qpcr的檢測原理:qPCR主要是使用插入染料或熒光探針(例如TaqMan),,利用實時積累的熒光信號監(jiān)測整個擴增過程,然后通過標準曲線來對未知模板進行定量分析,。qPCR 主要是依賴于標準品制備標準曲線,,進而去確定未知樣品的濃度,因此是一種相對定量的方法,。隨著PCR的循環(huán)進行,,染料熒光強度增加,,從而檢測到定量反應(yīng)的DNA。SYBR Green是一種DNA插入染料,,范圍廣用于qPCR,。雖然SYBR Green方法比探針方法便宜,但是特異性沒有熒光探針方法好,。q225 加樣孔板側(cè)壁和金屬熱塊能夠嚴密貼合,,使液體樣品迅速達到設(shè)定溫度,從而減少實驗時間,。廣東Quantagene q225mxqPCR儀儀器
與標準 PCR 一樣,,SYBR Green 方案由變性、退火和延伸階段組成,。 不同之處在于,,您在 qPCR 設(shè)置期間將一些雙鏈 DNA 結(jié)合染料 SYBR Green I 添加到預(yù)混液中。 這種熒光染料在延伸階段嵌入到雙鏈 DNA 序列中,,顯示出熒光信號的強烈增加,。 在每個熱循環(huán)結(jié)束時測量此信號將使您能夠確定存在的雙鏈 DNA 的數(shù)量。SYBR Green 檢測的缺點是染料會與任何雙鏈 DNA 序列結(jié)合,。 這意味著您還可以檢測非特異性 qPCR 產(chǎn)物(例如引物二聚體)發(fā)出的熒光,。 為消除這種風險,通過執(zhí)行熔解曲線分析檢查反應(yīng)特異性,,或使用 TaqMan 方法,。深圳小巧qPCR儀消毒SYBR Green是一種DNA插入染料用于qPCR。雖然SYBR Green方法比探針方法便宜,,但是特異性沒有熒光探針方法好,。
染色質(zhì)片段化——DN段化:細胞核材料片段化是獲得良好的ChIP 分辨率的關(guān)鍵因素,理想情況下的片段大小在 200 到 800 bp對之間,。剪切是難控制的步驟之一,。通過超聲處理和/或核酸酶/酶促消化可以實現(xiàn)剪切,各有利弊,。超聲處理需要大量的手動操作時間,但非常適合難以裂解的細胞,;酶促消化不需要手動操作,,適用于大量樣品的處理,但其剪切位點不是隨機的,。兩種方法都需要根據(jù)具體細胞系進行優(yōu)化,。注意:此時可以停止ChIP。經(jīng)過剪切/消化染色質(zhì)后,,可以將樣品于-80°C儲存,。避免反復凍融,。
實時熒光定量PCR所使用的熒光物質(zhì)可分為兩種:熒光探針和熒光染料。現(xiàn)將其原理簡述如下:1. TaqMan熒光探針:PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針,,該探針為一寡核苷酸,,兩端分別標記一個報告熒光基團和一個淬滅熒光基團。探針完整時,,報告基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收,;PCR擴增時,Taq酶的5'-3'外切酶活性將探針酶切降解,,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,,就有一個熒光分子形成,,實現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。2. SYBR熒光染料:在PCR反應(yīng)體系中,,加入過量SYBR熒光染料,,SYBR熒光染料非特異性地摻入DNA雙鏈后,發(fā)射熒光信號,,而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發(fā)射任何熒光信號,,從而保證熒光信號的增加與PCR產(chǎn)物的增加完全同步。SYBR與雙鏈DNA進行結(jié)合,,因此可以通過溶解曲線,,確定PCR反應(yīng)是否特異。3.分子信標:是一種在5和3末端自身形成一個8個堿基左右的發(fā)夾結(jié)構(gòu)的莖環(huán)雙標記寡核苷酸探針,,兩端的核酸序列互補配對,,導致熒光基團與淬滅基團緊緊靠近,不會產(chǎn)生熒光,。PCR產(chǎn)物生成后,,退火過程中,分子信標中間部分與特定DNA序列配對,,熒光基因與淬滅基因分離產(chǎn)生熒光,。qPCR 反應(yīng)所需時間取決于反應(yīng)溶液進行變溫所需要的時間,這過程受到加熱塊升降溫速度和液體升降溫速度影響,。
Quantagene q225 系列熒光定量PCR 系統(tǒng)主要特點:精確定量 以可靠的數(shù)據(jù)助力您的研究,。采用擬合算法計算 Ct 值,定量誤差不超過±10%,。液體冷卻循環(huán)系統(tǒng)確??组g溫度高度一致,溫差不超過 ±0.15°C,。光學系統(tǒng)無運動部件,,穩(wěn)定性增加,,長期使用無需校準與維護。的儀器間重復性,,不同位置,、不同反應(yīng)體積均不影響定量結(jié)果??焖俑咝?用更短的時間獲得更多數(shù)據(jù),。40 個循環(huán)的常規(guī) qPCR 只需43 分鐘,較常見qPCR 儀多縮短60% 的時間,。在提高速度的同時保持了96 孔的高通量,,滿足絕大多數(shù)實驗需求。小巧輕便 節(jié)省空間及您的寶貴樣品小體積為移動實驗和大量部署提供可能,。5-10 μl 的推薦反應(yīng)體積,,較常規(guī)實驗節(jié)省80%的試劑用量,更節(jié)約您的珍貴樣品,。PCR反應(yīng)需要五種關(guān)鍵試劑:PCR模板,、DNA聚合酶、引物,、脫氧核苷酸三磷酸(dNTPs),、PCR緩沖液。廣東Quantagene q225mxqPCR儀儀器
與標準 PCR 一樣,,SYBR Green 方案由變性,、退火和延伸階段組成。廣東Quantagene q225mxqPCR儀儀器
實時熒光定量PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR,,qPCR)通過在普通 PCR 反應(yīng)體系中加入了熒光標記探針或熒光染料,,利用熒光信號的變化實時檢測PCR擴增反應(yīng)中每一個循環(huán)擴增產(chǎn)物變化。通過熒光強度變化監(jiān)測產(chǎn)物量的變化,,從而得到一條熒光擴增曲線圖,。具有專一性更高、可實時監(jiān)控,、可重復精確定量等優(yōu)勢,。qPCR的種類根據(jù)qPCR的化學發(fā)光原理一般分為2大類:一類是探針法,利用與靶序列特異雜交的探針來指示擴增產(chǎn)物的增加,;一類是基于SYBR Green I 的染料法,,通過熒光染料來指示產(chǎn)物的增加。廣東Quantagene q225mxqPCR儀儀器
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