翻譯后修飾蛋白組學(xué)分析:蛋白質(zhì)組學(xué)的研究的工作不只聚焦于細(xì)胞不同生長時(shí)期或是疾病條件下的蛋白質(zhì)表達(dá)水平變化,,許多至關(guān)重要的生命進(jìn)程不只由蛋白質(zhì)相對(duì)豐度控制,更重要的是被時(shí)空特異分布的、可逆的翻譯后修飾所調(diào)控,,因而揭示翻譯后修飾發(fā)生規(guī)律是解析蛋白質(zhì)復(fù)雜多樣的生物功能的一個(gè)重要前提,。蛋白質(zhì)發(fā)生翻譯后修飾時(shí)其分子質(zhì)量會(huì)發(fā)生響應(yīng)的改變,通過質(zhì)譜能夠精確測定蛋白質(zhì)或多肽的分子質(zhì)量,。同時(shí),,發(fā)生翻譯后修飾的蛋白質(zhì)再樣本中含量低且動(dòng)態(tài)范圍廣,所以在質(zhì)譜檢測前需要對(duì)發(fā)生修飾的蛋白質(zhì)或肽段進(jìn)行富集,。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的活性,。北京蛋白質(zhì)氧化修飾組學(xué)主要方式
蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué):血漿蛋白糖基化修飾分析:蛋白質(zhì)糖基化指碳水化合物通過共翻譯或翻譯后修飾的方式附著到蛋白質(zhì)上的過程,是一種常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,。分泌的細(xì)胞外蛋白常被糖基化,,糖基化蛋白通常是重要的整合膜蛋白。血漿中的蛋白質(zhì)包括維持機(jī)體正常生理狀態(tài)的蛋白質(zhì)和機(jī)體分泌,、滲漏,、脫落的蛋白質(zhì),其中不乏存在一些糖基化蛋白質(zhì),。而蛋白質(zhì)糖基化修飾不只影響蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象,、生物活性、運(yùn)輸和定位,,而且在分子識(shí)別,、細(xì)胞通信、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等特定生物過程中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,。因此對(duì)血漿蛋白糖基化進(jìn)行分析,,有助于研究血漿蛋白的生理功能等。四川泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)研究蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的功能,。
蛋白翻譯后修飾:蛋白質(zhì)氨基酸序列的特定位置可以與化學(xué)基團(tuán)或者小分子量的蛋白共價(jià)結(jié)合從而發(fā)生蛋白質(zhì)翻譯后修飾(post-translational modifications,,PTMs)。翻譯后修飾是蛋白質(zhì)生物合成的一個(gè)步驟,,翻譯后多肽鏈在成為成熟的蛋白質(zhì)產(chǎn)品之前要經(jīng)過修飾,,PTMs的類型包括磷酸化、乙?;?、糖基化、泛素化和二硫鍵等等,,它導(dǎo)致蛋白質(zhì)組復(fù)雜性的大幅增加,。對(duì)于任何給定的蛋白質(zhì),各種各樣的PTMs提供了一種通過改變蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能來促進(jìn)細(xì)胞快速變化的方法,。PTMs在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性和周轉(zhuǎn)率,、蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)識(shí)別和相互作用以及空間定位中起著至關(guān)重要的作用。
蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)定量分析:1. SILAC細(xì)胞標(biāo)記,,組織/細(xì)胞破碎,提取,、提純目的蛋白質(zhì)(基于SILAC的乙?;揎椊M學(xué)定量)。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段,。3. 對(duì)多肽片段進(jìn)行iTRAQ標(biāo)記(基于iTRAQ的乙?;揎椊M學(xué)定量)。4. 使用高效特異性乙?;贵w對(duì)乙?;揎楇亩芜M(jìn)行免疫富集。5. 使用LC-MS/MS對(duì)富集的乙?;亩芜M(jìn)行序列分析,。6. 數(shù)據(jù)分析,比對(duì)不同樣本中蛋白乙?;揎椝讲町?,并對(duì)產(chǎn)生變化的生物學(xué)意義進(jìn)行解釋,。常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括磷酸化,。
蛋白質(zhì)磷酸化修飾類型:根據(jù)磷酸氨基酸殘基的不同,可將磷酸化蛋白質(zhì)分為4類,,即O-磷酸鹽蛋白質(zhì),、N-磷酸鹽蛋白質(zhì)、?;姿猁}蛋白質(zhì)和S-磷酸鹽蛋白質(zhì),。1、O-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過羥氨基酸(如絲氨酸,、蘇氨酸或酪氨酸)的磷酸化形成,。2、 N-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過精氨酸,、賴氨酸或組氨酸的磷酸化形成,。3、 ?;姿猁}蛋白質(zhì)通過天冬氨酸或谷氨酸的磷酸化形成,。4、 S-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過半胱氨酸磷酸化形成,。蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法:免疫印跡技術(shù)是在凝膠電泳和固相免疫測定技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的,、根據(jù)特定抗原-抗體的特異性反應(yīng)來檢測復(fù)雜樣品中的某種蛋白質(zhì)的免疫生化分析方法,。蛋白質(zhì)乙酰化修飾,,顧名思義指的就是在蛋白質(zhì)原有基礎(chǔ)上面嫁接上乙?;鶊F(tuán)。貴州棕櫚?;揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)有哪些
蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點(diǎn)分析時(shí)應(yīng)該注意些什么問題,?北京蛋白質(zhì)氧化修飾組學(xué)主要方式
蛋白磷酸化修飾過程:蛋白磷酸化修飾這一過程是通過蛋白激酶催化,將磷酸基團(tuán)從ATP轉(zhuǎn)移到多肽底物的絲氨酸,、蘇氨酸,,或酪氨酸殘基上。并且磷酸化修飾的過程是可逆的,,去磷酸化反應(yīng)由蛋白磷酸酶催化完成,。蛋白磷酸化檢測方法:Western Blot檢測方法:Western Blot是檢測蛋白磷酸化水平的常用方法,主要過程為先利用SDS-PAGE分離蛋白質(zhì),,隨后將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到PVDF膜上,,然后使用特異性識(shí)別磷酸化蛋白的抗體來鑒定目標(biāo)蛋白的磷酸化水平。只有被磷酸化修飾的蛋白才會(huì)在相應(yīng)分子質(zhì)量的地方顯現(xiàn)特異性蛋白條帶,。北京蛋白質(zhì)氧化修飾組學(xué)主要方式
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