翻譯后修飾蛋白組學(xué)分析:在蛋白翻譯后修飾方式的鑒定過程中,蛋白會首先被酶切成肽段,,然后進(jìn)入質(zhì)譜進(jìn)行分析,。通過質(zhì)譜分析,得到的是一系列肽段的分子質(zhì)量信息,。對于某一個特定肽段而言,在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下,,其序列信息和分子量是確定的,。當(dāng)它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后,,例如磷酸化修飾,由于序列信息和分子量是確定的,,磷酸根的分子量也是確定的。在質(zhì)譜檢測過程中發(fā)現(xiàn)其中的部分肽段的分子量剛好增加了一個磷酸根的分子量,,假設(shè)這個肽段就發(fā)生了磷酸化修飾,再通過二級質(zhì)譜圖進(jìn)行二次確認(rèn),。質(zhì)譜可以分辨蛋白質(zhì)修飾前和修飾后分子量上的變化,。深圳蛋白質(zhì)琥珀酰化修飾組學(xué)方法
蛋白質(zhì)磷酸化修飾定義,?在哺乳動物細(xì)胞生命周期中,大約有1/3的蛋白質(zhì)發(fā)生過磷酸化修飾,,在脊椎動物基因中,約有5%的基因編碼的蛋白質(zhì)是參與磷酸化和去磷酸化過程的蛋白激酶和磷酸酶,。它可以通過激發(fā)、調(diào)節(jié)諸多信號通路進(jìn)而參與調(diào)控生物體的生長,、發(fā)育,、逆境應(yīng)激、疾病發(fā)生等多種生命過程,,一直是生物學(xué)研究的重點與熱點。蛋白磷酸化是指在激酶催化作用下把ATP或者GTP的磷酸基團(tuán)(P04)轉(zhuǎn)移到不同種類的氨基酸上(主要包括絲氨酸S,、蘇氨酸T,、酪氨酸Y),從而使蛋白質(zhì)發(fā)生翻譯后修飾的過程,。四川丙二酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括乙?;?/p>
蛋白質(zhì)翻譯后修飾的檢測方法:質(zhì)譜是蛋白質(zhì)翻譯后修飾檢測的常用技術(shù)之一,,可以用于已知和未知的翻譯后修飾檢測,。蛋白質(zhì)翻譯后修飾(post-translational modifications,PTMs),,如磷酸化,、乙酰化,、泛素化,、SUMO化、糖基化等,,大幅度的增加了蛋白質(zhì)組的復(fù)雜性,。檢測蛋白質(zhì)的翻譯后修飾,了解它們?nèi)绾喂ぷ?、影響蛋白質(zhì)組和調(diào)控基因組將極大地提高我們對遺傳學(xué)和表觀遺傳學(xué)的理解,。目標(biāo)蛋白的PTMs研究通常需要一個富集步驟,因為修飾蛋白的豐度一般較低,。大多數(shù)PTMs檢測方法都是結(jié)合富集策略開發(fā)的,,以比較好的識別、驗證和研究目標(biāo)蛋白中PTMs的功能,。
蛋白質(zhì)翻譯后修飾:蛋白質(zhì)的翻譯后修飾通過可逆的共價鍵將小分子或蛋白質(zhì)與底物蛋白質(zhì)上特定的氨基酸結(jié)合,,調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級結(jié)構(gòu)的變化,。各種蛋白質(zhì)翻譯后修飾在信號通路和網(wǎng)絡(luò)中發(fā)揮著重要的作用,,翻譯后修飾系統(tǒng)的紊亂將導(dǎo)致一系列疾病的發(fā)生。通過實驗的方法鑒定蛋白質(zhì)翻譯后修飾的位點需要耗費大量的資金和時間,,并且酶反應(yīng)的優(yōu)化常常難以實現(xiàn),。而計算的方法則能夠快速、準(zhǔn)確的預(yù)測酶特異性的底物蛋白質(zhì)及其修飾位點,。蛋白質(zhì)有哪些翻譯后修飾,?
蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾的類型:翻譯后修飾的類型包括N端fMet或Met的去除、二硫鍵的形成,、化學(xué)修飾和肽鍵的裂解,,其中磷酸化是比較常見的,。蛋白質(zhì)的化學(xué)修飾反應(yīng)是在維持蛋白質(zhì)的完整性和功能性的基礎(chǔ)上,通過基于其氨基酸殘基的化學(xué)反應(yīng)獲得新的生物結(jié)合物,。翻譯后修飾在哪里發(fā)生,?翻譯后修飾主要發(fā)生在氨基酸側(cè)鏈或蛋白質(zhì)的C端或N端。現(xiàn)有的官能團(tuán)或新官能團(tuán)的引入可被用于修飾蛋白質(zhì),,以擴(kuò)展20個標(biāo)準(zhǔn)氨基酸的化學(xué)組成,。翻譯后修飾的位點通常帶有可以在化學(xué)反應(yīng)中充當(dāng)親核試劑的官能團(tuán),如絲氨酸,、蘇氨酸和酪氨酸的羥基,;賴氨酸、精氨酸和組氨酸胺形式,;同時,,在蛋白質(zhì)的N端和C端,天冬酰胺也可作為翻譯后修飾中的一種聚糖連接點,。翻譯后修飾也發(fā)生在氧化的蛋氨酸和側(cè)鏈位點的一些亞甲基上,。乙酰化修飾是體內(nèi)高度保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾,。南京蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)一般流程
蛋白質(zhì)的翻譯后修飾調(diào)控著底物的酶活性,、功能以及三級結(jié)構(gòu)的變化。深圳蛋白質(zhì)琥珀?;揎椊M學(xué)方法
翻譯后修飾蛋白組:翻譯后修飾蛋白組分析是指在組學(xué)水平上對存在翻譯后修飾的蛋白質(zhì)進(jìn)行分析,。翻譯后修飾蛋白組是指細(xì)胞或組織等整體水平上的翻譯后修飾蛋白。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾(Post Translational Modifications, PTMs)是蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后經(jīng)歷的一個共價加工過程,。蛋白翻譯后修飾通過在一個或多個氨基酸殘基上加修飾基團(tuán)或通過蛋白質(zhì)水解去基團(tuán)而改變蛋白質(zhì)的性質(zhì),,調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的功能。經(jīng)過翻譯后修飾的蛋白質(zhì)稱為翻譯后修飾蛋白,。目前,,已知的蛋白質(zhì)翻譯后修飾主要包括糖基化、磷酸化,、乙?;⒎核鼗?、二硫鍵配對,、甲基化和亞硝基化等等,。深圳蛋白質(zhì)琥珀?;揎椊M學(xué)方法
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