全轉錄組測序：狹義的轉錄組默認只包含mRNA,，但是廣義的轉錄組指的是細胞或組織中所有轉錄產(chǎn)物的匯合,，其中包含mRNA和非編碼RNA（non-codingRNA,ncRNA）,。非編碼RNA目前的研究多集中在具有調控功能的smallRNA（以miRNA為表示）,，長鏈非編碼RNA（longnon-codingRNA,lncRNA）和環(huán)狀RNA（circularRNA,circRNA）上,，而這幾類ncRNA的調控對象都和mRNA有關,。因此，全轉錄組即包含了ncRNAs和mRNA,。全轉錄組測序即對以上四種ncRNA進行測序,，并分析這四者之間復雜的相互作用關系。轉錄組學可應用于炎癥發(fā)生機制的發(fā)現(xiàn)及干預,。哈爾濱外泌體轉錄組學定性分析

單細胞轉錄組學技術：單細胞轉錄組目前主要有三種方法：SMART擴增技術,、10×genomics技術及Andeplete技術。SMART擴增技術比較關鍵的技術,，就是設計了2個特殊的引物,。再配合用MMLV逆轉錄酶進行逆轉錄。特殊引物1由中間PolyT序列加上一段通用序列及3’末端兩個簡并堿基構成,，但在PolyT的3’端倒數(shù)第二個堿基是A,、C、G而非T的簡并堿基,，而倒數(shù)第1個為簡并堿基,，這樣做的好處是讓它正好結合在mRNA的3’端連到Poly(A)尾巴的這個連接處，而不會結合到mRNA的別的地方,。這樣就保證了逆轉錄的起始位置正好是mRNA的3’端的序列終止位置,。MMLV逆轉錄酶，這個酶有個特點，就是它在轉錄到mRNA的5’端末端的時侯,，會在新合成的cDNA的3’末端,，多加出幾個C堿基來。武漢全長轉錄學組費用RNA-Seq轉錄組學即對轉錄組進行測序和分析,。

RNA-Seq轉錄組學技術優(yōu)勢：RNA-seq技術可以檢測到低水平表達,、未識別的轉錄子和新拼接亞型基因。另一方面,，與基因芯片相比,，RNA-Seq有一個更廣的檢測動態(tài)范圍，可以研究編碼和非編碼RNA,，更易于基因網(wǎng)絡的構建,、發(fā)現(xiàn)選擇性剪切轉錄物，檢測到等位基因的具體表達方式,，也可以用來提取基因型信息,。在RNA-Seq單細胞研究中，一個主要優(yōu)勢是可以分析整個轉錄序列,，而不是有限制數(shù)量的基因,，并且，研究DNA和RNA的方法并不是相互排斥的,，他們可以相互結合使用,，產(chǎn)生更多的生物學上重要的信息。

轉錄組學應用于胃腸瘤轉移機制研究：circRNA是一種非編碼RNA,，可以多種方式參與生物學功能,，如細胞增殖、細胞周期,、侵襲和轉移等,。近年來研究發(fā)現(xiàn)，環(huán)狀RNA可以通過海綿吸附微小RNA和RNA結合蛋白參與轉錄后調控,，從而影響瘤耐藥過程中的DNA修復,、凋亡、增殖,、細胞轉運,，以及介導瘤耐藥的細胞內(nèi)酶，進而在瘤耐藥中發(fā)揮重要調節(jié)作用,。有研究證實通過干擾環(huán)狀RNA的表達,，可以提高瘤對藥物的敏感性，提示環(huán)狀RNA可能為抗瘤藥物耐藥性的研究提供新的靶點,。轉錄組學可以直接測定每個轉錄本片段序列,。

轉錄組學技術路線及研究意義：轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉錄出來的所有RNA的總和,，包括mRNA和非編碼RNA。相對于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺,，轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針,，即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測，提供更準確的數(shù)字化信號,，更高的檢測通量以及更普遍的檢測范圍,，是目前深入研究轉錄組復雜性的強大工具?；诟咄繙y序平臺的轉錄組測序技術能夠全方面獲得物種特定組織的轉錄本信息,，從而進行基因表達水平研究、新轉錄本發(fā)現(xiàn)研究,、轉錄本結構變異研究等,。轉錄組學能準確地識別可變剪切位點及cSNP，UTR區(qū)域,。哈爾濱外泌體轉錄組學定性分析

轉錄組學有高通量,、更精確的數(shù)字信號。哈爾濱外泌體轉錄組學定性分析

宏轉錄學組概念：宏轉錄組測序是對某一特定時期,、特定環(huán)境樣品中的全部微生物的RNA進行高通量測序,，直接獲得該環(huán)境中所有微生物轉錄組信息的一種測序技術的新應用。宏轉錄組中不只包含有微生物的物種信息,，還有微生物的基因表達信息,。如果說宏基因組能告訴我們微生物群，那么宏轉錄組則能告訴我們這些微生物,，這有助于挖掘微生物功能基因和探索微生物與環(huán)境,、疾病,、動植物等關系的機制,。宏轉錄組分析：從以G為單位的高通量測序數(shù)據(jù)中獲取研究所需的微生物種類、基因,、通路等信息是進行宏轉錄組研究必須經(jīng)歷的一步?，F(xiàn)在網(wǎng)絡上分析組學數(shù)據(jù)的工具五花八門。能否從眾多組學工具中選擇出適合分析宏轉錄組數(shù)據(jù)的軟件,，能否搭建一套完整,、快速、高效,、靈敏,、高精確的宏轉錄組分析pipline，直接關乎到后期數(shù)據(jù)分析的進行,。哈爾濱外泌體轉錄組學定性分析

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