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上海蛋白免疫沉淀實(shí)驗(yàn)原理

來源: 發(fā)布時(shí)間:2024-07-22

免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)的實(shí)驗(yàn)步驟通常包括以下幾個(gè)關(guān)鍵環(huán)節(jié):
1. 細(xì)胞裂解:首先需要收集細(xì)胞并裂解它們,以釋放細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì),。這通常通過添加含有蛋白酶抑制劑的裂解緩沖液來完成,,以防止蛋白質(zhì)降解。
2. 裂解物上清:裂解后的細(xì)胞混合物通常需要通過離心來去除未破碎的細(xì)胞碎片和未裂解的細(xì)胞,,從而獲得上清,。
3. 抗體的添加:將特定于目標(biāo)蛋白的抗體加入到裂解物中。這些抗體將特異性地結(jié)合到目標(biāo)蛋白上,。
4. 免疫復(fù)合物的形成:抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合形成免疫復(fù)合物,。
5. 免疫復(fù)合物的捕獲:使用Protein A/G結(jié)合的磁珠來捕獲免疫復(fù)合物。
6. 洗滌:捕獲免疫復(fù)合物后,,需要用裂解/洗滌緩沖液多次洗滌,,以去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和其他污染物。
7. 洗脫:免疫復(fù)合物可以通過加入SDS樣品緩沖液進(jìn)行洗脫,,這將導(dǎo)致抗體和抗原變性并從珠子上釋放下來,,或者使用低pH緩沖液進(jìn)行溫和洗脫,以保持蛋白質(zhì)的天然構(gòu)象,。
8. 分析:洗脫后的樣品可以通過SDS-PAGE凝膠電泳,、Western blot等方法進(jìn)行分析,以驗(yàn)證目標(biāo)蛋白的存在和狀態(tài),。
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Co-IP的實(shí)驗(yàn)步驟:
1. 細(xì)胞裂解:首先,,細(xì)胞或組織被裂解,釋放其中的蛋白質(zhì),。
2. 抗體結(jié)合:然后,,將特異性抗體(針對(duì)已知蛋白質(zhì)之一的抗體)加入到裂解物中。這些抗體會(huì)特異性地結(jié)合到目標(biāo)蛋白(誘餌蛋白)上,。
3. 免疫復(fù)合物形成:抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合后,,形成免疫復(fù)合物。
4. 沉淀:接著,,使用蛋白A或蛋白G結(jié)合的珠子(如瓊脂糖或磁性珠子)來捕獲免疫復(fù)合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結(jié)合,,從而拉下抗體以及與之結(jié)合的目標(biāo)蛋白和任何相關(guān)的相互作用蛋白,。
5. 洗滌:捕獲的免疫復(fù)合物被洗滌以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)。
6. 洗脫和分析:免疫復(fù)合物被洗脫并進(jìn)行進(jìn)一步的分析,,如Western blot(WB)或質(zhì)譜分析,,以鑒定相互作用的蛋白質(zhì)。
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免疫沉淀是利用抗體特異性反應(yīng)純化富集目的蛋白的一種方法,。抗體與細(xì)胞裂解液或表達(dá)上清中相應(yīng)的蛋白結(jié)合后,,再與蛋白A/G(ProteinA/G)或二抗偶聯(lián)的珠子(agarose或Sepharose)孵育,,通過離心得到珠子-蛋白A/G或二抗-抗體-目的蛋白復(fù)合物,沉淀經(jīng)過洗滌后,,重懸于電泳上樣緩沖液,,煮沸5-10min,在高溫及還原劑的作用下,,抗原與抗體解離,,離心收集上清,上清中包括抗體,、目的蛋白和少量的雜蛋白,。免疫沉淀是一種生物學(xué)技術(shù),它利用抗體的特異性結(jié)合特性來富集和分離混合物中的特定蛋白質(zhì),。這種技術(shù)是研究蛋白質(zhì)表達(dá),、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)修飾和蛋白質(zhì)功能的強(qiáng)大工具,。

免疫共沉淀分析(Co-IP)實(shí)驗(yàn)原理與IP十分類似,,基本的技術(shù)都是采用目標(biāo)抗原特異性的固相化抗體;但I(xiàn)P的目標(biāo)是純化單一抗原,,而Co-IP旨在分離抗原及與抗原結(jié)合的蛋白質(zhì)或配體,。

在Co-IP實(shí)驗(yàn)中,已知抗原稱為誘餌蛋白,與之結(jié)合的蛋白則稱為靶蛋白,。靶蛋白可能是一些復(fù)雜的伴侶蛋白,、信號(hào)分子、結(jié)構(gòu)蛋白,、輔助因子等,,蛋白間相互作用強(qiáng)度范圍可能介于高度瞬時(shí)和十分穩(wěn)定之間?;镜腃o-IP實(shí)驗(yàn)方案與IP相同,,實(shí)際上任何IP系統(tǒng)均可用于Co-IP。但是,,還有許多其他因素需要考慮,,例如,結(jié)合和洗滌條件的優(yōu)化,,優(yōu)化時(shí),,需要考慮到誘餌蛋白-靶蛋白的相互作用強(qiáng)度以及抗體-誘餌蛋白的親和力。
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ChIP(染色質(zhì)免疫沉淀)實(shí)驗(yàn)是一種用于研究蛋白質(zhì)與DNA相互作用的技術(shù),。以下是ChIP實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)方法概述:
1. 交聯(lián):將細(xì)胞與交聯(lián)劑(如1%甲醛)孵育,通常在室溫下進(jìn)行10-15分鐘,。
2. 終止交聯(lián):添加甘氨酸以終止交聯(lián)反應(yīng),,孵育5分鐘。
3. 收集細(xì)胞:通過離心收集細(xì)胞,,并用PBS洗滌以去除交聯(lián)劑,。
4. 細(xì)胞裂解:使用裂解緩沖液裂解細(xì)胞,釋放染色質(zhì),。
5. 染色質(zhì)剪切:使用超聲波或酶消化將染色質(zhì)剪切成適當(dāng)大小的片段,。
6. 免疫沉淀:將剪切后的染色質(zhì)與特異性抗體孵育,然后添加蛋白A/G磁珠,。
7. 洗滌:用低鹽,、高鹽和LiCl洗滌液洗滌磁珠,去除非特異性結(jié)合物,。
8. 洗脫:用洗脫緩沖液洗脫DNA,。
9. 逆轉(zhuǎn)交聯(lián):用蛋白酶K處理,然后在65°C下加熱過夜以逆轉(zhuǎn)交聯(lián),。
10. DNA純化:使用商業(yè)試劑盒或標(biāo)準(zhǔn)酚/氯仿方法純化DNA,。
11. 分析:使用qPCR分析富集的DNA,或進(jìn)行測(cè)序以確定蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn),。
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ChIP技術(shù)的應(yīng)用:
1. 轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的鑒定:研究特定轉(zhuǎn)錄因子在基因組上的結(jié)合模式。
2. 組蛋白修飾的分布:分析不同組蛋白修飾在基因組上的分布情況,,這些修飾與基因的活躍或沉默有關(guān),。
3. DNA甲基化研究:結(jié)合ChIP技術(shù)可以研究DNA甲基化對(duì)基因表達(dá)的影響。
4. 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能:研究染色質(zhì)重塑對(duì)基因表達(dá)和細(xì)胞功能的影響,。
5. 疾病相關(guān)基因的調(diào)控:研究疾病狀態(tài)下基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的變化,。
ChIP技術(shù)是表觀遺傳學(xué)研究中的一個(gè)重要工具,它可以幫助科學(xué)家們理解基因表達(dá)是如何在分子水平上被精確調(diào)控的,。
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標(biāo)簽: 支原體 免疫沉淀