蛋白質組學有什么用,，能給我實驗帶來什么,？可以大規(guī)模鑒定特定組織、細胞等各種樣本的蛋白質種類,、修飾狀態(tài)以及蛋白質之間的相互作用,，以及對這些蛋白質功能分析、分類,；可以對不同條件下某一特定樣本進行大規(guī)模的蛋白質(包括翻譯后修飾蛋白)表達量變化分析,，篩選潛在biomarker，篩選重要信號通路,；依托大樣本量,，可以實現(xiàn)疾病的分子分型分析、重要潛在靶標鑒定,。質譜的蛋白質組學和芯片哪個更好出結果,？若有對應物種的全基因組并有預測的全蛋白序列庫，可優(yōu)先選擇全蛋白序列庫,；若無全蛋白序列庫,，有對應物種對應組織的轉錄組測序結果并，可以使用轉錄組的測序結果（mRNA三框翻譯或者預測CDS，并翻譯成氨基酸序列）,；若基因組,、轉錄組數(shù)據(jù)庫都沒有，優(yōu)先選擇同源性比較接近的物種的全蛋白數(shù)據(jù)庫,，若近源物種沒有合適的全蛋白庫,，則選擇更大的蛋白全庫（如動物全庫、綠色植物全庫,、微生物庫等）,。蛋白質組學為農(nóng)業(yè)作物的進一步開發(fā)利用提供巨大的參考價值。江蘇外泌體蛋白質組學應用

蛋白質組學介紹：蛋白質組學,，指對某一基因組所表達的所有蛋白質及其特征進行大規(guī)模,、系統(tǒng)化地研究，以期望在蛋白質水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網(wǎng)絡,。研究的內(nèi)容主要包括：組成蛋白質一級結構氨基酸的序列特征,、蛋白質的豐度、蛋白質活性,、蛋白質的修飾,、亞細胞定位和三維結構、蛋白質之間的相互作用以及對蛋白質的高階復合物結構,。蛋白質組主要通過蛋白質雙向電泳,、氨基酸序列測定、質譜,、生物信息等方法，研究某個基因組對應的所有蛋白質特征,，包括蛋白質含量,、亞細胞定位、活性以及蛋白修飾等內(nèi)容,。江蘇TMT／iTRAQ標記定量蛋白質組學檢測多少錢蛋白質組意指“一種基因組所表達的全套蛋白質”,，即包括一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。

蛋白質組學技術：飛行時間質譜：MALDI的基本原理是將分析物分散在基質分子（尼古丁酸及其同系物）中并形成晶體,，當用激光（337nm的氮激光）照射晶體時,，基質分子吸收激光能量，樣品解吸附,，基質-樣品之間發(fā)生電荷轉移使樣品分子電離,。它從固相標本中產(chǎn)生離子，并在飛行管中測定其分子量,，MALDI-TOF-MS一般用于肽質量指紋圖譜,，非常快速（每次分析只需3~5min），靈敏（達到fmol水平）,，可以精確測量肽段質量,，但是如果在分析前不修飾肽段，MALDI-TOF-MS不能給出肽片段的序列,。

蛋白質組學的重要應用領域有：在臨床疾病中的應用,、在微生物蛋白質組學中的應用、在植物研究中的應用,、在腎臟病學領域的應用,。我們通過研究蛋白質組，可以為患者提供有用的疾病診斷,、預后評估信息,；可以早期更為準確的診斷出胰腺病,；也可以為AD的診斷,、治理藥物的設計和篩選奠定基礎。這項研究技術其實離我們生活非常近,，對我們生命而言尤為重要,。近年來，高通量蛋白質分離與鑒定技術,，如雙向電泳,、生物質譜、蛋白質芯片,、酵母雙雜交系統(tǒng),、生物信息學等相繼建立并日趨完善，加速了蛋白質組學的發(fā)展,。Label Free 非標記定量蛋白質組學技術處理步驟簡單,，成本低。

常規(guī)蛋白質組學：Labelfree多肽組學：顧名思義,，就是不使用任何標記方法,，直接對肽段進行質譜鑒定和定性定量分析。實驗流程簡單,，只需要對蛋白進行常規(guī)酶解和除鹽步驟即可上機,。定量方式分為兩種：峰面積（Peakintensity）和峰計數(shù)（Spectralcount），常用的是峰面積,。不過,，由于質譜采集時只選取topN的母離子進行二級碎裂和MS2檢測，所以會丟失一些豐度較低的肽段信息,，缺失值比較多,。TMT/iTRAQ標記定量蛋白組學：TMT全稱是TandemMassTag,，是經(jīng)典化學標記試劑，普遍用于差異表達蛋白質組分析研究中,。該技術采用6重,、10重或16重同位素標簽，與肽段的氨基發(fā)生共價結合反應,，可實現(xiàn)同時對6個/10個/16個不同樣品中蛋白質的定性和定量分析,。（目前16標鹿明生物可提供技術服務）。蛋白質組的概念指由一個基因組,，或一個細胞,、組織表達的所有蛋白質。哈爾濱4D定量蛋白質組學研究方法

DIA 定量蛋白質組學是高通量,，能同時監(jiān)測所有目標蛋白,。江蘇外泌體蛋白質組學應用

蛋白質組學技術：電噴霧質譜：ESI-MS是利用高電場使質譜進樣端的毛細管柱流出的液滴帶電，在N2氣流的作用下,，液滴溶劑蒸發(fā),，表面積縮小，表面電荷密度不斷增加,，直至產(chǎn)生的庫侖力與液滴表面張力達到雷利極限,，液滴爆裂為帶電的子液滴，這一過程不斷重復使液滴非常細小呈噴霧狀,，這時液滴表面的電場非常強大,，使分析物離子化并以帶單電荷或多電荷的離子形式進入質量分析器。ESI-MS從液相中產(chǎn)生離子,，一般說來,，肽段的混合物經(jīng)過液相色譜分離后，經(jīng)過偶聯(lián)的與在線連接的離子阱質譜分析,，給出肽片段的精確的氨基酸序列,但是分析時間一般較長,。目前，許多實驗室兩種質譜方法連用,，獲得有意義的蛋白質的肽段序列，設計探針或引物來獲得有意義的基因,。隨著蛋白質組研究的深入,，又有多種新型質譜儀出現(xiàn)，主要是在上述質譜儀的基礎上進行改進與重新組合,。江蘇外泌體蛋白質組學應用