circRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)：是一類具有閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)的非編碼RNA分子，沒有5′帽子結(jié)構(gòu)和3′poly（A）結(jié)構(gòu),，主要位于細(xì)胞質(zhì)或儲存于外泌體中,，不受RNA外切酶影響，表達(dá)更穩(wěn)定且不易降解,，已被證明普遍存在于多種真核生物體內(nèi)[1],。大多數(shù)circRNA是由外顯子環(huán)化而成，也有部分circRNA是由內(nèi)含子環(huán)化而成的套索結(jié)構(gòu),。同時由于circRNA含有大量的miRNA應(yīng)答原件（MREs）,，能與AGO蛋白形成RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合體（RISC）的催化關(guān)鍵，然后導(dǎo)致circRNA降解,。根據(jù)來源,，circRNA可大致分為四類：全外顯子型的circRNA，內(nèi)含子和外顯子組合的EIcircRNA,，內(nèi)含子組成的套索型ciRNA,，由病毒RNA基因組、tRNA,、rRNA,、snRNA等環(huán)化產(chǎn)生的circRNA。轉(zhuǎn)錄組具有空間特異性的特點,。深圳單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析價格

轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用領(lǐng)域：農(nóng)林領(lǐng)域：生長發(fā)育機制,，抗逆脅迫機制，育種，物種保護(hù)研究等,；畜牧業(yè)：生長發(fā)育機制,，致病機理研究，肉類及乳制品品質(zhì)研究等,；海洋水產(chǎn)：生長發(fā)育機制,，漁業(yè)資源，漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等,；微生物：致病機理,，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等,；生物醫(yī)藥：生物標(biāo)志物,，疾病機理機制，疾病分型,，藥物開發(fā)，個性化醫(yī)治等,；環(huán)境科學(xué)：發(fā)酵過程優(yōu)化,，生物燃料生產(chǎn)，環(huán)境危害風(fēng)險評估研究等,；食品科學(xué)：食品儲藏及加工條件優(yōu)化,，食品組分及品質(zhì)鑒定，功能性食品開發(fā),，食品安全監(jiān)檢測等,。浙江SmalIRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)費用轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序包括mRNA和非編碼RNA。

轉(zhuǎn)錄組學(xué),，基因組學(xué),，蛋白質(zhì)組學(xué)的區(qū)別：蛋白組學(xué)針對的是全體蛋白，組要以2D-Gel和質(zhì)譜為主,，分為top-down和bottom-up分析方法,。理念和基因組類似，將蛋白用特定的物料化學(xué)手段分解成小肽段,，在通過質(zhì)量反推蛋白序列,，之后進(jìn)行搜索，標(biāo)識已知未知的蛋白序列,。轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的是某個時間點的mRNA總和,，可以用芯片，也可以用測序,。芯片是用已知的基因探針,，測序則有可能發(fā)現(xiàn)新的mRNA。基因組學(xué)研究的主要是基因組DNA,，使用方法目前以二代測序為主,，將基因組拆成小片段后再用生物信息學(xué)算法進(jìn)行迭代組裝。當(dāng)然這只是第1步,，隨后還有繁瑣的基因注釋等數(shù)據(jù)分析工作,。

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)：10×genomics技術(shù)：首先在凝膠微珠上種上特定的DNA的片段，DNA的片段由三部分組成：Barcode,、UMI,、PolyT組成。Barcode是16個堿基的長度,。一共有400萬種Barcode,，一個微珠是對應(yīng)于一種Barcode，通過這400萬種Barcode,，可以把凝膠微珠給區(qū)分開（通過barcode可以把cell分開）,。UMI是一段隨機序列，也就是說每一個DNA分子,，都有自己的UMI序列（一個微珠上有很多種UMI,，通過UMI可以把RNA分子分開，并可以標(biāo)記RNA分子的數(shù)量）,。10個堿基長的UMI,，有100萬種序列的變化（4^10=1,048,576），UMI的作用是為了區(qū)分哪些reads是來自于一個原始cDNA分子區(qū)分基因片段重復(fù)還是duplication及區(qū)分是真實的SNP位點還是PCR產(chǎn)生的突變,。通過10×genomics儀器將單個細(xì)胞與單個凝膠微珠通過油相混在一起,，形成油包水的小微滴?；诟咄繙y序平臺的轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序技術(shù)能夠全方面獲得物種特定組織的轉(zhuǎn)錄本信息,。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)：轉(zhuǎn)錄組學(xué)（transcriptomics），是一門在整體水平上研究細(xì)胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科,。簡而言之,，轉(zhuǎn)錄組學(xué)是從RNA水平研究基因表達(dá)的情況。轉(zhuǎn)錄組即一個活細(xì)胞所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和,，是研究細(xì)胞表型和功能的一個重要手段,。優(yōu)勢：高通量、更精確的數(shù)字信號,；在單核苷酸水平對任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動進(jìn)行檢測,；分析轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu)和表達(dá)水平的同時，還能發(fā)現(xiàn)未知轉(zhuǎn)錄本和稀有轉(zhuǎn)錄本,；準(zhǔn)確地識別可變剪切和融合基因,。應(yīng)用方向：植物生長機制的發(fā)現(xiàn)及干預(yù),；炎癥發(fā)生機制的發(fā)現(xiàn)及干預(yù)；表達(dá)差異的研究,；基因點突變及多態(tài)性檢測,。相對于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺，轉(zhuǎn)錄學(xué)組測序無需預(yù)先針對已知序列設(shè)計探針,。深圳單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析價格

轉(zhuǎn)錄組學(xué)能夠檢測未知基因,，發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本。深圳單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析價格

轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用于胃腸瘤轉(zhuǎn)移機制研究：circRNA是一種非編碼RNA,，可以多種方式參與生物學(xué)功能,，如細(xì)胞增殖、細(xì)胞周期,、侵襲和轉(zhuǎn)移等,。近年來研究發(fā)現(xiàn)，環(huán)狀RNA可以通過海綿吸附微小RNA和RNA結(jié)合蛋白參與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,，從而影響瘤耐藥過程中的DNA修復(fù),、凋亡、增殖,、細(xì)胞轉(zhuǎn)運,，以及介導(dǎo)瘤耐藥的細(xì)胞內(nèi)酶，進(jìn)而在瘤耐藥中發(fā)揮重要調(diào)節(jié)作用,。有研究證實通過干擾環(huán)狀RNA的表達(dá)，可以提高瘤對藥物的敏感性,，提示環(huán)狀RNA可能為抗瘤藥物耐藥性的研究提供新的靶點,。深圳單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析價格

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