全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序：狹義的轉(zhuǎn)錄組默認(rèn)只包含mRNA,，但是廣義的轉(zhuǎn)錄組指的是細(xì)胞或組織中所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的匯合,，其中包含mRNA和非編碼RNA（non-codingRNA,ncRNA）,。非編碼RNA目前的研究多集中在具有調(diào)控功能的smallRNA（以miRNA為表示）,，長(zhǎng)鏈非編碼RNA（longnon-codingRNA,lncRNA）和環(huán)狀RNA（circularRNA,circRNA）上，而這幾類ncRNA的調(diào)控對(duì)象都和mRNA有關(guān),。因此,，全轉(zhuǎn)錄組即包含了ncRNAs和mRNA。全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序即對(duì)以上四種ncRNA進(jìn)行測(cè)序,，并分析這四者之間復(fù)雜的相互作用關(guān)系,。轉(zhuǎn)錄學(xué)組測(cè)序是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的強(qiáng)大工具。深圳外泌體microRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用

轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用于胃腸瘤轉(zhuǎn)移機(jī)制研究：circRNA是一種非編碼RNA,，可以多種方式參與生物學(xué)功能,，如細(xì)胞增殖、細(xì)胞周期,、侵襲和轉(zhuǎn)移等,。近年來研究發(fā)現(xiàn)，環(huán)狀RNA可以通過海綿吸附微小RNA和RNA結(jié)合蛋白參與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,，從而影響瘤耐藥過程中的DNA修復(fù),、凋亡、增殖,、細(xì)胞轉(zhuǎn)運(yùn),，以及介導(dǎo)瘤耐藥的細(xì)胞內(nèi)酶，進(jìn)而在瘤耐藥中發(fā)揮重要調(diào)節(jié)作用,。有研究證實(shí)通過干擾環(huán)狀RNA的表達(dá),，可以提高瘤對(duì)藥物的敏感性，提示環(huán)狀RNA可能為抗瘤藥物耐藥性的研究提供新的靶點(diǎn)。河南全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄學(xué)組研究?jī)?nèi)容轉(zhuǎn)錄組學(xué)是一門在整體水平上研究細(xì)胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科,。

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)試步驟：第1步就是把單個(gè)細(xì)胞分選出來,。分選的方式也比較多，物理切割,，酶消化,，F(xiàn)ACS分選等。假如已經(jīng)分到了一個(gè)單細(xì)胞,，跟常規(guī)的轉(zhuǎn)錄組步驟上是一樣的,。下一步就是把單細(xì)胞里的RNA提取出來去建庫(kù)測(cè)序。但是一個(gè)細(xì)胞里的RNA含量是比較少的,，難建庫(kù)成功,。這個(gè)里面“量”的概念很有意思。比如說單細(xì)胞量少,，需要特殊處理,。因?yàn)閱渭?xì)胞里面RNA的量少,，所以說整個(gè)富集的過程中會(huì)出現(xiàn)一部分基因在一個(gè)細(xì)胞里能檢測(cè)到,，在另外一個(gè)細(xì)胞里面檢測(cè)不到，而每個(gè)細(xì)胞里面的檢測(cè)存在一個(gè)隨機(jī)性,，同時(shí)單細(xì)胞測(cè)序深度比較低,，所以說分析時(shí)相比于普通轉(zhuǎn)錄組有一些是需要特別注意，但整體的分析思路是類似的,。

全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?yàn)槭裁葱枰獦?gòu)建兩個(gè)文庫(kù),？全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序需要構(gòu)建2個(gè)測(cè)序文庫(kù)，一個(gè)小RNA文庫(kù)和一個(gè)去除核糖體RNA的鏈特異性文庫(kù),，然后分別上機(jī)測(cè)序,。小RNA長(zhǎng)度較短，一般小于50nt,，采用測(cè)序策略為50SE,。其他三類RNA序列一般大于200，通常在1000以上,，可達(dá)幾萬,，通過片段化構(gòu)建150PE測(cè)序文庫(kù)。然后小RNA文庫(kù)可以獲得miRNA序列信息,，去核糖體的鏈特異性文庫(kù)可以獲得mRNA,、lncRNA和circRNA的序列信息。轉(zhuǎn)錄組學(xué)即特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和,，包括mRNA和非編碼RNA,。轉(zhuǎn)錄組學(xué)廣義上指在某一生理?xiàng)l件下，細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄組產(chǎn)物的組合。

轉(zhuǎn)錄組學(xué),，基因組學(xué),，蛋白質(zhì)組學(xué)的區(qū)別：蛋白組學(xué)針對(duì)的是全體蛋白，組要以2D-Gel和質(zhì)譜為主,，分為top-down和bottom-up分析方法,。理念和基因組類似，將蛋白用特定的物料化學(xué)手段分解成小肽段,，在通過質(zhì)量反推蛋白序列,，之后進(jìn)行搜索，標(biāo)識(shí)已知未知的蛋白序列,。轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的是某個(gè)時(shí)間點(diǎn)的mRNA總和,，可以用芯片，也可以用測(cè)序,。芯片是用已知的基因探針,，測(cè)序則有可能發(fā)現(xiàn)新的mRNA?；蚪M學(xué)研究的主要是基因組DNA,，使用方法目前以二代測(cè)序?yàn)橹鳎瑢⒒蚪M拆成小片段后再用生物信息學(xué)算法進(jìn)行迭代組裝,。當(dāng)然這只是第1步,，隨后還有繁瑣的基因注釋等數(shù)據(jù)分析工作。轉(zhuǎn)錄組學(xué)有高通量,、更精確的數(shù)字信號(hào),。深圳外泌體microRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用

轉(zhuǎn)錄組學(xué)是研究細(xì)胞表型和功能的一個(gè)重要手段。深圳外泌體microRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用

宏轉(zhuǎn)錄學(xué)組概念：宏轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是對(duì)某一特定時(shí)期,、特定環(huán)境樣品中的全部微生物的RNA進(jìn)行高通量測(cè)序,，直接獲得該環(huán)境中所有微生物轉(zhuǎn)錄組信息的一種測(cè)序技術(shù)的新應(yīng)用。宏轉(zhuǎn)錄組中不只包含有微生物的物種信息,，還有微生物的基因表達(dá)信息,。如果說宏基因組能告訴我們微生物群，那么宏轉(zhuǎn)錄組則能告訴我們這些微生物,，這有助于挖掘微生物功能基因和探索微生物與環(huán)境,、疾病、動(dòng)植物等關(guān)系的機(jī)制,。宏轉(zhuǎn)錄組分析：從以G為單位的高通量測(cè)序數(shù)據(jù)中獲取研究所需的微生物種類,、基因、通路等信息是進(jìn)行宏轉(zhuǎn)錄組研究必須經(jīng)歷的一步?，F(xiàn)在網(wǎng)絡(luò)上分析組學(xué)數(shù)據(jù)的工具五花八門,。能否從眾多組學(xué)工具中選擇出適合分析宏轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的軟件,，能否搭建一套完整、快速,、高效,、靈敏、高精確的宏轉(zhuǎn)錄組分析pipline,，直接關(guān)乎到后期數(shù)據(jù)分析的進(jìn)行,。深圳外泌體microRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用

上海拜譜生物科技有限公司致力于商務(wù)服務(wù)，是一家服務(wù)型公司,。公司業(yè)務(wù)分為多組學(xué)服務(wù),，質(zhì)譜檢測(cè)，蛋白質(zhì)組學(xué),，代謝組學(xué)等,，目前不斷進(jìn)行創(chuàng)新和服務(wù)改進(jìn)，為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù),。公司注重以質(zhì)量為中心,，以服務(wù)為理念，秉持誠(chéng)信為本的理念,，打造商務(wù)服務(wù)良好品牌,。拜譜生物秉承“客戶為尊、服務(wù)為榮,、創(chuàng)意為先,、技術(shù)為實(shí)”的經(jīng)營(yíng)理念,，全力打造公司的重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力,。