代謝組學(xué)研究方法: 對(duì)于代謝產(chǎn)物來說,不只只有質(zhì)譜峰這個(gè)特征,。更進(jìn)一步說,,質(zhì)譜(MS)并不能檢測(cè)出所有的代謝產(chǎn)物,,并不是因?yàn)橘|(zhì)譜的靈敏度不夠,,而是由于質(zhì)譜只能檢測(cè)離子化的物質(zhì),,但有些代謝產(chǎn)物在質(zhì)譜儀中不能被離子化,。采用核磁共振(NMR)的方法,,可以彌補(bǔ)色譜的不足。過去,,只有毒理學(xué)方面的研究使用核磁共振,,而質(zhì)譜只在植物代謝研究中采用,。如今,這兩種方法在代謝組學(xué)研究中已經(jīng)普遍使用,。為在不同樣品間進(jìn)行有意義的比較,,研究人員必須結(jié)合使用這兩種方法獲得的大量數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。此外,,還需要結(jié)合基因組學(xué)研究獲得的數(shù)據(jù)。代謝產(chǎn)物是基因表達(dá)的產(chǎn)物,,在代謝酶的作用下生成,。山東LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)服務(wù)
代謝組學(xué)介紹:通過液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS)方法檢測(cè)生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動(dòng)態(tài)變化,重點(diǎn)尋找在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組中有明顯變化的代謝物,,進(jìn)而研究這些代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系,,其研究對(duì)象大多是分子量1500Da以內(nèi)的小分子物質(zhì)。技術(shù)優(yōu)勢(shì):較高的靈敏度,、分辨率,;較寬的動(dòng)態(tài)范圍;適合對(duì)標(biāo)本中未知代謝物的探索研究,;適合于生物樣本中復(fù)雜代謝產(chǎn)物的檢測(cè)和潛在標(biāo)志物的鑒定,。代謝組學(xué)應(yīng)用方向: 土壤代謝組學(xué)。研究土壤中有機(jī)質(zhì)及土壤微生物代謝含量變化及相互作用,,了解土壤微生物多樣性及其碳代謝能力,,為探索調(diào)節(jié)、控制和改善土壤環(huán)境質(zhì)量提供重要的參考,。山東LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)服務(wù)代謝組學(xué)是要涉及研究每一個(gè)代謝組分的共性,、特性和規(guī)律。
LC-MS非靶向代謝組學(xué):LCMS非靶向是通過液質(zhì)聯(lián)用(LC–MS)方法檢測(cè)生物體受擾動(dòng)或刺激前后大量代謝產(chǎn)物的動(dòng)態(tài)變化,,從中找出表達(dá)差異的代謝物,,進(jìn)而闡明生物體代謝相關(guān)過程的代謝組學(xué)技術(shù)。LCMS非靶向代謝組學(xué)適用于分析難揮發(fā)或熱穩(wěn)定性差的代謝產(chǎn)物,,具有高通量,、高分辨率、高靈敏度的特點(diǎn),。超高壓液相色譜或超高效液相色譜(UPLC)通過采用更小粒徑的色譜填料配合更高的壓力,,實(shí)現(xiàn)了更好的分離,具體包括更高的分離能力,、更快的分離速度以及更好的靈敏度,;串聯(lián)質(zhì)譜儀在MS掃描模式下,可實(shí)現(xiàn)高低碰撞能量快速切換,,同時(shí)采集代謝物的一二級(jí)質(zhì)譜信息,,結(jié)合代謝組學(xué)數(shù)據(jù)處理軟件對(duì)質(zhì)譜信息的解析,,在單次分析中可檢測(cè)和鑒定幾百至幾千種代謝物。
非靶向代謝組學(xué):新陳代謝網(wǎng)絡(luò)是復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò),,特別是人體的代謝網(wǎng)絡(luò),,一直被認(rèn)為是相對(duì)復(fù)雜的代謝網(wǎng)絡(luò)。現(xiàn)在多數(shù)信號(hào)通路的研究是集中在代謝網(wǎng)絡(luò)的一個(gè)很小的領(lǐng)域,?;蚪M學(xué)、蛋白組學(xué)研究已經(jīng)揭示了部分調(diào)節(jié)通路,,但是和代謝網(wǎng)絡(luò)直接相關(guān)的是代謝產(chǎn)物,。從多種代謝產(chǎn)物中選取研究對(duì)象,無疑是困難的,。非靶向代謝組學(xué)又稱為發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué),,主要是將對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組的代謝組(某一生物體的全部代謝物)進(jìn)行比對(duì),以找出其代謝物的差異,。代謝組學(xué)研究通過一定的手段能夠幫助研究員從代謝產(chǎn)物海中跳出來,,提供一個(gè)“航拍”的視角,從而發(fā)現(xiàn)差異性代謝產(chǎn)物,。然后通過已知的代謝通路逆推找出調(diào)節(jié)酶和基因,,完成疾病發(fā)病機(jī)制、藥物療理機(jī)制等方面的研究,。代謝組學(xué)有哪些特點(diǎn),?
選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段的優(yōu)勢(shì)有哪些?1,、代謝組學(xué)的研究處于生物信息流的中游,,介于基因、蛋白質(zhì)和細(xì)胞,、組織之間,,在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。2,、小分子的產(chǎn)生和代謝是基因表達(dá)的下游產(chǎn)物,,生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接,更準(zhǔn)確的反映生物體的病理生理狀態(tài),。3,、代謝物的種類少,大約在103個(gè)數(shù)量級(jí),,要遠(yuǎn)小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù),,物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)要簡(jiǎn)單得多,分析起來更簡(jiǎn)單明了。4,、代謝組學(xué)的代謝物信息庫簡(jiǎn)單,,它遠(yuǎn)沒有全基因組測(cè)序及大量表達(dá)序列標(biāo)簽的數(shù)據(jù)庫那么復(fù)雜。5,、基因和蛋白質(zhì)表達(dá)的有效微小變化會(huì)在代謝物上得到放大,,從而使檢測(cè)更容易。6,、代謝產(chǎn)物在各個(gè)生物體系中都是類似的,,所以代謝組學(xué)研究中采用的技術(shù)更容易在各個(gè)領(lǐng)域中通用,也更容易被人接受,。代謝組學(xué)是對(duì)某一生物或細(xì)胞中相對(duì)分子量小于1,000的小分子代謝產(chǎn)物進(jìn)行定性和定量分析的一門新學(xué)科,。上海LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)研究
為什么選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段?山東LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)服務(wù)
代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,,代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,是要涉及研究每一個(gè)代謝組分的共性,、特性和規(guī)律,,目前據(jù)此目標(biāo)相距甚遠(yuǎn)。盡管充滿了挑戰(zhàn),,研究人員仍然堅(jiān)信,,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密,。疾病導(dǎo)致機(jī)體病理生理過程變化,,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,通過對(duì)某些代謝產(chǎn)物進(jìn)行分析,,并與正常人的代謝產(chǎn)物比較,,尋找疾病的生物標(biāo)記物,將提供一種較好的疾病診斷方法,。山東LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)服務(wù)