轉(zhuǎn)錄組學應用于胃腸瘤轉(zhuǎn)移機制研究：circRNA是一種非編碼RNA，可以多種方式參與生物學功能,，如細胞增殖,、細胞周期,、侵襲和轉(zhuǎn)移等,。近年來研究發(fā)現(xiàn)，環(huán)狀RNA可以通過海綿吸附微小RNA和RNA結(jié)合蛋白參與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,，從而影響瘤耐藥過程中的DNA修復,、凋亡、增殖,、細胞轉(zhuǎn)運,，以及介導瘤耐藥的細胞內(nèi)酶,，進而在瘤耐藥中發(fā)揮重要調(diào)節(jié)作用。有研究證實通過干擾環(huán)狀RNA的表達,，可以提高瘤對藥物的敏感性,，提示環(huán)狀RNA可能為抗瘤藥物耐藥性的研究提供新的靶點。轉(zhuǎn)錄學組測序可對任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動進行檢測,。濟南外泌體轉(zhuǎn)錄組學技術(shù)

轉(zhuǎn)錄組及轉(zhuǎn)錄組測序（RNA-seq）：轉(zhuǎn)錄組即特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和,，包括mRNA和非編碼RNA。轉(zhuǎn)錄組測序（RNA-seq）主要通過高通量測序研究特定組織或細胞在某個時期轉(zhuǎn)錄出來的mRNA的表達量,，進而對相關基因和表型的關系進行分析,。本質(zhì)上講RNA-seq就是在用一種新的方法實現(xiàn)“基因決定性狀”的經(jīng)典思路。在RNA-seq之前用于研究基因組表達分析的主要技術(shù)是基因芯片,，不過由于高通量測序成本的下降,，RNA-seq的運用愈來愈普遍。貴州外泌體轉(zhuǎn)錄組學定量分析基于高通量測序平臺的轉(zhuǎn)錄組學測序技術(shù)能夠全方面獲得物種特定組織的轉(zhuǎn)錄本信息,。

全轉(zhuǎn)錄組測序：狹義的轉(zhuǎn)錄組默認只包含mRNA,，但是廣義的轉(zhuǎn)錄組指的是細胞或組織中所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的匯合，其中包含mRNA和非編碼RNA（non-codingRNA,ncRNA）,。非編碼RNA目前的研究多集中在具有調(diào)控功能的smallRNA（以miRNA為表示）,，長鏈非編碼RNA（longnon-codingRNA,lncRNA）和環(huán)狀RNA（circularRNA,circRNA）上，而這幾類ncRNA的調(diào)控對象都和mRNA有關,。因此,，全轉(zhuǎn)錄組即包含了ncRNAs和mRNA。全轉(zhuǎn)錄組測序即對以上四種ncRNA進行測序,，并分析這四者之間復雜的相互作用關系,。

普通轉(zhuǎn)錄組學測序適用于哪些情況？普通轉(zhuǎn)錄組測序主要適用于兩大類：一是不同的生長階段或者發(fā)育過程,；二是不同的環(huán)境,、藥物、病原菌等逆境脅迫處理,。轉(zhuǎn)錄組學測序必須做生物學重復么,？需要幾個重復？生物學重復是生物實驗所必須的,，轉(zhuǎn)錄組測序也不例外,，至少3次生物學重復。準備生物重復樣品時,，通過對實驗的預先設計和控制,，盡可能將與實驗處理無關的背景條件控制在同一水平，減少批次效應對結(jié)果的影響,。轉(zhuǎn)錄組學測序可以同時測到mRNA,、lncRNA,、micRNA以及circRNA么？我們通常所講的轉(zhuǎn)錄組測序只能測到mRNA,。但是全轉(zhuǎn)錄組測序通過構(gòu)建兩個測序文庫（一是小RNA測序文庫,、二是lncRNA測序文庫）是可以測到以上4種RNA的。轉(zhuǎn)錄組學廣義上指在某一生理條件下,，細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄組產(chǎn)物的組合,。

RNA-Seq，是基于新一代測序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組學研究方法：首先提取生物樣品的全部轉(zhuǎn)錄的RNA并進行mRNA富集,，然后反轉(zhuǎn)錄為cDNA后進行的新一代高通量測序,，在此基礎上進行片段的拼接組裝，從而可得到一個個的轉(zhuǎn)錄本,，進而可以形成對該生物樣品當前發(fā)育狀態(tài)的基因表達狀況的全局了解,。不同階段或部位的生物樣品的RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組進行比較分析，則可以在轉(zhuǎn)錄層面得到基因表達水平的變化,，針對關鍵基因則可以進行代謝通路（Pathway）的構(gòu)建,。轉(zhuǎn)錄組學即特定細胞在某一功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA,。轉(zhuǎn)錄組學分析轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu)和表達水平的同時,，還能發(fā)現(xiàn)未知轉(zhuǎn)錄本和稀有轉(zhuǎn)錄本。濟南外泌體轉(zhuǎn)錄組學技術(shù)

轉(zhuǎn)錄組學測序包括mRNA和非編碼RNA,。濟南外泌體轉(zhuǎn)錄組學技術(shù)

轉(zhuǎn)錄組學技術(shù)：轉(zhuǎn)錄組學（transcriptomics）,，是一門在整體水平上研究細胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學科。簡而言之,，轉(zhuǎn)錄組學是從RNA水平研究基因表達的情況,。轉(zhuǎn)錄組即一個活細胞所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段,。優(yōu)勢：高通量,、更精確的數(shù)字信號；在單核苷酸水平對任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動進行檢測,；分析轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu)和表達水平的同時,，還能發(fā)現(xiàn)未知轉(zhuǎn)錄本和稀有轉(zhuǎn)錄本；準確地識別可變剪切和融合基因,。應用方向：植物生長機制的發(fā)現(xiàn)及干預,；炎癥發(fā)生機制的發(fā)現(xiàn)及干預；表達差異的研究,；基因點突變及多態(tài)性檢測,。濟南外泌體轉(zhuǎn)錄組學技術(shù)

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