轉(zhuǎn)錄組分析是目前應(yīng)用比較廣的高通量測(cè)序分析技術(shù)之一,。常見(jiàn)設(shè)計(jì)是不同樣品之間比較，尋找差異基因,、標(biāo)志基因、協(xié)同變化基因,、差異剪接和新轉(zhuǎn)錄本,，并進(jìn)行結(jié)果可視化、功能注釋和網(wǎng)絡(luò)分析等,。轉(zhuǎn)錄組的測(cè)序分析也相對(duì)成熟,，從RNA提取、構(gòu)建文庫(kù),、上機(jī)測(cè)序再到結(jié)果解析既可以自己完成,，又可以在專(zhuān)業(yè)公司進(jìn)行。概括來(lái)看轉(zhuǎn)錄組的分析流程比較簡(jiǎn)單,，序列比對(duì)-轉(zhuǎn)錄本拼接(可選)-表達(dá)定量-差異基因-功能富集-定制分析,。整個(gè)環(huán)節(jié)清晰流暢，可以作為剛開(kāi)始接觸高通量測(cè)序?qū)W習(xí)比較合適的技術(shù)之一,。轉(zhuǎn)錄組學(xué)有高通量,、更精確的數(shù)字信號(hào)。河南IncRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)服務(wù)

轉(zhuǎn)錄組學(xué)為什么原核物種只能做有參轉(zhuǎn)錄組分析,？由于原核生物的基因組中存在大量基因重疊區(qū)域,、操縱子及多順?lè)醋樱绻凑諢o(wú)參轉(zhuǎn)錄組分析策略進(jìn)行組裝的話(huà),，難度較大,，組裝結(jié)果存在較大風(fēng)險(xiǎn)。轉(zhuǎn)錄組學(xué)差異基因數(shù)目多少比較合理,？不同的處理,，不同的研究目標(biāo),，差異基因的數(shù)目是不同的，從幾十個(gè)到幾千個(gè)都有可能,。但是如果差異基因數(shù)目是個(gè)位數(shù)或者上萬(wàn),，那么就需要和分析人員溝通一下，查一查是否有問(wèn)題,。轉(zhuǎn)錄組學(xué)差異基因太多,，注釋信息太雜亂，怎么挑選目標(biāo)基因,？對(duì)不同的差異組合進(jìn)行維恩圖分析,，挑選共有或者特有的差異基因作為后續(xù)的研究對(duì)象；根據(jù)前人的文獻(xiàn)報(bào)道,，挑選相關(guān)差異基因,，不要局限在自己研究的物種上。廣州mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析方法轉(zhuǎn)錄學(xué)組測(cè)序能夠提供更普遍的檢測(cè)范圍,。

全轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)序技術(shù)優(yōu)勢(shì)：文庫(kù)優(yōu)化：針對(duì)不同長(zhǎng)度的序列采用兩種文庫(kù)構(gòu)建方法,，采用去核糖體的鏈特異性文庫(kù)可以獲得mRNA、lncRNA和circRNA的序列信息,。數(shù)據(jù)全：全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序完成后可獲取4類(lèi)主要RNA（miRNA,，mRNA，lncRNA,，circRNA）數(shù)據(jù),，可對(duì)這些數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)分析及整合分析。關(guān)聯(lián)全：通過(guò)對(duì)mRNA/miRNA/lncRNA/circRN序列測(cè)定及后續(xù)分析,，深入開(kāi)展全轉(zhuǎn)錄組調(diào)控網(wǎng)絡(luò)(ceRNA網(wǎng)絡(luò))分析,。樣本類(lèi)型：細(xì)胞，組織,，體液,、血清、血漿,、全血,，總RNA等。建議總RNA起始量：＞15μg,，濃度≥200ng/μL）,。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)（Transcriptome）廣義上指某一生理?xiàng)l件下，細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的匯合,，包括信使RNA(mRNA),、核糖體RNA(rRNA)、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA(tRNA)及非編碼RNA(ncRNA)；狹義上指所有mRNA的匯合,。轉(zhuǎn)錄組具有很強(qiáng)的時(shí)間和空間特性，是基因功能及結(jié)構(gòu)研究的基礎(chǔ)和出發(fā)點(diǎn),，掌握了生物個(gè)體基因轉(zhuǎn)錄水平的變化,，可深入了解其生命活動(dòng)特征和調(diào)控機(jī)制。通過(guò)新一代高通量測(cè)序,，能夠全方面快速地獲得某一物種特定組織在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉(zhuǎn)錄本的基因序列信息,。轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)序的研究對(duì)象為特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來(lái)的所有RNA的總和。

全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序：狹義的轉(zhuǎn)錄組默認(rèn)只包含mRNA,，但是廣義的轉(zhuǎn)錄組指的是細(xì)胞或組織中所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的匯合,，其中包含mRNA和非編碼RNA（non-codingRNA,ncRNA）。非編碼RNA目前的研究多集中在具有調(diào)控功能的smallRNA（以miRNA為表示）,，長(zhǎng)鏈非編碼RNA（longnon-codingRNA,lncRNA）和環(huán)狀RNA（circularRNA,circRNA）上,，而這幾類(lèi)ncRNA的調(diào)控對(duì)象都和mRNA有關(guān)。因此,，全轉(zhuǎn)錄組即包含了ncRNAs和mRNA,。全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序即對(duì)以上四種ncRNA進(jìn)行測(cè)序，并分析這四者之間復(fù)雜的相互作用關(guān)系,。普通轉(zhuǎn)錄組測(cè)序主要適用于不同的生長(zhǎng)階段或者發(fā)育過(guò)程,。浙江單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)定性分析

轉(zhuǎn)錄組學(xué)是研究細(xì)胞表型和功能的一個(gè)重要手段。河南IncRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)服務(wù)

circRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)：是一類(lèi)具有閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)的非編碼RNA分子,，沒(méi)有5′帽子結(jié)構(gòu)和3′poly（A）結(jié)構(gòu),，主要位于細(xì)胞質(zhì)或儲(chǔ)存于外泌體中，不受RNA外切酶影響,，表達(dá)更穩(wěn)定且不易降解,，已被證明普遍存在于多種真核生物體內(nèi)[1]。大多數(shù)circRNA是由外顯子環(huán)化而成,，也有部分circRNA是由內(nèi)含子環(huán)化而成的套索結(jié)構(gòu),。同時(shí)由于circRNA含有大量的miRNA應(yīng)答原件（MREs），能與AGO蛋白形成RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合體（RISC）的催化關(guān)鍵,，然后導(dǎo)致circRNA降解,。根據(jù)來(lái)源，circRNA可大致分為四類(lèi)：全外顯子型的circRNA,，內(nèi)含子和外顯子組合的EIcircRNA,，內(nèi)含子組成的套索型ciRNA，由病毒RNA基因組,、tRNA,、rRNA、snRNA等環(huán)化產(chǎn)生的circRNA。河南IncRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)服務(wù)

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