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武漢蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-02-15

蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用,?具體而言,,蛋白質(zhì)組學(xué)在此類應(yīng)用中,,更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息,。作為檢測(cè)手段的蛋白質(zhì)組學(xué):事實(shí)上,,在當(dāng)前的生物醫(yī)學(xué)研究和臨床診斷中,,蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)有非常多的應(yīng)用,。因?yàn)榈鞍踪|(zhì)組學(xué)技術(shù)的本質(zhì)(從分析化學(xué)角度來(lái)看),,就是對(duì)蛋白質(zhì)的定性定量分析,。生物醫(yī)學(xué)和臨床診斷中,,需要大量表征一種或多種蛋白質(zhì)的含量、氨基酸序列,、翻譯后修飾等信息,。蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)目前在一小部分]應(yīng)用中具有獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。有很多蛋白質(zhì)組學(xué)的研究者在工業(yè)界和醫(yī)院進(jìn)行相關(guān)研究和日常工作,。很容易發(fā)現(xiàn),,當(dāng)前蛋白質(zhì)組學(xué)的臨床應(yīng)用更多地集中在第二類。第1類的應(yīng)用更接近于生物醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究,,目前還沒有和大部分人的現(xiàn)實(shí)生活產(chǎn)生關(guān)系,。蛋白質(zhì)組學(xué)與其它學(xué)科的交叉也將日益明顯和重要。武漢蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究

蛋白質(zhì)組學(xué):常用技術(shù):靶向蛋白組(PRM靶向蛋白/肽段定量),,修飾蛋白組學(xué)(定量磷酸化修飾組學(xué),、定量糖基化修飾蛋白組學(xué)、定量乙?;揎椀鞍捉M學(xué)和定量泛素化修飾蛋白組學(xué)),,互作蛋白組學(xué)(代謝物與蛋白互作研究)。什么樣本能做蛋白組學(xué)檢測(cè)?大概可以測(cè)到多少的蛋白種類,?原則上只要能提取到蛋白,,就可以做蛋白組檢測(cè)。樣本測(cè)到的蛋白種類跟數(shù)據(jù)庫(kù)和樣本本身蛋白濃度有關(guān),,一般數(shù)據(jù)庫(kù)越大,,可以鑒定到的蛋白質(zhì)數(shù)量越多。也與樣本的類型有關(guān),,通常,,組織細(xì)胞相比于體液樣本,能夠鑒定到更多的蛋白,。武漢蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究蛋白質(zhì)組研究技術(shù)涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象,,如信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞分化,、蛋白質(zhì)折疊等等,。

蛋白質(zhì)組學(xué):蛋白質(zhì)組一詞,源于蛋白質(zhì)與基因組兩個(gè)詞的組合,,意指“一種基因組所表達(dá)的全套蛋白質(zhì)”,,即包括一種細(xì)胞乃至一種生物所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學(xué)本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征,,包括蛋白質(zhì)的表達(dá)水平,,翻譯后的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,,由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生,,細(xì)胞代謝等過(guò)程的整體而全方面的認(rèn)識(shí)。蛋白質(zhì)組的研究不只能為生命活動(dòng)規(guī)律提供物質(zhì)基礎(chǔ),,也能為眾多種疾病機(jī)理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑,。通過(guò)對(duì)正常個(gè)體及病理個(gè)體間的蛋白質(zhì)組比較分析,我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質(zhì)分子”,,它們可成為新藥物設(shè)計(jì)的分子靶點(diǎn),,或者也會(huì)為疾病的早期診斷提供分子標(biāo)志。確實(shí),,那些世界范圍內(nèi)銷路*的藥物本身是蛋白質(zhì)或其作用靶點(diǎn)為某種蛋白質(zhì)分子,。因此,蛋白質(zhì)組學(xué)研究不只是探索生命奧秘的必須工作,,也能為人類健康事業(yè)帶來(lái)巨大的利益,。

蛋白質(zhì)組學(xué):質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組學(xué)的基本原理主要是通過(guò)測(cè)定被測(cè)樣品離子的理化性質(zhì)來(lái)進(jìn)行分析,根據(jù)樣品的質(zhì)量譜圖和相關(guān)信息從而得到定性和定量結(jié)果,。目前,,蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析一般是根據(jù)保留時(shí)間(retentiontime),、質(zhì)荷比(m/z)、離子強(qiáng)度(intensity)這三個(gè)維度對(duì)肽蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定和定量,,即3D蛋白質(zhì)組學(xué),。4D蛋白質(zhì)組學(xué)在3D蛋白質(zhì)組學(xué)的基礎(chǔ)之上增加了第四維度,離子淌度(mobility),,主要根據(jù)離子的形狀和截面對(duì)離子進(jìn)行分離,,能夠區(qū)分m/z差值非常小的肽段,使低豐度蛋白信號(hào)能夠被區(qū)分和識(shí)別出來(lái),。4D蛋白質(zhì)組學(xué)基于timsTOFPro質(zhì)譜儀,,結(jié)合PASEF(ParallelAccumulationSerialFragmentation,同步累積連續(xù)碎裂)與TIMS(TrappedIonMobilitySpectrometry,,離子遷移譜),,可重復(fù)測(cè)量所有檢測(cè)離子的碰撞截面(CCS),能更快,、更靈敏的進(jìn)行蛋白質(zhì)組定性和定量。定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)主要分為標(biāo)記(label)和非標(biāo)記(label free)定量策略,。

PRM靶向蛋白質(zhì)組學(xué):是一種基于Orbitrap為表示的高分辨,、高精度質(zhì)譜的離子監(jiān)視技術(shù),首先利用四級(jí)桿質(zhì)量分析器的選擇能力,,用Q1選擇目標(biāo)肽段的母離子,,隨后在collisioncell中對(duì)母離子進(jìn)行碎裂,然后利用Orbitrap分析器在二級(jí)質(zhì)譜中檢測(cè)所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片信息,。這樣能夠?qū)δ繕?biāo)蛋白質(zhì),、目標(biāo)肽段(如發(fā)生翻譯后修飾的肽段)進(jìn)行選擇性檢測(cè),即可對(duì)目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進(jìn)行相對(duì)(一定)定量,。從而實(shí)現(xiàn)對(duì)復(fù)雜樣本中的目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進(jìn)行準(zhǔn)確地特異性分析,。質(zhì)譜技術(shù)相較于傳統(tǒng)蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)而言,擁有靈敏,、準(zhǔn)確,、高通量、自動(dòng)化等特點(diǎn),。上海高通量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)服務(wù)

蛋白質(zhì)組(Proteome)一詞,,源于蛋白質(zhì)(protein)與基因組(genome)兩個(gè)詞的組合。武漢蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究

蛋白質(zhì)組學(xué):對(duì)人類而言,,蛋白質(zhì)組學(xué)的研究終究要服務(wù)于人類的健康,,主要指促進(jìn)分子醫(yī)學(xué)的發(fā)展。如尋找藥物的靶分子,。很多藥物本身就是蛋白質(zhì),,而很多藥物的靶分子也是蛋白質(zhì)。藥物也可以干預(yù)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。在基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)和疾病機(jī)理研究中,,了解人不同發(fā)育,、生長(zhǎng)期和不同生理、病理?xiàng)l件下及不同細(xì)胞類型的基因表達(dá)的特點(diǎn)具有特別重要的意義,。這些研究可能找到直接與特定生理或病理狀態(tài)相關(guān)的分子,,進(jìn)一步為設(shè)計(jì)作用于特定靶分子的藥物奠定基礎(chǔ)。武漢蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究

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