代謝組學(xué)的研究對象與層次有哪些,?一般來說,,代謝組學(xué)關(guān)注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。根據(jù)研究的對象和目的不同,,科學(xué)家將生物體系的代謝產(chǎn)物分析分為4個層次:代謝物靶標(biāo)分析:某一個或幾個特定組分的定性和定量分析,,如某一類結(jié)構(gòu)、性質(zhì)相關(guān)的化合物(氨基酸,、有機酸,、順二醇類)或者某一代謝途徑的所有中間產(chǎn)物或多條代謝途徑的標(biāo)志性組分。代謝物指紋分析:同時對多個代謝物進行分析,,不分離鑒定具體單一組分。代謝輪廓分析:限定條件下對生物體內(nèi)特定組織內(nèi)的代謝產(chǎn)物的快速定性和半定量分析,。代謝組分析:對生物體或體內(nèi)某一特定組織所包含的所有代謝物的定量分析,,并研究該代謝物組在外界干預(yù)或病理生理條件下的動態(tài)變化規(guī)律。代謝組學(xué)關(guān)注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物,。杭州個性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法
代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,,代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性,、特性和規(guī)律,,目前據(jù)此目標(biāo)相距甚遠(yuǎn)。盡管充滿了挑戰(zhàn),,研究人員仍然堅信,,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。疾病導(dǎo)致機體病理生理過程變化,,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,,通過對某些代謝產(chǎn)物進行分析,并與正常人的代謝產(chǎn)物比較,,尋找疾病的生物標(biāo)記物,,將提供一種較好的疾病診斷方法。杭州個性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法代謝組學(xué)主要技術(shù)手段是質(zhì)譜(MS),。
代謝組學(xué)比較常用到的數(shù)據(jù)分析方法:代謝組學(xué)分析數(shù)據(jù)用于統(tǒng)計分析時,,數(shù)據(jù)集通常為一個N × K的矩陣(X矩陣),N表示N個樣本數(shù),,每一行表示一個樣品,, K表示K個變量,每一列表示一個變量,,在代謝組學(xué)中變量通常是指代謝物含量,。單變量分析方法只分別分析單個變量,不考慮多個變量的相互作用與內(nèi)在聯(lián)系,。具有簡單性,、易應(yīng)用性和可解釋性。但是無法基于整體數(shù)據(jù)對所測樣品的優(yōu)劣,、差異進行綜合評價和分析,。差異倍數(shù)變化大小(Fold Change,,F(xiàn)C)表示實驗組與對照組的含量比值,,可以快速考察各個代謝物在不同組別之間的含量變化大小。
代謝組學(xué)什么類型的樣本更適合,,樣本采集需要注意什么,?絕大多數(shù)可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學(xué)研究。常見的樣本主要有:臨床和動物的血清,、血漿,、尿液、糞便,、各類組織,、體液;細(xì)胞和微生物,、培養(yǎng)液和發(fā)酵液,;植物的根、莖、葉,、花等,。代謝每時每刻都在發(fā)生變化,我們需要研究的是某個或多個瞬時狀態(tài),,因此樣本采集一般需要保證“快速,、一致、簡單”的,,采集后通過低溫淬滅(如液氮淬滅或低溫凍存等)的方法阻止離體后的樣本的代謝活動,。另外,不同的檢測要求也需要配合不同的收集方法,,具體步驟請參照譜領(lǐng)生物樣本收集步驟文件,。代謝組學(xué)在食品安全領(lǐng)域,利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動植物體內(nèi)的相關(guān)生物標(biāo)志物也是一個熱點領(lǐng)域,。
藥物代謝和代謝組學(xué)區(qū)別:代謝組學(xué)與藥物代謝不同是它關(guān)注的對象不是外源性的藥物而是生物體本身就有的內(nèi)源性代謝物,。這些代謝物是糖,脂肪,,蛋白質(zhì),,核酸,膽汁酸等等代謝得到的,。還有共生菌代謝的,,是一個龐大的混合物。目的是通過樣本的對比,,發(fā)現(xiàn)潛在標(biāo)志物,,指導(dǎo)疾病早期診斷甚至基因水平的研究。而藥物代謝的目標(biāo)是只要只要追蹤到這種藥物分子在體內(nèi)變化就好,,相當(dāng)具有靶向性,,因此使用的技術(shù)手段就是LC-MS。檢測藥物的中間體,,和具體的藥效,,藥代動的效應(yīng)。LC-MS非靶向代謝組的優(yōu)勢有什么,?杭州個性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法
代謝組學(xué)是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分,。杭州個性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法
LC-MS非靶向代謝組學(xué):LC-MS非靶向代謝組學(xué)通過液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS)方法檢測生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動態(tài)變化,重點尋找在實驗組和對照組中有明顯變化的代謝物,,進而研究這些代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系,其研究對象大都是分子量1500Da以內(nèi)的小分子物質(zhì),。LC-MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢:1,、較高的靈敏度、分辨率;2,、較寬的動態(tài)范圍,;3、適合于生物樣本中復(fù)雜代謝產(chǎn)物的檢測和潛在標(biāo)志物的鑒定,;4,、適合對標(biāo)本中未知代謝物的探索研究。杭州個性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法