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代謝組學(xué)有哪些研究方式?根據(jù)有沒有研究目標(biāo)或方向來確定,,在不確定代謝物或者代謝途徑時(shí)可使用非靶向代謝組學(xué)尋找切入點(diǎn),,在有目標(biāo)時(shí)則使用靶向定量進(jìn)行深入研究,針對性研究脂質(zhì)的則可以使用脂質(zhì)組學(xué)技術(shù),。另外比較新的,,譜領(lǐng)生物還提供基于穩(wěn)定性同位素示蹤技術(shù)的代謝流組學(xué)技術(shù)服務(wù)來研究代謝流量問題。什么是代謝組學(xué),?代謝組學(xué)是末期發(fā)展起來的一門新興學(xué)科,,是研究關(guān)于生物體被擾動(dòng)后(如基因的改變或環(huán)境變化后)其代謝產(chǎn)物(內(nèi)源性代謝物質(zhì))種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué),。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體,、組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時(shí)間變化的規(guī)律。代謝組學(xué)通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下,,生物體的代謝整體的變化軌跡來反映某種生理或病理的一系列發(fā)展過程,。代謝組學(xué)的研究處于生物信息流的中游。山東植物靶向代謝組學(xué)質(zhì)譜鑒定
代謝組學(xué)有哪些特點(diǎn),?(1) 代謝處于系統(tǒng)生物學(xué)的末端,,更能反映基因與外部環(huán)境互作的真實(shí)情況,因此,,在多數(shù)生物表型研究上更加適用,。(2) 常規(guī)代謝組學(xué)只關(guān)注內(nèi)源性化合物,也有使用代謝組學(xué)技術(shù)測定外源性化合物的,。內(nèi)源性化合物的上調(diào)和下調(diào)指示了與疾病,、毒性,、基因修飾或環(huán)境因子的影響。(3) 高通量定量和定性研究生物小分子化合物,。(4) 內(nèi)源性化合物的結(jié)果可以作為疾病的診斷,、藥物篩選或者其他分型評估等潛在生物標(biāo)志物。謝組學(xué)通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下,,生物體的代謝整體的變化軌跡來反映某種生理或病理的一系列發(fā)展過程,。貴州代謝組學(xué)定性分析代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于功能基因組學(xué)。
什么是代謝組學(xué),?代謝組學(xué)是用來解決什么問題的,?代謝組學(xué)(Metabonomics/Metabolomics)是發(fā)展起來的一門新興學(xué)科,是研究關(guān)于生物體被擾動(dòng)后(如基因的改變或環(huán)境變化后)其代謝產(chǎn)物(內(nèi)源性代謝物質(zhì))種類,、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué),。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體、組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時(shí)間變化的規(guī)律,。代謝組學(xué)通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來反映某種病理生理過程中所發(fā)生的一系列生物事件,。
靶向代謝組學(xué)分析成功的關(guān)鍵因素是準(zhǔn)確度、高通量和可靠性,。靶向代謝組學(xué)鑒定一般采用 GC/MS 系統(tǒng)的選擇性離子監(jiān)測 (SIM),,或在三重串聯(lián)四極桿 LC/MS 系統(tǒng)上用多反應(yīng)離子監(jiān)測 (MRM) 進(jìn)行靶向 MS/MS。SIM 比全掃描圖譜采集具有更高的靈敏度,,在單四極桿質(zhì)譜中,這種靈敏度增強(qiáng)的原因是延長了所選擇離子的采集時(shí)間,。因?yàn)楸O(jiān)測的是一個(gè)很小的質(zhì)量窗口,所以質(zhì)量色譜圖只表示對極為特定質(zhì)量的檢測,。在大多數(shù)情況下,,靈敏度可以提高 10 倍。MRM 是進(jìn)行質(zhì)譜定量的選擇方法,,與 SIM 相比更為靈敏,、更加特異??梢援a(chǎn)生獨(dú)特的碎片離子,,可對非常復(fù)雜基質(zhì)中的目標(biāo)化合物進(jìn)行監(jiān)測和定量。在食品安全領(lǐng)域,,利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動(dòng)植物體內(nèi)的相關(guān)生物標(biāo)志物也是一個(gè)熱點(diǎn)領(lǐng)域,。
什么是非靶向代謝組學(xué)、靶向代謝組學(xué),?(1) 非靶向代謝組學(xué)(Untargeted metabolomics)即非目標(biāo)代謝組學(xué)或發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué),,無偏向性地對所有小分子代謝物(一般相對分子量小于1000)同時(shí)進(jìn)行檢測分析的代謝組學(xué)。(2) 靶向代謝組學(xué)(Trgeted metabolomics)則為目標(biāo)性代謝組學(xué),,著重對于設(shè)定好的目標(biāo)代謝物進(jìn)行定性,、量檢測分析和研究,。相比于其他組學(xué),代謝組學(xué)有哪些特殊的優(yōu)勢,?系統(tǒng)生物學(xué)有基因組學(xué),、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)和代謝組學(xué),。代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的一個(gè)重要的分支,與其他組學(xué)相比有著其特有的優(yōu)勢,,主要體現(xiàn)在以下幾點(diǎn):(1) 基因與蛋白質(zhì)表達(dá)的微小變化會(huì)在相應(yīng)代謝物水平上得到放大,,更容易被檢測。(2) 代謝物的種類要遠(yuǎn)小于基因和蛋白的數(shù)目,。(3) 可與生物表型變化建立直接相關(guān)性,。代謝組學(xué)與臨床化學(xué)較為相似。濟(jì)南靶向代謝組學(xué)技術(shù)分析
非靶向代謝組學(xué)無偏向性地對所有小分子代謝物(一般相對分子量小于1000),。山東植物靶向代謝組學(xué)質(zhì)譜鑒定
代謝組學(xué)尿液樣本收集:1)取空腹晨尿,、中段尿(臨床)或晨間1 h尿(動(dòng)物)于50 mL離心管中;2)4 ℃ 下10000 rpm離心10 min取上清,,用1.5 mL離心管分裝,,保存于-80 ℃。3)動(dòng)物1 h尿量不夠的情況下,,可分多次收集尿液,;如需收取24 h尿液,需要使用帶低溫裝置的代謝籠收集,,并且及時(shí)凍存樣本,。4)收集完尿液樣本后,建議使用液氮淬滅15 min后,,再分裝多管后于-80 ℃凍存,。組織樣本收集:動(dòng)物組織(包括腦、心,、肝,、脾、肺,、腎,、肌肉和皮膚等;軟體動(dòng)物如血吸蟲):1)取適量組織,,用預(yù)冷的PBS緩沖液或生理鹽水清洗干凈,;2)迅速剝?nèi)シ潜匦璧闹竞徒Y(jié)締組織,再用PBS緩沖液或生理鹽水沖洗干凈,;3)用干凈的無塵吸水紙吸干水分,,將組織分成50-100 mg / 管分裝待用,;4)管子上做好標(biāo)記后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min,-80 ℃凍存,;干冰運(yùn)輸,。山東植物靶向代謝組學(xué)質(zhì)譜鑒定