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山東動物靶向代謝組學(xué)分析研究

來源: 發(fā)布時間:2022-04-10

代謝組學(xué)可以檢測的樣品種類有哪些,?代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(分子量<1000),。其樣品主要是血漿或血清,,尿液,,唾液,,以及細(xì)胞和組織的提取液,。我們也和一些公司或單位(如茶葉公司,、制酒公司,、酸奶公司,、醫(yī)院等)合作,,做過植物,微生物提取物,,腦脊液,,昆蟲血淋巴,羊水,,卵泡液,,膝蓋滑液,眼淚,,胎盤,,糞便及腸道內(nèi)容物提取液等。一般代謝組學(xué)能檢測出多少物質(zhì),?不同的質(zhì)譜平臺靈敏度及偏向性都不一樣,,而且不同平臺之間具有互補(bǔ)性。一般來說GC/MS檢測血清樣品能準(zhǔn)確定性的物質(zhì)約200個左右,,檢測尿液樣品定性的物質(zhì)約200個左右,,其他樣品(如肝臟,糞便,,腸道內(nèi)容物)也在幾百這個數(shù)量級,。代謝組學(xué)主要技術(shù)手段是色譜(HPLC,,GC)。山東動物靶向代謝組學(xué)分析研究

為什么選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段,?1)小分子的產(chǎn)生和代謝是生物機(jī)體作用的結(jié)果,,生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接,更準(zhǔn)確的反映生物體的病理生理狀態(tài),。2)基因和蛋白質(zhì)表達(dá)的有效微小變化會在代謝物上得到放大,,從而使檢測更容易;3)代謝組學(xué)的代謝物信息庫簡單,,但它遠(yuǎn)沒有全基因組測序及大量表達(dá)序列標(biāo)簽的數(shù)據(jù)庫那么復(fù)雜,;4)代謝物的種類少,要遠(yuǎn)小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù),,物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)要簡單得多,。5)代謝產(chǎn)物在各個生物體系中都是類似的,所以代謝組學(xué)研究中采用的技術(shù)更容易在各個領(lǐng)域中通用,,也更容易被人接受,。杭州個性化定制靶向代謝組學(xué)定量分析代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似,通常有兩種方法,。

代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,, 代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性,、特性和規(guī)律,,目前據(jù)此目標(biāo)相距甚遠(yuǎn)。盡管充滿了挑戰(zhàn),,研究人員仍然堅(jiān)信,,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密,。疾病導(dǎo)致機(jī)體病理生理過程變化,,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,通過對某些代謝產(chǎn)物進(jìn)行分析,,并與 正常人的代謝產(chǎn)物比較,,尋找疾病的生物標(biāo)記物,將提供一種較好的疾病診斷方法,。

代謝組學(xué)的概念:代謝組學(xué)的概念來源于代謝組,,代謝組是指某一生物或細(xì)胞在一特定生理時期內(nèi)所有的低分子量代謝產(chǎn)物,代謝組學(xué)則是對某一生物或細(xì)胞在一特定生理時期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物同時進(jìn)行定性和定量分析的一門新學(xué)科,。它是以組群指標(biāo)分析為基礎(chǔ),,以高通量檢測和數(shù)據(jù)處理為手段,以信息建模與系統(tǒng)整合為目標(biāo)的系統(tǒng)生物學(xué)的一個分支,。 代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000),。 在食品安全領(lǐng)域,,利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動植物體內(nèi)的相關(guān)生物標(biāo)志物也是一個熱點(diǎn)領(lǐng)域。其樣品主要是動植物的細(xì)胞和組織的提取液,。主要技術(shù)手段是核磁共振,,質(zhì)譜,色譜,,其中以NMR為主,。通過檢測一系列樣品的NMR 譜圖,再結(jié)合模式識別方法,,可以判斷出生物體的病理生理狀態(tài),,并有可能找出與之相關(guān)的生物標(biāo)志物。為相關(guān)預(yù)警信號提供一個預(yù)知平臺,。選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段的優(yōu)勢有哪些,?

靶向代謝組學(xué)分析成功的關(guān)鍵因素是準(zhǔn)確度、高通量和可靠性,。靶向代謝組學(xué)鑒定一般采用 GC/MS 系統(tǒng)的選擇性離子監(jiān)測 (SIM),,或在三重串聯(lián)四極桿 LC/MS 系統(tǒng)上用多反應(yīng)離子監(jiān)測 (MRM) 進(jìn)行靶向 MS/MS。SIM 比全掃描圖譜采集具有更高的靈敏度,,在單四極桿質(zhì)譜中,這種靈敏度增強(qiáng)的原因是延長了所選擇離子的采集時間,。因?yàn)楸O(jiān)測的是一個很小的質(zhì)量窗口,所以質(zhì)量色譜圖只表示對極為特定質(zhì)量的檢測,。在大多數(shù)情況下,,靈敏度可以提高 10 倍,。MRM 是進(jìn)行質(zhì)譜定量的選擇方法,,與 SIM 相比更為靈敏、更加特異,??梢援a(chǎn)生獨(dú)特的碎片離子,可對非常復(fù)雜基質(zhì)中的目標(biāo)化合物進(jìn)行監(jiān)測和定量,。代謝組學(xué)的研究介于基因,、蛋白質(zhì)和細(xì)胞、組織之間,。廣州LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)費(fèi)用

代謝組學(xué)是對某一生物或細(xì)胞中相對分子量小于1,000的小分子代謝產(chǎn)物進(jìn)行定性和定量分析的一門新學(xué)科,。山東動物靶向代謝組學(xué)分析研究

代謝組學(xué)有哪些特點(diǎn)?(1) 代謝處于系統(tǒng)生物學(xué)的末端,,更能反映基因與外部環(huán)境互作的真實(shí)情況,,因此,在多數(shù)生物表型研究上更加適用,。(2) 常規(guī)代謝組學(xué)只關(guān)注內(nèi)源性化合物,,也有使用代謝組學(xué)技術(shù)測定外源性化合物的,。內(nèi)源性化合物的上調(diào)和下調(diào)指示了與疾病、毒性,、基因修飾或環(huán)境因子的影響,。(3) 高通量定量和定性研究生物小分子化合物。(4) 內(nèi)源性化合物的結(jié)果可以作為疾病的診斷,、藥物篩選或者其他分型評估等潛在生物標(biāo)志物,。謝組學(xué)通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下,生物體的代謝整體的變化軌跡來反映某種生理或病理的一系列發(fā)展過程,。山東動物靶向代謝組學(xué)分析研究