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南京4D定量蛋白質(zhì)組學分析價格

來源: 發(fā)布時間:2022-04-05

蛋白質(zhì)組學:質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組學的基本原理主要是通過測定被測樣品離子的理化性質(zhì)來進行分析,,根據(jù)樣品的質(zhì)量譜圖和相關(guān)信息從而得到定性和定量結(jié)果。目前,,蛋白質(zhì)組學質(zhì)譜分析一般是根據(jù)保留時間(retentiontime),、質(zhì)荷比(m/z)、離子強度(intensity)這三個維度對肽蛋白質(zhì)進行鑒定和定量,,即3D蛋白質(zhì)組學,。4D蛋白質(zhì)組學在3D蛋白質(zhì)組學的基礎之上增加了第四維度,離子淌度(mobility),,主要根據(jù)離子的形狀和截面對離子進行分離,,能夠區(qū)分m/z差值非常小的肽段,,使低豐度蛋白信號能夠被區(qū)分和識別出來。4D蛋白質(zhì)組學基于timsTOFPro質(zhì)譜儀,,結(jié)合PASEF(ParallelAccumulationSerialFragmentation,,同步累積連續(xù)碎裂)與TIMS(TrappedIonMobilitySpectrometry,離子遷移譜),,可重復測量所有檢測離子的碰撞截面(CCS),,能更快、更靈敏的進行蛋白質(zhì)組定性和定量,。蛋白質(zhì)組學技術(shù)有電噴霧質(zhì)譜,。南京4D定量蛋白質(zhì)組學分析價格

定量蛋白質(zhì)組學技術(shù):定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)主要分為標記(label)和非標記(labelfree)定量策略,標記策略又分為體內(nèi)標記和體外標記兩種,。細胞內(nèi)蛋白質(zhì)組豐度的動態(tài)變化對各種生命過程有重要影響,。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進程中,常常伴隨著某些蛋白質(zhì)的表達異常,。定量蛋白質(zhì)組學就是把一個基因組表達的全部蛋白質(zhì)或一個復雜的混合體系中所有的蛋白質(zhì)進行精確的定量和鑒定,。非標記(labelfree)的定量蛋白組學技術(shù),Labelfree定量蛋白組學技術(shù)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對蛋白質(zhì)酶解肽段進行質(zhì)譜分析,,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標簽做內(nèi)部標準,,只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),比較不同樣品中相應肽段的信號強度,,從而對肽段對應的蛋白質(zhì)進行相對定量,。上海TMT/iTRAQ標記定量蛋白質(zhì)組學研究方法通過對正常個體及病理個體間的蛋白質(zhì)組比較分析,我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質(zhì)分子”,。

定量蛋白質(zhì)組學技術(shù):定量蛋白質(zhì)組學是蛋白質(zhì)組研究的重要內(nèi)容,,通過對基因表達產(chǎn)物——蛋白質(zhì)的定量分析,以了解基因在不同的生理,、病理和逆境條件下的表達情況,。近年來,隨著非凝膠技術(shù)的發(fā)展,,蛋白質(zhì)組學(“Shotgun”proteomics)技術(shù),,特別是多維蛋白質(zhì)鑒定(MultidimensionalProteinIdentification,MudPIT)已成為研究復雜生物樣本中大規(guī)模蛋白質(zhì)表達和定性和定量分析的強有力工具,。蛋白質(zhì)組學在醫(yī)學的研究應用:蛋白質(zhì)組學是研究細胞,、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位,、變化及其相互作用規(guī)律的科學,。

我們究竟怎么研究蛋白質(zhì)組學呢?目前高通量檢測蛋白質(zhì)的方法中,,還是首推基于質(zhì)譜的方法,,納流液相可以將復雜樣品中的肽段高效地分離,,然后依次進入質(zhì)譜,對每個被離子化的肽段及其碎裂后碎片的荷質(zhì)比進行分析,,從而得到該肽段的序列信息,,然后根據(jù)對應的色譜峰面積或者報告離子強度等信息,我們又可以得到該肽段的定量信息,。蛋白組學研究怎么做?當下蛋白組學研究中應用比較普遍的技術(shù)是同位素標記定量(iTRAQ/TMT技術(shù)),。iTRAQ/TMT技術(shù)是利用DDA掃描模式,,其掃描的方式是將一級質(zhì)譜信號比較強的Top20的多肽進行二級打碎,然后進入二級質(zhì)譜進行檢測,。其優(yōu)勢是二級譜圖采集的肽段信息都來源于同一條多肽,,有利于后續(xù)的定性分析。蛋白質(zhì)組學技術(shù)的本質(zhì)(從分析化學角度來看),,就是對蛋白質(zhì)的定性定量分析。

PRM靶向蛋白質(zhì)組學:產(chǎn)品分類:a.相對定量(目的同WB),。b.一定定量(目的同Elisa),。技術(shù)優(yōu)勢:(1)無需抗體,,可直接對樣本中目標蛋白質(zhì)進行定量分析,。(2)高特異性、準確度和靈敏度,,靶向檢測目標蛋白對應的多個unique肽段,。(3)通量高,可以同時實現(xiàn)幾十個蛋白的定量檢測,。樣本要求:動物及臨床組織標本100mg/sample,,血清、血漿200μL/sample,,細胞,、微生物1×107cells/sample。應用方向:驗證修飾和非修飾定量蛋白組學結(jié)果,;目標蛋白相對定量和一定定量分析。蛋白質(zhì)組學屬于后基因組時代的科學研究,,針對基因表達產(chǎn)物進行檢測與定量,。定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)主要分為標記(label)和非標記(label free)定量策略。上海TMT/iTRAQ標記定量蛋白質(zhì)組學研究方法

蛋白質(zhì)組學在應用中,,更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息,。南京4D定量蛋白質(zhì)組學分析價格

蛋白組究竟研究的是什么呢,?第1,蛋白質(zhì)定性,,或者說大規(guī)模檢測某些蛋白質(zhì)是否存在于樣品當中,;第2,蛋白質(zhì)定量,,也就是大規(guī)模檢測某些蛋白質(zhì)的含量(包括一定含量與相對含量),;第3,蛋白質(zhì)翻譯后修飾,,這些修飾主要包括磷酸化,,泛素化,糖基化,,乙?;鹊龋舶▽@些翻譯后修飾的定量研究,。這三大塊中所提到的大規(guī)模,,既可以是樣品數(shù)量的大規(guī)模高通量,也可以是少量樣本中蛋白數(shù)量的大規(guī)模高通量,。研究原因:首先,,由于翻譯調(diào)控和翻譯后調(diào)控的存在,RNA的表達量與實際對應蛋白質(zhì)的含量相關(guān)性并不高,,就簡單地測試了酵母中mRNA和對應蛋白質(zhì)的定量相關(guān)性,,結(jié)果是,低豐度蛋白與mRNA的相關(guān)性尤其低,,而高豐度蛋白和其mRNA的相關(guān)性則高,,經(jīng)過平均后r值只為0.4。南京4D定量蛋白質(zhì)組學分析價格