蛋白質(zhì)組學(xué)：質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組學(xué)的基本原理主要是通過(guò)測(cè)定被測(cè)樣品離子的理化性質(zhì)來(lái)進(jìn)行分析，根據(jù)樣品的質(zhì)量譜圖和相關(guān)信息從而得到定性和定量結(jié)果,。目前,，蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析一般是根據(jù)保留時(shí)間（retentiontime）、質(zhì)荷比（m/z）,、離子強(qiáng)度（intensity）這三個(gè)維度對(duì)肽蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定和定量，即3D蛋白質(zhì)組學(xué),。4D蛋白質(zhì)組學(xué)在3D蛋白質(zhì)組學(xué)的基礎(chǔ)之上增加了第四維度,，離子淌度（mobility），主要根據(jù)離子的形狀和截面對(duì)離子進(jìn)行分離,，能夠區(qū)分m/z差值非常小的肽段,，使低豐度蛋白信號(hào)能夠被區(qū)分和識(shí)別出來(lái)。4D蛋白質(zhì)組學(xué)基于timsTOFPro質(zhì)譜儀,，結(jié)合PASEF（ParallelAccumulationSerialFragmentation,，同步累積連續(xù)碎裂）與TIMS（TrappedIonMobilitySpectrometry，離子遷移譜）,，可重復(fù)測(cè)量所有檢測(cè)離子的碰撞截面（CCS）,，能更快、更靈敏的進(jìn)行蛋白質(zhì)組定性和定量,。定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)主要分為標(biāo)記（label）和非標(biāo)記（label free）定量策略,。濟(jì)南外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用

蛋白質(zhì)組學(xué)基礎(chǔ)研究方面：近兩年來(lái)蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學(xué)領(lǐng)域，如細(xì)胞生物學(xué),、神經(jīng)生物學(xué)等,。在研究對(duì)象上，覆蓋了原核微生物、真核微生物,、植物和動(dòng)物等范圍,，涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象，如信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),、細(xì)胞分化,、蛋白質(zhì)折疊等等。在未來(lái)的發(fā)展中,，蛋白質(zhì)組學(xué)的研究領(lǐng)域?qū)⒏悠毡?。?yīng)用研究方面：蛋白質(zhì)組學(xué)將成為尋找疾病分子標(biāo)記和藥物靶標(biāo)比較有效的方法之一。在對(duì)早老性癡呆等人類(lèi)重大疾病的臨床診斷和治理方面蛋白質(zhì)組技術(shù)也有十分誘人的前景,，目前國(guó)際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)方面的應(yīng)用性研究,。外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)研究?jī)?nèi)容蛋白質(zhì)組的復(fù)雜性也遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于基因組，這是因?yàn)橐粋€(gè)基因≠一個(gè)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物≠一個(gè)蛋白質(zhì),。

定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法學(xué)介紹：Label-free：Label-free定量,，即非標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué)，不需要對(duì)比較樣本做特定標(biāo)記處理,，只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應(yīng)信號(hào)便可得到樣品間蛋白表達(dá)量的變化,，通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。Label-free定量不需要標(biāo)記處理,，操作簡(jiǎn)單,，可以做任意樣本的總蛋白質(zhì)差異定量，但對(duì)實(shí)驗(yàn)操作的穩(wěn)定性,、重復(fù)性要求較高,，準(zhǔn)確性也較標(biāo)記定量差,。因此,，Label-free技術(shù)適合于大樣本量的定量比較，以及對(duì)無(wú)法用標(biāo)記定量實(shí)現(xiàn)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),。

蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)學(xué)的研究應(yīng)用：蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)是研究細(xì)胞,、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位,、變化及其相互作用規(guī)律的科學(xué),。labelfree-非標(biāo)定量法分析技術(shù)方法：非標(biāo)定量法[Labelfree]是近年來(lái)重要的質(zhì)譜定量方法，通過(guò)比較質(zhì)譜分析次數(shù)或質(zhì)譜峰強(qiáng)度,，分析不同來(lái)源樣品蛋白的數(shù)量變化,。蛋白質(zhì)非標(biāo)記定量技術(shù)（LabelFree）是通過(guò)液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析，無(wú)需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn),，只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),，比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號(hào)強(qiáng)度，從而對(duì)肽段對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)進(jìn)行相對(duì)定量。蛋白質(zhì)組的研究能為生命活動(dòng)規(guī)律提供物質(zhì)基礎(chǔ),。

蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用領(lǐng)域：1.蛋白質(zhì)鑒定：能夠應(yīng)用一維電泳和二維電泳并分離相關(guān)的技術(shù),，應(yīng)用蛋白質(zhì)芯片和抗體芯片及共沉淀等技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)停止審定研討。2.修飾：很多mRNA表達(dá)產(chǎn)生的蛋白質(zhì)要閱歷后修飾如磷酸化,，糖基化,，酶原刺激等。修飾是蛋白質(zhì)調(diào)理功用的重要方式,，因而對(duì)蛋白質(zhì)后修飾的研討對(duì)說(shuō)明蛋白質(zhì)的功用具有重要作用,。3、蛋白質(zhì)功用：如剖析酶活性和酶底物,，細(xì)胞因子的生物剖析/配基-受體分離剖析,。能夠應(yīng)用基因敲除和反義技術(shù)剖析基因表達(dá)產(chǎn)物-蛋白質(zhì)的功用。另外對(duì)蛋白質(zhì)表達(dá)出來(lái)后在細(xì)胞內(nèi)的定位研討也在水平上有助于蛋白質(zhì)功用的理解,。近兩年來(lái)蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學(xué)領(lǐng)域,。濟(jì)南外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用

定量蛋白質(zhì)組學(xué)通過(guò)對(duì)蛋白質(zhì)的定量分析，以了解基因在不同的生理,、病理和逆境條件下的表達(dá)情況,。濟(jì)南外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)：等電聚焦：等電聚焦（isoelectricfocusing，IEF）是一種利用有pH梯度的介質(zhì)分離等電點(diǎn)不同的蛋白質(zhì)的電泳技術(shù),。等電聚焦凝膠電泳依據(jù)蛋白質(zhì)分子的靜電荷或等電點(diǎn)進(jìn)行分離,，等電聚焦中，蛋白質(zhì)分子在含有載體兩性電解質(zhì)形成的一個(gè)連續(xù)而穩(wěn)定的線性pH梯度中電泳,。載體兩性電解質(zhì)是脂肪族多氨基多羧酸,，在電場(chǎng)中形成正極為酸性，負(fù)極為堿性的連續(xù)的pH梯度,。蛋白質(zhì)分子在偏離其等電點(diǎn)的pH條件下帶有電荷,，因此可以在電場(chǎng)中移動(dòng)；當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)遷移至其等電點(diǎn)位置時(shí),，其靜電荷數(shù)為零,，在電場(chǎng)中不再移動(dòng)，據(jù)此將蛋白質(zhì)分離,。濟(jì)南外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用