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深圳代謝組學(xué)主要技術(shù)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-05-20

LC-MS非靶向代謝組學(xué):LC-MS非靶向代謝組學(xué)通過液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS)方法檢測生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動(dòng)態(tài)變化,重點(diǎn)尋找在實(shí)驗(yàn)組和對照組中有明顯變化的代謝物,,進(jìn)而研究這些代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系,,其研究對象大都是分子量1500Da以內(nèi)的小分子物質(zhì)。LC-MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢:1,、較高的靈敏度,、分辨率;2,、較寬的動(dòng)態(tài)范圍;3,、適合于生物樣本中復(fù)雜代謝產(chǎn)物的檢測和潛在標(biāo)志物的鑒定,;4、適合對標(biāo)本中未知代謝物的探索研究。代謝組學(xué)主要技術(shù)手段是質(zhì)譜(MS),。深圳代謝組學(xué)主要技術(shù)

代謝組學(xué)的研究對象與層次有哪些,?一般來說,代謝組學(xué)關(guān)注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物,。根據(jù)研究的對象和目的不同,,科學(xué)家將生物體系的代謝產(chǎn)物分析分為4個(gè)層次:代謝物靶標(biāo)分析:某一個(gè)或幾個(gè)特定組分的定性和定量分析,如某一類結(jié)構(gòu),、性質(zhì)相關(guān)的化合物(氨基酸,、有機(jī)酸、順二醇類)或者某一代謝途徑的所有中間產(chǎn)物或多條代謝途徑的標(biāo)志性組分,。代謝物指紋分析:同時(shí)對多個(gè)代謝物進(jìn)行分析,,不分離鑒定具體單一組分。代謝輪廓分析:限定條件下對生物體內(nèi)特定組織內(nèi)的代謝產(chǎn)物的快速定性和半定量分析,。代謝組分析:對生物體或體內(nèi)某一特定組織所包含的所有代謝物的定量分析,,并研究該代謝物組在外界干預(yù)或病理生理?xiàng)l件下的動(dòng)態(tài)變化規(guī)律。南京代謝組學(xué)技術(shù)分析為什么選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段,?

代謝組學(xué)檢測的手段有哪些,?主要技術(shù)手段是核磁共振(NMR ),液-質(zhì)聯(lián)用(LC-MS),,氣-質(zhì)聯(lián)用(GC-MS),,色譜(HPLC,GC)等,。通過檢測一系列樣品的譜圖,,再結(jié)合化學(xué)模式識別方法,可以判斷出生物體的病理生理狀態(tài),,基因的功能,,藥物的毒性和藥效等,并有可能找出與之相關(guān)的生物標(biāo)志物(biomarker),。代謝組學(xué)可以檢測哪些樣品,?代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000)。其樣品主要是尿液,,血漿或血清,,唾液,以及細(xì)胞和組織的提取液,。我們也做過植物,,微生物提取物,腦脊液昆蟲血淋巴,,羊水,,卵泡液,,膝蓋滑液,眼淚,,糞便及腸道內(nèi)容物提取液等,。

如何獲得高質(zhì)量GC/MS代謝組學(xué)數(shù)據(jù)?實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)先不談,,在儀器分析階段,,若想獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù),有以下幾個(gè)方面需要注意,。1)前處理方法的一致性,。不同實(shí)驗(yàn)人員操作方式不盡相同。因此,,一個(gè)項(xiàng)目應(yīng)當(dāng)只由一個(gè)人負(fù)責(zé)前處理,。推薦使用自動(dòng)衍生設(shè)備,以減少人為的誤差,。2)檢測之前需確保儀器處于比較好工作狀態(tài),。儀器的控制軟件都有系統(tǒng)自檢功能,可以快速便捷地核查質(zhì)譜儀器的狀態(tài),。但更重要的是氣相色譜狀態(tài),,推薦使用一組混標(biāo)作為儀器質(zhì)控。在每一個(gè)項(xiàng)目開始之前,,先進(jìn)行質(zhì)控樣檢測,,確認(rèn)氣相色譜的分離度和質(zhì)譜的整體響應(yīng)。3)后期數(shù)據(jù)矯正,,特別是對于大樣本項(xiàng)目,。我們可以在檢測序列中加入隨行質(zhì)控樣本(每個(gè)樣品取少量后混合),在后期數(shù)據(jù)處理時(shí),,使用質(zhì)控樣本結(jié)合如LOESS之類的算法對整體數(shù)據(jù)進(jìn)行矯正,。非靶向代謝組學(xué)(Untargeted metabolomics)即非目標(biāo)代謝組學(xué)或發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué)。

靶向代謝組學(xué)分析成功的關(guān)鍵因素是準(zhǔn)確度,、高通量和可靠性,。靶向代謝組學(xué)鑒定一般采用 GC/MS 系統(tǒng)的選擇性離子監(jiān)測 (SIM),或在三重串聯(lián)四極桿 LC/MS 系統(tǒng)上用多反應(yīng)離子監(jiān)測 (MRM) 進(jìn)行靶向 MS/MS,。SIM 比全掃描圖譜采集具有更高的靈敏度,,在單四極桿質(zhì)譜中,這種靈敏度增強(qiáng)的原因是延長了所選擇離子的采集時(shí)間。因?yàn)楸O(jiān)測的是一個(gè)很小的質(zhì)量窗口,,所以質(zhì)量色譜圖只表示對極為特定質(zhì)量的檢測,。在大多數(shù)情況下,靈敏度可以提高 10 倍,。MRM 是進(jìn)行質(zhì)譜定量的選擇方法,,與 SIM 相比更為靈敏,、更加特異,??梢援a(chǎn)生獨(dú)特的碎片離子,可對非常復(fù)雜基質(zhì)中的目標(biāo)化合物進(jìn)行監(jiān)測和定量,。代謝組學(xué)的研究介于基因,、蛋白質(zhì)和細(xì)胞、組織之間,。上海動(dòng)物靶向代謝組學(xué)服務(wù)

非靶向代謝組學(xué)重點(diǎn)在于比較實(shí)驗(yàn)組和對照組,,發(fā)現(xiàn)尋找其種具有明顯的變化的代謝物質(zhì)。深圳代謝組學(xué)主要技術(shù)

代謝組學(xué)可以檢測的樣品種類有哪些,?代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(分子量<1000),。其樣品主要是血漿或血清,尿液,,唾液,,以及細(xì)胞和組織的提取液。我們也和一些公司或單位(如茶葉公司,、制酒公司,、酸奶公司、醫(yī)院等)合作,,做過植物,,微生物提取物,腦脊液,,昆蟲血淋巴,,羊水,卵泡液,,膝蓋滑液,,眼淚,胎盤,,糞便及腸道內(nèi)容物提取液等,。一般代謝組學(xué)能檢測出多少物質(zhì)?同的質(zhì)譜平臺靈敏度及偏向性都不一樣,,而且不同平臺之間具有互補(bǔ)性,。一般來說GC/MS檢測血清樣品能準(zhǔn)確定性的物質(zhì)約200個(gè)左右,檢測尿液樣品定性的物質(zhì)約200個(gè)左右,,其他樣品(如肝臟,,糞便,腸道內(nèi)容物)也在幾百這個(gè)數(shù)量級,。如果采用全二維GC/MS,,物質(zhì)的數(shù)量要更多,,可達(dá)1千以上。LC/MS檢測物質(zhì)的數(shù)量要遠(yuǎn)比GC/MS多,,但能準(zhǔn)確定性和定量的不多,,視不同的平臺(TQ、QTOF等)能達(dá)到幾十至2-3百個(gè)物質(zhì),。深圳代謝組學(xué)主要技術(shù)