個(gè)循環(huán)的擴(kuò)增反應(yīng)0.1%-0.25%總錯(cuò)誤率,。在90~95度下可使整個(gè)基因組的DNA變性為單鏈。一般94~95度30~60s,。時(shí)間過(guò)長(zhǎng)使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多,。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結(jié)合。引物長(zhǎng)度在15~25時(shí)退火溫度,。南京分子生物學(xué)數(shù)字PCR原理

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