靶向代謝組學(xué):靶向代謝組學(xué)(Targeted Metabolomics)是代謝組學(xué)研究的重要組成部分,,也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對(duì)于全代謝組分析而言,,靶向代謝組分析具有特異性強(qiáng),,檢測(cè)靈敏度高和定量準(zhǔn)確等幾個(gè)特點(diǎn),。通過(guò)對(duì)血液、尿液或其他體液以及組織中某一特定的代謝物的富集與準(zhǔn)確定量定性分析,,一方面可以結(jié)合其它實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)揭示相關(guān)的分子生物學(xué)作用機(jī)制,,另一方面,也可以為后續(xù)代謝分子標(biāo)志物的深入研究和開(kāi)發(fā)利用提供有力支持,。靶向代謝組學(xué)可以用于:驗(yàn)證有非靶向代謝組學(xué)實(shí)驗(yàn)提出的假說(shuō),;進(jìn)行基于假說(shuō)的探索性實(shí)驗(yàn),,針對(duì)特定代謝物,研究代謝模型,。在食品安全領(lǐng)域,,利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動(dòng)植物體內(nèi)的相關(guān)生物標(biāo)志物也是一個(gè)熱點(diǎn)領(lǐng)域。杭州GC-MS非靶向代謝組學(xué)分析方法
靶向代謝組學(xué)分析成功的關(guān)鍵因素是準(zhǔn)確度,、高通量和可靠性,。靶向代謝組學(xué)鑒定一般采用 GC/MS 系統(tǒng)的選擇性離子監(jiān)測(cè) (SIM),或在三重串聯(lián)四極桿 LC/MS 系統(tǒng)上用多反應(yīng)離子監(jiān)測(cè) (MRM) 進(jìn)行靶向 MS/MS,。SIM 比全掃描圖譜采集具有更高的靈敏度,,在單四極桿質(zhì)譜中,這種靈敏度增強(qiáng)的原因是延長(zhǎng)了所選擇離子的采集時(shí)間。因?yàn)楸O(jiān)測(cè)的是一個(gè)很小的質(zhì)量窗口,,所以質(zhì)量色譜圖只表示對(duì)極為特定質(zhì)量的檢測(cè),。在大多數(shù)情況下,靈敏度可以提高 10 倍,。MRM 是進(jìn)行質(zhì)譜定量的選擇方法,,與 SIM 相比更為靈敏、更加特異,??梢援a(chǎn)生獨(dú)特的碎片離子,可對(duì)非常復(fù)雜基質(zhì)中的目標(biāo)化合物進(jìn)行監(jiān)測(cè)和定量,。哈爾濱GC-MS非靶向代謝組學(xué)應(yīng)用代謝組學(xué)的研究處于生物信息流的中游,。
代謝組學(xué):代謝組學(xué) (metabolomics)的出現(xiàn)是生命科學(xué)研究的必然。是對(duì)某一生物或細(xì)胞中相對(duì)分子量小于1,000的小分子代謝產(chǎn)物進(jìn)行定性和定量分析的一門(mén)新學(xué)科,。代謝組作為系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分,,在臨床醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有普遍的應(yīng)用前景。 代謝產(chǎn)物是基因表達(dá)的產(chǎn)物,,在代謝酶的作用下生成,。雖然與基因或蛋白質(zhì)相比,代謝產(chǎn)物較小,,但是不能形成代謝產(chǎn)物的細(xì)胞是死細(xì)胞,,因此不能小看代謝產(chǎn)物的重要性。 研究人員通過(guò)對(duì)機(jī)體代謝產(chǎn)物的深入研究,,可以判斷機(jī)體是否處于正常狀態(tài),而對(duì)基因和蛋白質(zhì)的研究都無(wú)法得出這樣的結(jié)論,。事實(shí)上,,代謝組學(xué)研究已經(jīng)能診斷出一些代謝類(lèi)疾病,如糖尿病,、肥胖癥,,代謝綜合癥,。目前,已經(jīng)研究清楚的普通代謝途徑包括三羧酸循環(huán)(TCA),,糖酵解,,花生四烯酸 (AA)/炎癥途徑。
藥物代謝和代謝組學(xué)區(qū)別:代謝組學(xué)與藥物代謝不同是它關(guān)注的對(duì)象不是外源性的藥物而是生物體本身就有的內(nèi)源性代謝物,。這些代謝物是糖,,脂肪,蛋白質(zhì),,核酸,,膽汁酸等等代謝得到的。還有共生菌代謝的,,是一個(gè)龐大的混合物,。目的是通過(guò)樣本的對(duì)比,發(fā)現(xiàn)潛在標(biāo)志物,,指導(dǎo)疾病早期診斷甚至基因水平的研究,。而藥物代謝的目標(biāo)是只要只要追蹤到這種藥物分子在體內(nèi)變化就好,相當(dāng)具有靶向性,,因此使用的技術(shù)手段就是LC-MS,。檢測(cè)藥物的中間體,和具體的藥效,,藥代動(dòng)的效應(yīng),。代謝組學(xué)與臨床化學(xué)較為相似。
LC-MS非靶向代謝組學(xué):LCMS非靶向是通過(guò)液質(zhì)聯(lián)用(LC–MS)方法檢測(cè)生物體受擾動(dòng)或刺激前后大量代謝產(chǎn)物的動(dòng)態(tài)變化,,從中找出表達(dá)差異的代謝物,,進(jìn)而闡明生物體代謝相關(guān)過(guò)程的代謝組學(xué)技術(shù)。LCMS非靶向代謝組學(xué)適用于分析難揮發(fā)或熱穩(wěn)定性差的代謝產(chǎn)物,,具有高通量,、高分辨率、高靈敏度的特點(diǎn),。超高壓液相色譜或超高效液相色譜(UPLC)通過(guò)采用更小粒徑的色譜填料配合更高的壓力,,實(shí)現(xiàn)了更好的分離,具體包括更高的分離能力,、更快的分離速度以及更好的靈敏度,;串聯(lián)質(zhì)譜儀在MS掃描模式下,可實(shí)現(xiàn)高低碰撞能量快速切換,,同時(shí)采集代謝物的一二級(jí)質(zhì)譜信息,,結(jié)合代謝組學(xué)數(shù)據(jù)處理軟件對(duì)質(zhì)譜信息的解析,在單次分析中可檢測(cè)和鑒定幾百至幾千種代謝物,。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體,、組織代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時(shí)間變化的規(guī)律,。濟(jì)南LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)分析研究
相比于其他組學(xué),代謝組學(xué)有哪些特殊的優(yōu)勢(shì),?杭州GC-MS非靶向代謝組學(xué)分析方法
代謝組學(xué)發(fā)展至今,,代謝組學(xué)技術(shù)已經(jīng)遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出了標(biāo)準(zhǔn)臨床化學(xué)技術(shù)的范圍,能夠精確分析數(shù)百至數(shù)千種代謝物,。代謝組學(xué)提供了代謝表型的詳細(xì)表征,,并可以在許多水平上進(jìn)行精密醫(yī)學(xué)研究,包括表征疾病基礎(chǔ)的代謝紊亂,,發(fā)現(xiàn)新的治靶標(biāo)以及發(fā)現(xiàn)可用于診斷疾病或監(jiān)測(cè)藥物的活性,。比較常見(jiàn)的代謝組學(xué)分析方法是質(zhì)譜(MS)核磁共振(NMR)光譜。質(zhì)譜技術(shù)又分為L(zhǎng)C-MS和GC-MS,。其基本原理是使試樣中各組分在離子源中發(fā)生電離,,生成不同荷質(zhì)比的帶電荷的離子,經(jīng)加速電場(chǎng)的作用,,形成離子束,,進(jìn)入質(zhì)量分析器。杭州GC-MS非靶向代謝組學(xué)分析方法
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