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南京修飾蛋白組學

來源: 發(fā)布時間:2022-05-25

蛋白組學常見研究模式主要有兩種:1.通過蛋白質組學尋找疾病發(fā)生的發(fā)展的新型標志物;2.結合其它組學建立疾病或者研究主題的表達譜和分子機制,。蛋白質組學( proteomics) 是指系統(tǒng)研究某一基因組所表達的所有蛋白質,,包括組成蛋白質一級結構的氨基酸序列,蛋白質的豐度,,蛋白質的修飾以及蛋白質之間的相互作用。蛋白質組和基因組( genome)在概念上有相關性,表示某一個蛋白質組的蛋白質是由基因組所編碼的,,然而蛋白質組學和基因組學在研究對象和研究方法上有很大的區(qū)別,。蛋白質組學的分析主要指蛋白的生信分析,依賴于數(shù)據庫的建立,。南京修飾蛋白組學

蛋白質組學描述: 蛋白質組(proteome):一種細胞,、組織或生物體完整基因組所對應的全套蛋白質。蛋白質組學(proteomics):研究細胞,、組織或生物體中蛋白質組成,、變化、定位及相互作用規(guī)律的科學,。蛋白質譜技術: 蛋白質譜技術是蛋白質鑒定分析的主要支撐技術,,它通過測定樣品離子的質荷比(m/z) 來進行成分和結構分析。高靈敏度,,精確度,;能同時提供樣品的精確分子量和結構信息;既可用于定性分析,,也可用于定量分析,。標記定量技術原理: 在一級質譜圖中,任何一種iTRAQ/TMT試劑標記不同樣本中的同一蛋白質表現(xiàn)為相同的質荷比,; 在二級質譜圖中,,報告離子表現(xiàn)為不同質荷比的峰,因此根據波峰的高度及面積,,可以鑒定出蛋白質和分析出同一蛋白質不同處理的定量信息,。四川常規(guī)蛋白質組學方法蛋白質組學的研究主要促進分子醫(yī)學的發(fā)展。

定量N-糖基化蛋白質組學:蛋白質的N-糖基化位點修飾是重要的蛋白質翻譯后修飾之一,,主要在復雜的多細胞或組織形成過程中起關鍵作用,。蛋白質的N-糖基化修飾位點具有保守的氨基酸序列NX(S/T)(其中X為除脯氨酸以外的其它氨基酸)凝集素親和法是目前糖蛋白質組學中應用普遍的分離富集方法。凝集素(lectin)是一類糖結合蛋白質,,能專一識別某一特殊結構的單糖或聚糖中特定的糖基序列而與之結合,,它們與糖鏈可逆非共價結合,糖蛋白或糖肽被凝集素捕獲之后,,通常用特定的單糖通過競爭結合凝集素將糖蛋白或糖肽洗脫下來,。蛋白質經過酶解后利用lectin 富集 N- 糖基化肽段,然后用 N- 糖酰胺酶(PNGase)在 H218O 中切除連接在天冬酰胺殘基(Asn)上的糖鏈,。

蛋白組究竟研究原因:首先,,由于翻譯調控和翻譯后調控的存在,RNA的表達量與實際對應蛋白質的含量相關性并不高,,就簡單地測試了酵母中mRNA和對應蛋白質的定量相關性,,結果是,低豐度蛋白與mRNA的相關性尤其低,,而高豐度蛋白和其mRNA的相關性則高,,經過平均后r值只為0.4,。蛋白質組學相關技術目前在一小部分]應用中具有獨特優(yōu)勢。蛋白組究竟研究的是什么呢,?第1,,蛋白質定性,或者說大規(guī)模檢測某些蛋白質是否存在于樣品當中,;第2,,蛋白質定量,也就是大規(guī)模檢測某些蛋白質的含量(包括一定含量與相對含量),;第3,,蛋白質翻譯后修飾,這些修飾主要包括磷酸化,,泛素化,,糖基化,乙?;鹊?,也包括對這些翻譯后修飾的定量研究。蛋白質組研究有助于了解蛋白的結構,、細胞的功能,、生命的本質及活動規(guī)律。

常用的定量蛋白質組學技術方法有以下幾類:非標記(labelfree)的定量蛋白組學技術:Label free定量蛋白組學技術是通過液質聯(lián)用技術對蛋白質酶解肽段進行質譜分析,,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標簽做內部標準,,只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質時所產生的質譜數(shù)據,比較不同樣品中相應肽段的信號強度,,從而對肽段對應的蛋白質進行相對定量。TMT定量蛋白組學技術:這種技術采用多個(2-10)穩(wěn)定同位素標簽,,特異性標記多肽的氨基基團進行串聯(lián)質譜分析,,能夠同時比較多達10種不同樣本中蛋白質的相對含量,可用于研究不同病理條件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質表達水平的差異,。蛋白質組學研究是生命科學進入后基因時代的特征,。哈爾濱4D定量蛋白質組學主要技術

Label Free 非標記定量蛋白質組學技術處理步驟簡單,成本低,。南京修飾蛋白組學

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