泛素化修飾PRM定量驗證:原理: 泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾,。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解,。此外,,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,調(diào)控包括細胞周期,、細胞凋亡,、轉錄調(diào)控、DNA 損傷修復以及免疫應答等在內(nèi)的多種細胞活動,。首先對泛素化的蛋白進行胰酶消化,,在賴氨酸的修飾位點上會產(chǎn)生兩個甘氨酸的殘基(K-GG),利用對泛素化賴氨酸(K-GG)具有高親和力的基序抗體,,特異性富集復雜樣本中的泛素化肽段,,結合LC-MS/MS蛋白質(zhì)定量方法,實現(xiàn)大規(guī)模泛素化蛋白質(zhì)定性定量分析,。蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學是什么,?哈爾濱蛋白質(zhì)丙二酰化修飾組學
蛋白翻譯后修飾位點鑒定:蛋白質(zhì)翻譯后修飾(Post-Translational Modifications, PTMs)幾乎參與了細胞所有正常生命活動的過程,,并發(fā)揮十分重要的調(diào)控作用,。蛋白質(zhì)修飾位點能夠影響蛋白的多種屬性,包括蛋白質(zhì)折疊,、活性以及之后的功能,,對于蛋白質(zhì)修飾位點的發(fā)現(xiàn)及研究對闡明蛋白質(zhì)的功能具有重要作用。技術特點:時間快,,周期短,;識別位點準確,采用高分辨率質(zhì)譜技術可以準確定位到發(fā)生修飾的氨基酸位點,。適用范圍:已知蛋白序列,;明確翻譯后修飾的類型。湖北蛋白質(zhì)糖基化修飾組學研究磷酸化修飾蛋白質(zhì)組的研究主要集中于真核生物中普遍存在的絲氨酸,、蘇氨酸和酪氨酸的磷酸化,。
定量磷酸化蛋白質(zhì)翻譯修飾組學:蛋白質(zhì)發(fā)生磷酸化是重要的翻譯后修飾,它與信號傳導,、細胞周期,、生長發(fā)育機理等諸多生物學問題有密切關系。研究蛋白質(zhì)磷酸化對闡明蛋白質(zhì)功能具有重要意義,。將磷酸化肽段TiO2富集技術和iTRAQ/TMT/Lable free技術相結合,,實現(xiàn)對磷酸化蛋白質(zhì)組學的定量研究,。技術原理:在磷酸化肽段富集前先進行 iTRAQ/TMT 標記,然后通過 TiO2 富集方法獲得高純度的磷酸化肽段,,之后結合高分辨率質(zhì)譜完成對樣品的定量分析,。
泛素化修飾蛋白質(zhì)組學有些什么?泛素化可以生產(chǎn)出單泛素化或多泛素化蛋白質(zhì),。后者在當7個賴氨酸殘基的泛素與另一個泛素的甘氨酸C端連接形成,。這種泛素分子鏈接在生物過程中起到重要的作用。共價結合泛素的蛋白質(zhì)能被蛋白酶識別并降解,,這是細胞內(nèi)短壽命蛋白質(zhì)和一些異常蛋白降解的普遍途徑,。泛素化及類泛素化蛋白在細胞分裂,自噬,,DNA修復,,免疫應答,細胞消亡等方面同樣起到關鍵作用,。與消化道內(nèi)進行的蛋白質(zhì)水解不同,,從泛素與蛋白的結合到將蛋白水解成小的肽段,整個水解過程需要能量參與,。人們開始意識到泛素-蛋白酶系統(tǒng)是一個對于真核細胞非常重要的調(diào)節(jié)系統(tǒng),。磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學是原核生物和真核生物中比較重要的調(diào)控修飾形式。
定量N-糖基化蛋白質(zhì)翻譯修飾組學:蛋白質(zhì)的N-糖基化位點修飾是重要的蛋白質(zhì)翻譯后修飾之一,,主要在復雜的多細胞或組織形成過程中起關鍵作用,。蛋白質(zhì)的N-糖基化修飾位點具有保守的氨基酸序列NX(S/T)(其中X為除脯氨酸以外的其它氨基酸)凝集素親和法是目前糖蛋白質(zhì)組學中應用普遍的分離富集方法。凝集素(lectin)是一類糖結合蛋白質(zhì),,能專一識別某一特殊結構的單糖或聚糖中特定的糖基序列而與之結合,,它們與糖鏈可逆非共價結合,糖蛋白或糖肽被凝集素捕獲之后,,通常用特定的單糖通過競爭結合凝集素將糖蛋白或糖肽洗脫下來,。蛋白質(zhì)翻譯后修飾PTMs通常包括磷酸化,糖基化,,泛素化,,亞硝基化,甲基化,,乙?;|(zhì)化和蛋白水解,。蛋白質(zhì)琥珀?;揎椊M學主要方式
蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學的特征,雖然具有挑戰(zhàn)性,,但提供了對病因學過程下的細胞功能的無價的洞察,。哈爾濱蛋白質(zhì)丙二?;揎椊M學
泛素化修飾蛋白質(zhì)組學的介紹:泛素由76個氨基酸組成,高度保守,,普遍存在于真核細胞內(nèi),,故名泛素。泛素化是可逆的,,依賴ATP并且通過泛素刺激酶E1,,泛素結合酶E2,泛素連接酶E3一系列催化反應所致,。這些特殊的酶包括泛素酶,結合酶,、連結酶和降解酶等,。泛素化在蛋白質(zhì)的定位、代謝,、功能,、調(diào)節(jié)和降解中都起著十分重要的作用。同時,,它也參與了細胞周期,、增殖、凋亡,、分化,、轉移、基因表達,、轉錄調(diào)節(jié),、信號傳遞、損傷修復,、炎癥免疫等幾乎一切生命活動的調(diào)控,。泛素化、心血管等疾病的發(fā)病密切相關,。因此,,作為近年來生物化學研究的一個重大成果,它已然成為研究,、開發(fā)新藥物的新靶點,。哈爾濱蛋白質(zhì)丙二酰化修飾組學