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江蘇蛋白質(zhì)乙酰化修飾組學(xué)有哪些類型

來源: 發(fā)布時間:2022-01-16

蛋白質(zhì)翻譯后修飾分析策略:早期蛋白質(zhì)組研究的大部分工作集中在細(xì)胞生長的不同時期,,或疾病或有絲分裂原刺激后的蛋白質(zhì)表達(dá)水平的變化,。然而,許多生命過程不只受蛋白質(zhì)的相對豐度控制,,還受時空分布可逆的翻譯后修飾控制,。因此,揭示翻譯后修飾的規(guī)律是了解蛋白質(zhì)復(fù)雜性和多樣的生物學(xué)功能的前提,。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾是一個復(fù)雜的過程,。目前,發(fā)現(xiàn)的比較常見的修飾類型是糖基化,、泛素化和磷酸化,。樣品中翻譯后修飾蛋白質(zhì)含量低、動態(tài)范圍廣給相關(guān)研究帶來了很大的挑戰(zhàn),?;诜g后修飾蛋白的異質(zhì)性和相對豐度低的特點,主要利用凝膠,、生物質(zhì)譜和生物信息學(xué)工具對其進(jìn)行研究,。用于PTM分析的質(zhì)譜方法類似于用于“常規(guī)”蛋白質(zhì)鑒定的方法,包括自下而上,、自中而下和自上而下的蛋白質(zhì)組學(xué)分析,。蛋白質(zhì)磷酸化修飾怎么定義?江蘇蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)有哪些類型

蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué):蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是生物體內(nèi)重要的共價修飾方式之一,。磷酸化修飾本身所具有的簡單、靈活、可逆的特性,,以及磷酸基團的供體ATP的易得性,,使得磷酸化修飾被真核細(xì)胞所選擇接受成為一種比較普遍的調(diào)控手段。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程,,幾乎調(diào)節(jié)著包括細(xì)胞的增殖,、發(fā)育、分化,、細(xì)胞骨架調(diào)控,、細(xì)胞凋亡、神經(jīng)活動,、肌肉收縮,、新陳代謝發(fā)生等生命活動的所有過程,并且可逆的蛋白質(zhì)磷酸化是目前所知道的比較主要的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)方式,。目前已經(jīng)知道有許多人類疾病是由于異常的磷酸化修飾所引起,,而有些磷酸化修飾卻是某種疾病所導(dǎo)致的后果。北京蛋白質(zhì)丙二?;揎椊M學(xué)分析蛋白質(zhì)翻譯后修飾是指對翻譯后的蛋白質(zhì)進(jìn)行共價加工的過程,。

蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾的類型:翻譯后修飾的類型包括N端fMet或Met的去除、二硫鍵的形成,、化學(xué)修飾和肽鍵的裂解,,其中磷酸化是比較常見的。蛋白質(zhì)的化學(xué)修飾反應(yīng)是在維持蛋白質(zhì)的完整性和功能性的基礎(chǔ)上,,通過基于其氨基酸殘基的化學(xué)反應(yīng)獲得新的生物結(jié)合物,。翻譯后修飾在哪里發(fā)生?翻譯后修飾主要發(fā)生在氨基酸側(cè)鏈或蛋白質(zhì)的C端或N端?,F(xiàn)有的官能團或新官能團的引入可被用于修飾蛋白質(zhì),,以擴展20個標(biāo)準(zhǔn)氨基酸的化學(xué)組成。翻譯后修飾的位點通常帶有可以在化學(xué)反應(yīng)中充當(dāng)親核試劑的官能團,,如絲氨酸,、蘇氨酸和酪氨酸的羥基;賴氨酸,、精氨酸和組氨酸胺形式,;同時,在蛋白質(zhì)的N端和C端,,天冬酰胺也可作為翻譯后修飾中的一種聚糖連接點,。翻譯后修飾也發(fā)生在氧化的蛋氨酸和側(cè)鏈位點的一些亞甲基上。

蛋白磷酸化修飾過程:蛋白磷酸化修飾這一過程是通過蛋白激酶催化,,將磷酸基團從ATP轉(zhuǎn)移到多肽底物的絲氨酸,、蘇氨酸,,或酪氨酸殘基上,。并且磷酸化修飾的過程是可逆的,,去磷酸化反應(yīng)由蛋白磷酸酶催化完成。蛋白磷酸化檢測方法:Western Blot檢測方法:Western Blot是檢測蛋白磷酸化水平的常用方法,,主要過程為先利用SDS-PAGE分離蛋白質(zhì),,隨后將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到PVDF膜上,然后使用特異性識別磷酸化蛋白的抗體來鑒定目標(biāo)蛋白的磷酸化水平,。只有被磷酸化修飾的蛋白才會在相應(yīng)分子質(zhì)量的地方顯現(xiàn)特異性蛋白條帶,。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級結(jié)構(gòu)的變化,。

蛋白質(zhì)修飾位點分析:基于LC-MS/MS分析能夠精確測定蛋白質(zhì)或多肽分子質(zhì)量這一特性,,從而檢測蛋白質(zhì)或者多肽上位點發(fā)生何種修飾??蓹z測修飾類型如下: 磷酸化,、糖基化、乙?;?、泛素化、丙?;?、丁酰化,、丙二?;⑽於,;?、琥珀酰化,、單甲基化,、二甲基化、三甲基化,。1,、磷酸化:信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞周期,、生長發(fā)育機理等,;2、糖基化:蛋白質(zhì)折疊,、更新以及免疫應(yīng)答等,;3、乙酰化:基因表達(dá)調(diào)控,、細(xì)胞凋亡,、細(xì)胞代謝、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性以及神經(jīng)退行性的病變等,;4,、泛素化:細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡,、轉(zhuǎn)錄調(diào)控,、DNA修復(fù)以及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等;5,、甲基化:染色質(zhì)結(jié)構(gòu)及轉(zhuǎn)錄調(diào)控等,;6、丙?;?/ 丙二?;?/ 戊二酰化 / 琥珀?;褐饕嬖谟诰€粒體和細(xì)菌中,,與代謝過程密切相關(guān)。蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)具有可靠性,。哈爾濱糖基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)一般流程

常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括磷酸化,。江蘇蛋白質(zhì)乙酰化修飾組學(xué)有哪些類型

蛋白質(zhì)乙?;揎椀墓δ埽耗壳皩σ阴,;揎椀墓δ苎芯恐饕性趯?xì)胞轉(zhuǎn)錄調(diào)控,以及對代謝通路的調(diào)控這兩個方面,。在眾多乙?;揎椀牡鞍踪|(zhì)中,研究較多的要數(shù)細(xì)胞核中包圍DNA的組蛋白了,。組蛋白和DNA纏繞構(gòu)成核小體,,組蛋白的甲基化、乙?;揎椖軌蛘{(diào)節(jié)DNA纏繞的松緊度,,從而對基因表達(dá)進(jìn)行調(diào)控,因此,,組蛋白的翻譯后修飾是表觀遺傳學(xué)研究中的重要一環(huán),。另外,研究也發(fā)現(xiàn)乙?;揎椘毡榇嬖谟谌说亩喾N代謝酶之中,,并且參與調(diào)控代謝通路以及代謝酶的活性,。其中在肝臟這樣的代謝中就存在著多種代謝酶被高度乙酰化,。江蘇蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)有哪些類型

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