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LC-MS非靶向代謝組學(xué):LCMS非靶向是通過液質(zhì)聯(lián)用(LC–MS)方法檢測生物體受擾動或刺激前后大量代謝產(chǎn)物的動態(tài)變化,,從中找出表達(dá)差異的代謝物,,進(jìn)而闡明生物體代謝相關(guān)過程的代謝組學(xué)技術(shù)。LCMS非靶向代謝組學(xué)適用于分析難揮發(fā)或熱穩(wěn)定性差的代謝產(chǎn)物,,具有高通量,、高分辨率,、高靈敏度的特點。超高壓液相色譜或超高效液相色譜(UPLC)通過采用更小粒徑的色譜填料配合更高的壓力,,實現(xiàn)了更好的分離,,具體包括更高的分離能力、更快的分離速度以及更好的靈敏度,;串聯(lián)質(zhì)譜儀在MS掃描模式下,,可實現(xiàn)高低碰撞能量快速切換,同時采集代謝物的一二級質(zhì)譜信息,,結(jié)合代謝組學(xué)數(shù)據(jù)處理軟件對質(zhì)譜信息的解析,,在單次分析中可檢測和鑒定幾百至幾千種代謝物。代謝組學(xué)與臨床化學(xué)較為相似,。四川靶向代謝組學(xué)定性分析
代謝組學(xué)的研究領(lǐng)域有哪些,?1、疾病機制研究,。2,、疾病診斷與防治。3,、新藥篩選和開發(fā),。4、藥物作用機制的研究,。5,、藥物毒性評價。6,、植物的細(xì)胞代謝組學(xué)研究,。7、微生物代謝組學(xué)研究,。代謝組能夠檢測到的代謝物含量是多少,?不同檢測平臺的靈敏度不一樣,靈敏度比較高,,可達(dá)到fM級,。另外,,相同含量的不同物質(zhì),由于自身化學(xué)性質(zhì)不同,,質(zhì)譜的離子化效率,、信號響應(yīng)強度會差異很大。物質(zhì)的檢測靈敏度跟自身的化學(xué)性質(zhì)有關(guān),,化學(xué)性質(zhì)的影響主要表現(xiàn)在離子化效率和質(zhì)譜碎裂行為兩方面,。因此,相同含量的不同物質(zhì),,可能一個能檢測出來,,另一個檢測不出來。四川靶向代謝組學(xué)定性分析與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,,代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,。
為什么選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段?1)小分子的產(chǎn)生和代謝是生物機體作用的結(jié)果,,生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接,,更準(zhǔn)確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。2)基因和蛋白質(zhì)表達(dá)的有效微小變化會在代謝物上得到放大,,從而使檢測更容易,;3)代謝組學(xué)的代謝物信息庫簡單,但它遠(yuǎn)沒有全基因組測序及大量表達(dá)序列標(biāo)簽的數(shù)據(jù)庫那么復(fù)雜,;4)代謝物的種類少,,要遠(yuǎn)小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù),物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)要簡單得多,。5)代謝產(chǎn)物在各個生物體系中都是類似的,,所以代謝組學(xué)研究中采用的技術(shù)更容易在各個領(lǐng)域中通用,也更容易被人接受,。
代謝組學(xué)的研究領(lǐng)域有哪些,?1、疾病機制研究,;2,、疾病診斷與防治;3,、新藥篩選和開發(fā),;4、藥物作用機制的研究,;5,、藥物毒性評價;6、植物的細(xì)胞代謝組學(xué)研究,;7,、微生物代謝組學(xué)研究。代謝組學(xué)的研究方法:代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似,,通常有兩種方法,。一種方法稱作代謝物指紋分析,采用液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS)的方法,,比較不同血樣中各自的代謝產(chǎn)物以確定其中所有的代謝產(chǎn)物,。從本質(zhì)上來說,,代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產(chǎn)物的質(zhì)譜峰,,了解不同化合物的結(jié)構(gòu),建立一套完備的識別這些不同化合物特征的分析方法,。另一種方法是代謝輪廓分析,,研究人員假定了一條特定的代謝途徑,并對此進(jìn)行更深入的研究,。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似,,通常有兩種方法。
代謝組學(xué)的研究分為靶向和非靶向,。通俗說就是你有沒有目標(biāo)分子,。傳統(tǒng)代謝組學(xué)研究利用的是GC-MS,因為代謝物大多數(shù)都不是高沸點的,,而且GC-MS有龐大的數(shù)據(jù)庫檢索,。然后發(fā)展的LC-MS差不多,就是克服了一些高沸點物質(zhì)難以檢測的弊端,。NMR用于代謝組學(xué)不是很多,,一方面是NMR這個東西入行起點有點高,另一方面是樣品太復(fù)雜而且靈敏度不高,。但是NMR樣品處理簡單,,無損。不需要各種衍生化,。而且NMR對于物質(zhì)結(jié)構(gòu)的指認(rèn)要比MS更精確(比如異構(gòu)體)因此對定性非常有用,,成為非靶向代謝組學(xué)的重要方法。代謝組學(xué)可與生物表型變化建立直接相關(guān)性,。廣東常規(guī)靶向代謝組學(xué)方法
代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分,,在臨床醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有普遍的應(yīng)用前景。四川靶向代謝組學(xué)定性分析
代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,,代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,,是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律,,目前據(jù)此目標(biāo)相距甚遠(yuǎn),。盡管充滿了挑戰(zhàn),,研究人員仍然堅信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密,。疾病導(dǎo)致機體病理生理過程變化,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,,通過對某些代謝產(chǎn)物進(jìn)行分析,,并與正常人的代謝產(chǎn)物比較,尋找疾病的生物標(biāo)記物,,將提供一種較好的疾病診斷方法,。四川靶向代謝組學(xué)定性分析