靶向代謝組學(xué):靶向代謝組學(xué)(Targeted Metabolomics)是代謝組學(xué)研究的重要組成部分,也是全代謝組研究的延伸與拓展,。相對于全代謝組分析而言,,靶向代謝組分析具有特異性強,檢測靈敏度高和定量準(zhǔn)確等幾個特點。通過對血液,、尿液或其他體液以及組織中某一特定的代謝物的富集與準(zhǔn)確定量定性分析,,一方面可以結(jié)合其它實驗數(shù)據(jù)揭示相關(guān)的分子生物學(xué)作用機制,另一方面,,也可以為后續(xù)代謝分子標(biāo)志物的深入研究和開發(fā)利用提供有力支持,。靶向代謝組學(xué)可以用于:驗證有非靶向代謝組學(xué)實驗提出的假說;進行基于假說的探索性實驗,,針對特定代謝物,,研究代謝模型。代謝組學(xué)的研究對象與層次有哪些,?哈爾濱植物靶向代謝組學(xué)定性分析
代謝組學(xué)什么類型的樣本更適合,,樣本采集需要注意什么?絕大多數(shù)可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學(xué)研究,。常見的樣本主要有:臨床和動物的血清,、血漿、尿液,、糞便,、各類組織、體液,;細胞和微生物,、培養(yǎng)液和發(fā)酵液;植物的根,、莖,、葉、花等,。代謝每時每刻都在發(fā)生變化,,我們需要研究的是某個或多個瞬時狀態(tài),因此樣本采集一般需要保證“快速,、一致,、簡單”的,采集后通過低溫淬滅(如液氮淬滅或低溫凍存等)的方法阻止離體后的樣本的代謝活動,。另外,不同的檢測要求也需要配合不同的收集方法,,具體步驟請參照譜領(lǐng)生物樣本收集步驟文件,。深圳代謝組學(xué)檢測價格代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(分子量<1000),。
代謝組學(xué)研究方法: 對于代謝產(chǎn)物來說,不只只有質(zhì)譜峰這個特征,。更進一步說,,質(zhì)譜(MS)并不能檢測出所有的代謝產(chǎn)物,,并不是因為質(zhì)譜的靈敏度不夠,而是由于質(zhì)譜只能檢測離子化的物質(zhì),,但有些代謝產(chǎn)物在質(zhì)譜儀中不能被離子化,。采用核磁共振(NMR)的方法,,可以彌補色譜的不足。過去,,只有毒理學(xué)方面的研究使用核磁共振,,而質(zhì)譜只在植物代謝研究中采用。如今,,這兩種方法在代謝組學(xué)研究中已經(jīng)普遍使用。為在不同樣品間進行有意義的比較,,研究人員必須結(jié)合使用這兩種方法獲得的大量數(shù)據(jù)進行分析,。此外,還需要結(jié)合基因組學(xué)研究獲得的數(shù)據(jù),。
靶向代謝組學(xué)分析成功的關(guān)鍵因素是準(zhǔn)確度,、高通量和可靠性。靶向代謝組學(xué)鑒定一般采用 GC/MS 系統(tǒng)的選擇性離子監(jiān)測 (SIM),,或在三重串聯(lián)四極桿 LC/MS 系統(tǒng)上用多反應(yīng)離子監(jiān)測 (MRM) 進行靶向 MS/MS,。SIM 比全掃描圖譜采集具有更高的靈敏度,在單四極桿質(zhì)譜中,這種靈敏度增強的原因是延長了所選擇離子的采集時間,。因為監(jiān)測的是一個很小的質(zhì)量窗口,所以質(zhì)量色譜圖只表示對極為特定質(zhì)量的檢測,。在大多數(shù)情況下,,靈敏度可以提高 10 倍。MRM 是進行質(zhì)譜定量的選擇方法,,與 SIM 相比更為靈敏,、更加特異??梢援a(chǎn)生獨特的碎片離子,,可對非常復(fù)雜基質(zhì)中的目標(biāo)化合物進行監(jiān)測和定量,。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體,、組織代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時間變化的規(guī)律。
代謝組學(xué)有哪些研究方式,?根據(jù)有沒有研究目標(biāo)或方向來確定,在不確定代謝物或者代謝途徑時可使用非靶向代謝組學(xué)尋找切入點,,在有目標(biāo)時則使用靶向定量進行深入研究,,針對性研究脂質(zhì)的則可以使用脂質(zhì)組學(xué)技術(shù)。另外比較新的,,譜領(lǐng)生物還提供基于穩(wěn)定性同位素示蹤技術(shù)的代謝流組學(xué)技術(shù)服務(wù)來研究代謝流量問題,。什么是代謝組學(xué),?代謝組學(xué)是末期發(fā)展起來的一門新興學(xué)科,是研究關(guān)于生物體被擾動后(如基因的改變或環(huán)境變化后)其代謝產(chǎn)物(內(nèi)源性代謝物質(zhì))種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué),。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體,、組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時間變化的規(guī)律,。代謝組學(xué)通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下,生物體的代謝整體的變化軌跡來反映某種生理或病理的一系列發(fā)展過程。代謝組學(xué)關(guān)注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物,。上海GC-MS非靶向代謝組學(xué)費用
代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的一個重要的分支,,與其他組學(xué)相比有著其特有的優(yōu)勢,。哈爾濱植物靶向代謝組學(xué)定性分析
GC-MS非靶向代謝組學(xué)能檢測到哪些類別的代謝物?衍生化極大地拓展了GC/MS的檢測分析范圍,。GC/MS能檢測到有機酸,、氨基酸,、單糖、糖醇,、胺類,、脂肪酸、吲哚,、單甘油酯,、核苷,、二糖、生育酚,、甾醇和膽汁酸等代謝物,。如何提高定性準(zhǔn)確度?GC/MS的定性有雙重標(biāo)準(zhǔn),,一是保留指數(shù),,二是質(zhì)譜信息的相似度(similarity)。不同于LC/MS的軟電離源,,GC/MS使用的EI源屬于硬電離,,能量較強且穩(wěn)定,在將代謝物分子電離后,,分子離子峰進一步碎裂產(chǎn)生豐富的碎片離子,。因此,我們很難在GC/MS上看到分子離子峰,。GC/MS提供的是代謝物的“指紋圖譜”,,將儀器得到的實際指紋圖譜和質(zhì)譜庫(如NIST庫)進行比對后,我們將會得到一個叫相似度的指標(biāo),。保留指數(shù)和相似度都必須滿足設(shè)定的閾值,,軟件才會給出色譜峰的定性結(jié)果。然后采用標(biāo)準(zhǔn)品質(zhì)譜信息進行完全比對定性,,也就是說只有經(jīng)過標(biāo)準(zhǔn)品比對,,代謝物才是被100%定性,。哈爾濱植物靶向代謝組學(xué)定性分析
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