蛋白質翻譯后修飾分析策略:早期蛋白質組研究的大部分工作集中在細胞生長的不同時期,或疾病或有絲分裂原刺激后的蛋白質表達水平的變化,。然而,,許多生命過程不只受蛋白質的相對豐度控制,還受時空分布可逆的翻譯后修飾控制,。因此,,揭示翻譯后修飾的規(guī)律是了解蛋白質復雜性和多樣的生物學功能的前提。蛋白質的翻譯后修飾是一個復雜的過程,。目前,,發(fā)現(xiàn)的比較常見的修飾類型是糖基化、泛素化和磷酸化,。樣品中翻譯后修飾蛋白質含量低,、動態(tài)范圍廣給相關研究帶來了很大的挑戰(zhàn)?;诜g后修飾蛋白的異質性和相對豐度低的特點,,主要利用凝膠、生物質譜和生物信息學工具對其進行研究,。用于PTM分析的質譜方法類似于用于“常規(guī)”蛋白質鑒定的方法,,包括自下而上、自中而下和自上而下的蛋白質組學分析,。蛋白磷酸化修飾過程是通過蛋白激酶催化,,將磷酸基團從ATP轉移到多肽底物的絲氨酸、或酪氨酸殘基上,。濟南磷酸化修飾蛋白質組學服務
蛋白質學組翻譯后修飾的類型:翻譯后修飾的類型包括N端fMet或Met的去除,、二硫鍵的形成,、化學修飾和肽鍵的裂解,,其中磷酸化是比較常見的。蛋白質的化學修飾反應是在維持蛋白質的完整性和功能性的基礎上,,通過基于其氨基酸殘基的化學反應獲得新的生物結合物,。翻譯后修飾在哪里發(fā)生,?翻譯后修飾主要發(fā)生在氨基酸側鏈或蛋白質的C端或N端。現(xiàn)有的官能團或新官能團的引入可被用于修飾蛋白質,,以擴展20個標準氨基酸的化學組成,。翻譯后修飾的位點通常帶有可以在化學反應中充當親核試劑的官能團,如絲氨酸,、蘇氨酸和酪氨酸的羥基,;賴氨酸、精氨酸和組氨酸胺形式,;同時,,在蛋白質的N端和C端,天冬酰胺也可作為翻譯后修飾中的一種聚糖連接點,。翻譯后修飾也發(fā)生在氧化的蛋氨酸和側鏈位點的一些亞甲基上,。貴州蛋白質翻譯后修飾組學服務蛋白質翻譯后修飾有什么生物學意義?
質譜分析蛋白翻譯后修飾原理:相較于沒有發(fā)生翻譯后修飾的蛋白,,翻譯后修飾蛋白會在特定肽段序列有分子量的增加,。在蛋白翻譯后修飾方式的質譜分析過程中,蛋白會首先被酶切成肽段,,然后進入質譜進行分析,;通過質譜分析,得到的是一系列肽段的相對分子質量信息,。對于某一個特定的肽段而言,,在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下其序列信息和分子量是確定的,當它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后,,例如磷酸化修飾,,因為磷酸根的分子量也是確定的,所以在質譜檢測過程中如果發(fā)現(xiàn)部分肽段的分子量剛好增加了一個磷酸根的分子量,,則可以假設這個肽段發(fā)生了磷酸化修飾,,再通過二級或多級質譜的譜圖進行二次確認即可實現(xiàn)翻譯后修飾類型鑒定及修飾位點分析等。
蛋白質糖基化修飾組學技術:糖基化是在酶的控制下,蛋白質或脂質附加上糖類的過程,發(fā)生于內質網和高爾基體等部位,。在糖基轉移酶作用下將糖轉移至蛋白質,和蛋白質上的氨基酸殘基共價結合,。蛋白質經過糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化是對蛋白的重要的修飾作用,有調節(jié)蛋白質功能作用,。凝素親和法是目前糖蛋白質組學中應用普遍的分離富集方法,。凝集素(lectin)是一類糖結合蛋白質,能專一識別某一特殊結構的單糖或聚糖中特定的糖基序列而與之結合,,它們與糖鏈可逆非共價結合,,糖蛋白或糖肽被凝集素捕獲之后,通常用特定的單糖通過競爭結合凝集素將糖蛋白或糖肽洗脫下來。蛋白質經過酶解后利用凝集素(lectin)富集N-糖基化肽段,,然后用N-糖酰胺酶(PNGase)在H218O中切除連接在天冬酰胺殘基(Asn)上的糖鏈,。蛋白質磷酸化修飾組學具有全方面性。
蛋白質乙?;揎椊M學定量分析:1. SILAC細胞標記,,組織/細胞破碎,提取,、提純目的蛋白質(基于SILAC的乙?;揎椊M學定量)。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段,。3. 對多肽片段進行iTRAQ標記(基于iTRAQ的乙?;揎椊M學定量)。4. 使用高效特異性乙?;贵w對乙?;揎楇亩芜M行免疫富集。5. 使用LC-MS/MS對富集的乙?;亩芜M行序列分析,。6. 數據分析,比對不同樣本中蛋白乙?;揎椝讲町?,并對產生變化的生物學意義進行解釋。質譜可以分辨蛋白質修飾前和修飾后分子量上的變化,。南京蛋白質丙?;揎椊M學質譜鑒定
蛋白質修飾可檢測修飾類型有磷酸化、糖基化,、乙?;⒎核鼗?、丙?;⒍□,;?、丙二酰化,。濟南磷酸化修飾蛋白質組學服務
翻譯后修飾蛋白組學分析:在蛋白翻譯后修飾方式的鑒定過程中,,蛋白會首先被酶切成肽段,然后進入質譜進行分析,。通過質譜分析,,得到的是一系列肽段的分子質量信息,。對于某一個特定肽段而言,在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下,,其序列信息和分子量是確定的。當它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后,,例如磷酸化修飾,,由于序列信息和分子量是確定的,磷酸根的分子量也是確定的,。在質譜檢測過程中發(fā)現(xiàn)其中的部分肽段的分子量剛好增加了一個磷酸根的分子量,,假設這個肽段就發(fā)生了磷酸化修飾,再通過二級質譜圖進行二次確認,。濟南磷酸化修飾蛋白質組學服務
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