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連云港微量熒光定量PCR原理

來源: 發(fā)布時間:2022-01-19

聚合酶鏈式反應(yīng)是一種在體外快速擴增特定基因或DNA序列的方法,,故又稱為基因的體外擴增法,。PCR技術(shù)類似于DNA的天然復(fù)制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物,。PCR能快速特異擴增任何已知目的基因或DN段,,并能輕易在皮克(pg)水平起始DNA混合物中的目的基因擴增達到納克,、微克、毫克級的特異性DN段,。因此,,PCR技術(shù)一經(jīng)問世就被迅速而較廣地用于分子生物學(xué)的各個領(lǐng)域?!‘惓=Y(jié)果: 各種疾病所致的異常,,例如梅毒。一期梅毒,。即硬下疳 ,,潛伏期2-4周,外生殖器部位發(fā)生暗紅色硬腫塊 ,、淺潰瘍 ,,有軟骨樣硬度,周圍淋巴結(jié)腫大,。二期梅毒,。在一期梅毒 1-2 個月之后,全身皮膚,、粘膜發(fā)生對稱泛發(fā)皮疹,、斑疹、,、疹等,。粘膜可發(fā)生粘膜斑、扁平濕疣,,傳染性強,。三期梅毒。發(fā)生在染上后2-3年乃至10年,,皮膚為樹膠樣腫,,還可涉及骨、關(guān)節(jié),、心,、血管,表現(xiàn)為主動脈炎,、主動脈瓣閉鎖不全和主動脈瘤等,,侵及神經(jīng)為脊髓癆 ,全身麻痹 ( 麻痹性癡呆 )等等,?!⌒枰獧z查的人群:疑似某種特定的疾病病人,進行分子特異性檢查。聚合酶鏈式反應(yīng)的特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物,。連云港微量熒光定量PCR原理

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聚合酶鏈反應(yīng)的一個主要限制是,,為了產(chǎn)生允許其選擇性擴增的引物,需要關(guān)于目標序列的先前信息,。這意味著,,通常情況下,PCR用戶必須知道兩個單鏈模板中每個模板上目標區(qū)域上游的精確序列,,以確保DNA聚合酶正確結(jié)合引物-模板雜交體,,并隨后在DNA合成過程中產(chǎn)生整個目標區(qū)域。像所有酶一樣,,DNA聚合酶也容易出錯,,這反過來會導(dǎo)致產(chǎn)生的PCR片段發(fā)生突變。PCR的另一個限制是,,即使是很少量的污染DNA也可以被擴增,,導(dǎo)致誤導(dǎo)或模糊的結(jié)果。為了很大限度地減少污染的可能性,,調(diào)查人員應(yīng)該為試劑制備,、聚合酶鏈反應(yīng)和產(chǎn)品分析預(yù)留單獨的房間。試劑應(yīng)分配到一次性的等分試樣中,。應(yīng)經(jīng)常使用帶有一次性柱塞和超長移液器吸頭的移液器,。連云港微量熒光定量PCR原理聚合酶鏈反應(yīng)五要素:參加PCR反應(yīng)的物質(zhì)主要有五種即:引物、酶,、dNTP,、模板和緩沖液。

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聚合酶鏈式反應(yīng):反應(yīng)的控制:PCR反應(yīng)的緩沖液 提供合適的酸堿度與某些離子,;鎂離子濃度 總量應(yīng)比dNTPs的濃度高,,常用1.5mmol/L;底物濃度 dNTP以等摩爾濃度配制,,20~200umol/L,;TaqDNA聚合酶 2.5U(100ul);引物濃度一般為0.1 ~ 0.5umol/L,;反應(yīng)溫度和循環(huán)次數(shù),;變性溫度和時間 95℃,30s,;退火溫度和時間 低于引物Tm值5 ℃左右,,一般在45~55℃;延伸溫度和時間 72℃,,1min/kb(10kb內(nèi)),;Tm值=4(G+C) +2(A+T),;循環(huán)次數(shù) :一般為25 ~ 30次。循環(huán)數(shù)決定PCR擴增的產(chǎn)量,。模板初始濃度低,,可增加循環(huán)數(shù)以便達到有效的 擴增量。但循環(huán)數(shù)并不是可以無限增加的,。一般循環(huán)數(shù)為30個左右,,循環(huán)數(shù)超過30個以后,DNA聚合酶活性逐漸達到飽和,,產(chǎn)物的量不再隨循環(huán)數(shù)的增加而增加,出現(xiàn)了所謂的“平臺期”,。

聚合酶鏈式反應(yīng)的試驗污染:實驗室中克隆質(zhì)粒的污染:在分子生物學(xué)實驗室及某些用克隆質(zhì)粒做陽性對照的檢驗室,,這個問題也比較常見。因為克隆質(zhì)粒在單位容積內(nèi)含量相當高,,另外在純化過程中需用較多的用具及試劑,,而且在活細胞內(nèi)的質(zhì)粒,由于活細胞的生長繁殖的簡便性及具有很強的生命力,。其污染可能性也很大,。污染的監(jiān)測:一個好的實驗室,要時刻注意污染的監(jiān)測,,考慮有無污染是什么原因造成的污染,,以便采取措施,防止和消除污染,。重復(fù)性試驗,。選擇不同區(qū)域的引物進行PCR擴增。為了很大限度地減少污染的可能性,,調(diào)查人員應(yīng)該為試劑制備,、聚合酶鏈反應(yīng)和產(chǎn)品分析預(yù)留單獨的房間。

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聚合酶鏈反應(yīng):在檢測病原體方面,病原體培養(yǎng)是臨床診斷的金標準 .但是對于一些苛養(yǎng)菌 生長緩慢的細菌或難以培養(yǎng)的病原體等培養(yǎng)的陽性檢出率不高.檢測時間過長 無法滿足臨床早期快速診斷以指導(dǎo)醫(yī)治的需要[3],。當前 PCR 技術(shù)是在傳統(tǒng) PCR 技術(shù)應(yīng)用的基礎(chǔ)上進行的改進,,包括實時定量 PCR 技術(shù) 、 實時熒光定量PCR,、 PCR-酶聯(lián)免疫吸附試驗 ,、 巢式PCR等。 在PCR技術(shù)的輔助作用下,,實驗室檢測也逐漸從生化免疫診斷過渡到基因診斷,,生化免疫檢測主要從表型表現(xiàn)評估病癥,而基因診斷則深入本質(zhì)探究其病因,,以PCR 技術(shù)為主的核酸技術(shù)在臨床實驗室檢測與疾病診斷中表現(xiàn)出了明顯的應(yīng)用價值,,在未來的臨床醫(yī)學(xué)檢驗中必將會得到更加較廣的應(yīng)用。流聚合酶鏈反應(yīng):一種偽等溫PCR方法。黃山分子生物學(xué)定量PCR

聚合酶鏈式反應(yīng)的模板的取材主要依據(jù)PCR的擴增對象,,可以是病原體標本如病毒,、細菌、菌類等,。連云港微量熒光定量PCR原理

聚合酶鏈式反應(yīng)的常見問題:出現(xiàn)非特異性擴增帶:PCR擴增后出現(xiàn)的條帶與預(yù)計的大小不一致,,或大或小,或者同時出現(xiàn)特異性擴增帶 與非特異性擴增帶,。非特異性條帶的出現(xiàn),,其原因:一是引物與靶序列不完全互補、或引物聚合形成二聚體,。二是Mg2+離子濃度過高,、退火溫度過低,及PCR循環(huán)次數(shù)過多有關(guān),。其次是酶的質(zhì)和量,,往往一些來源的酶易出現(xiàn)非特異條帶而另一來源的酶則不出現(xiàn),酶量過多有時也會出現(xiàn)非特異性擴增,。其對策有:必要時重新設(shè)計引 物,。減低酶量或調(diào)換另一來源的酶。降低引物量,,適當增加模板量,,減少循環(huán)次數(shù)。適當提高退火溫度或采用二溫度點法(93℃變性,,65℃左右退火與延伸),。連云港微量熒光定量PCR原理