什么是非靶向代謝組學(xué),、靶向代謝組學(xué),?(1) 非靶向代謝組學(xué)(Untargeted metabolomics)即非目標代謝組學(xué)或發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué),,無偏向性地對所有小分子代謝物(一般相對分子量小于1000)同時進行檢測分析的代謝組學(xué),。(2) 靶向代謝組學(xué)(Trgeted metabolomics)則為目標性代謝組學(xué),著重對于設(shè)定好的目標代謝物進行定性,、量檢測分析和研究,。相比于其他組學(xué),代謝組學(xué)有哪些特殊的優(yōu)勢,?系統(tǒng)生物學(xué)有基因組學(xué),、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)和代謝組學(xué),。代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的一個重要的分支,,與其他組學(xué)相比有著其特有的優(yōu)勢,,主要體現(xiàn)在以下幾點:(1) 基因與蛋白質(zhì)表達的微小變化會在相應(yīng)代謝物水平上得到放大,更容易被檢測,。(2) 代謝物的種類要遠小于基因和蛋白的數(shù)目,。(3) 可與生物表型變化建立直接相關(guān)性。代謝組學(xué)主要研究的是產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000),。河南植物靶向代謝組學(xué)分析鑒定
代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,,是要涉及研究每一個代謝組分的共性,、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標相距甚遠,。盡管充滿了挑戰(zhàn),,研究人員仍然堅信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密,。疾病導(dǎo)致機體病理生理過程變化,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,,通過對某些代謝產(chǎn)物進行分析,,并與正常人的代謝產(chǎn)物比較,尋找疾病的生物標記物,,將提供一種較好的疾病診斷方法,。廣州LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)費用代謝組學(xué)是一個相當(dāng)有效率的研究工具。
代謝組學(xué)概念:代謝組學(xué)(metabonomics/metabolomics)是效仿基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想,,對生物體內(nèi)所有代謝物進行定量分析,,并尋找代謝物與生理病理變化的相對關(guān)系的研究方式,是系統(tǒng)生物學(xué)的組成部分,。其研究對象大都是相對分子質(zhì)量1000以內(nèi)的小分子物質(zhì),。先進分析檢測技術(shù)結(jié)合模式識別和專家系統(tǒng)等計算分析方法是代謝組學(xué)研究的基本方法。 代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)之后新近發(fā)展起來的一門學(xué)科,,是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分,。基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分別從基因和蛋白質(zhì)層面探尋生命的活動,,而實際上細胞內(nèi)許多生命活動是發(fā)生在代謝物層面的,,如細胞信號釋放(cell signaling),能量傳遞,,細胞間通信等都是受代謝物調(diào)控的,。代謝組學(xué)正是研究代謝組(metabolome)——在某一時刻細胞內(nèi)所有代謝物的組合——的一門學(xué)科。
代謝組學(xué)(英語:metabolomics)是對細胞,,生物流體,,組織或生物體內(nèi)的小分子(通常稱為代謝物,,metabolites)的大規(guī)模研究。 這些小分子及其在生物系統(tǒng)中的相互作用統(tǒng)稱為代謝組,。能夠?qū)ι飿颖局械拇x物進行全方面分析的一項新興技術(shù),,被定義為代謝組學(xué)技術(shù)。代謝組學(xué)是在后基因組學(xué)時代興起的一門跨領(lǐng)域?qū)W科,,其主要目標是定量的研究生命體對外界刺激,、病理生理變化、以及本身基因突變而產(chǎn)生的其體內(nèi)代謝物水平的多元動態(tài)反應(yīng),。之后得到迅速發(fā)展并滲透到多項領(lǐng)域,,比如疾病診斷、醫(yī)藥研制開發(fā),、營養(yǎng)食品科學(xué),、毒理學(xué)、環(huán)境學(xué),,植物學(xué)等與人類健康護理密切相關(guān)的領(lǐng)域,。靶向代謝組學(xué)(Trgeted metabolomics)則為目標性代謝組學(xué)。
非靶向代謝組學(xué):新陳代謝網(wǎng)絡(luò)是復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò),,特別是人體的代謝網(wǎng)絡(luò),,一直被認為是相對復(fù)雜的代謝網(wǎng)絡(luò)。現(xiàn)在多數(shù)信號通路的研究是集中在代謝網(wǎng)絡(luò)的一個很小的領(lǐng)域,?;蚪M學(xué)、蛋白組學(xué)研究已經(jīng)揭示了部分調(diào)節(jié)通路,,但是和代謝網(wǎng)絡(luò)直接相關(guān)的是代謝產(chǎn)物,。從多種代謝產(chǎn)物中選取研究對象,無疑是困難的,。非靶向代謝組學(xué)又稱為發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué),,主要是將對照組和實驗組的代謝組(某一生物體的全部代謝物)進行比對,以找出其代謝物的差異,。代謝組學(xué)研究通過一定的手段能夠幫助研究員從代謝產(chǎn)物海中跳出來,,提供一個“航拍”的視角,從而發(fā)現(xiàn)差異性代謝產(chǎn)物,。然后通過已知的代謝通路逆推找出調(diào)節(jié)酶和基因,,完成疾病發(fā)病機制、藥物療理機制等方面的研究,。代謝組學(xué)是研究關(guān)于生物體被擾動后其代謝產(chǎn)物種類,、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué)。南京GC-MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)服務(wù)
與其他“組學(xué)”研究相比,,代謝組學(xué)的費用更低,。河南植物靶向代謝組學(xué)分析鑒定
代謝組學(xué)樣本收集植物組織:葉片,、莖、花:1)取整片葉片/一段莖/一朵花,,放入離心管或錫箔紙中并標記,,迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)將裝有樣本的離心管迅速放入自封袋中(每組一袋),,在自封袋中放入標簽紙注明樣本信息,。3)迅速放入-80 ℃冰箱凍存。足量干冰寄送,。注意:(1)采集葉片樣本時,,在中午光照好的時間收集。(2)采集樣本時保持樣本一致性,,尤其是同一組樣本(顏色、衰老程度,、葉脈占比,、光照、位置等),。根:1)取整株植物的根部,,迅速用PBS緩沖液或者超純水漂洗掉根上的泥土、培養(yǎng)基或營養(yǎng)液等,;2)吸水紙吸干水分后,,分裝為500 mg/管;3)標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min,,-80 ℃凍存,,干冰寄送。河南植物靶向代謝組學(xué)分析鑒定