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來源: 發(fā)布時間:2023-06-12

所謂實時熒光定量PCR技術(shù),,是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進(jìn)程,,通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進(jìn)行定量分析的方法,。實時熒光定量PCR (Quantitative Real-time PCR)是一種在DNA擴增反應(yīng)中,以熒光化學(xué)物質(zhì)測每次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法,。通過內(nèi)參或者外參法對待測樣品中的特定DNA序列進(jìn)行定量分析的方法,?!eal-timePCR是在PCR擴增過程中,,通過熒光信號,對PCR進(jìn)程進(jìn)行實時檢測,。由于在PCR擴增的指數(shù)時期,,模板的Ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線性關(guān)系,所以成為定量的依據(jù),。qPCR在原有PCR基礎(chǔ)上與熒光檢測方法結(jié)合,,實現(xiàn)了PCR從定性到定量的飛躍,,具有靈敏度高、特異性強的優(yōu)點,。佛山Quantagene q225qPCR儀采購

定量首先需要建立Ct值和拷貝數(shù)之間的線性關(guān)系,,即標(biāo)準(zhǔn)曲線,標(biāo)曲需要由標(biāo)準(zhǔn)品生成,,標(biāo)準(zhǔn)品中基因序列要與待測樣品中基因序列一致,,從而保證引物在兩者中擴增效率完全相同,標(biāo)準(zhǔn)品來源可以是質(zhì)粒,,純化的PCR產(chǎn)物或者基因組DNA等,。標(biāo)準(zhǔn)品在加樣時需要注意體積比較好大于2微升,以減少標(biāo)曲誤差,,標(biāo)曲是由不同梯度標(biāo)準(zhǔn)品生成,,每個標(biāo)準(zhǔn)品梯度建立Ct值與拷貝數(shù)對數(shù)值之間的聯(lián)系,落在標(biāo)曲上的梯度點比較好有5個及以上,,至少3個點,。標(biāo)準(zhǔn)品和待測樣品同時反應(yīng),將待測樣品檢測的Ct值代入標(biāo)曲后即可換算出待測樣品中基因的拷貝數(shù),。深圳Quantagene q225qPCR儀消毒q225 加樣孔板側(cè)壁和金屬熱塊能夠嚴(yán)密貼合,,使液體樣品迅速達(dá)到設(shè)定溫度,從而減少實驗時間,。

傳統(tǒng)定量PCR方法簡介:1)內(nèi)參照法:在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標(biāo)和引物,,內(nèi)標(biāo)用基因工程方法合成。上游引物用熒光標(biāo)記,,下游引物不標(biāo)記,。在模板擴增的同時,內(nèi)標(biāo)也被擴增,。在PCR產(chǎn)物中,,由于內(nèi)標(biāo)與靶模板的長度不同,二者的擴增產(chǎn)物可用電泳或高效液相分離開來,,分別測定其熒光強度,,以內(nèi)標(biāo)為對照定量待檢測模板。2)競爭法:選擇由突變克隆產(chǎn)生的含有一個新內(nèi)切位點的外源競爭性模板,。在同一反應(yīng)管中,,待測樣品與競爭模板用同一對引物同時擴增(其中一個引物為熒光標(biāo)記)。擴增后用內(nèi)切酶消化PCR產(chǎn)物,,競爭性模板的產(chǎn)物被酶解為兩個片段,,而待測模板不被酶切,可通過電泳或高效液相將兩種產(chǎn)物分開,,分別測定熒光強度,,根據(jù)已知模板推測未知模板的起始拷貝數(shù),。3)PCR-ELISA法:利用地高辛或生物素等標(biāo)記引物,擴增產(chǎn)物被固相板上特異的探針?biāo)Y(jié)合,,再加入抗地高辛或生物素酶標(biāo)抗體-辣根過氧化物酶結(jié)合物,,終酶使底物顯色。常規(guī)的PCR-ELISA法只是定性實驗,,若加入內(nèi)標(biāo),,作出標(biāo)準(zhǔn)曲線,也可實現(xiàn)定量檢測目的,。

實時熒光定量PCR所使用的熒光物質(zhì)可分為兩種:熒光探針和熒光染料?,F(xiàn)將其原理簡述如下:1. TaqMan熒光探針:PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,,兩端分別標(biāo)記一個報告熒光基團和一個淬滅熒光基團,。探針完整時,報告基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收,;PCR擴增時,,Taq酶的5'-3'外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號,,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,,實現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步,。2. SYBR熒光染料:在PCR反應(yīng)體系中,加入過量SYBR熒光染料,,SYBR熒光染料非特異性地?fù)饺隓NA雙鏈后,,發(fā)射熒光信號,而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發(fā)射任何熒光信號,,從而保證熒光信號的增加與PCR產(chǎn)物的增加完全同步,。SYBR與雙鏈DNA進(jìn)行結(jié)合,因此可以通過溶解曲線,,確定PCR反應(yīng)是否特異,。3.分子信標(biāo):是一種在5和3末端自身形成一個8個堿基左右的發(fā)夾結(jié)構(gòu)的莖環(huán)雙標(biāo)記寡核苷酸探針,兩端的核酸序列互補配對,,導(dǎo)致熒光基團與淬滅基團緊緊靠近,,不會產(chǎn)生熒光。PCR產(chǎn)物生成后,,退火過程中,,分子信標(biāo)中間部分與特定DNA序列配對,,熒光基因與淬滅基因分離產(chǎn)生熒光,。實時熒光定量PCR技術(shù)有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點檢測的局限,,實現(xiàn)每一輪循環(huán)均檢測一次熒光信號的強度。

檢測原理:將一個樣本分成幾十到幾萬份,,再將其分配到不同的反應(yīng)單元中,,使每個微滴單元包含一個或多個拷貝的核酸分子(即DNA模板),每個單元都會對目標(biāo)分子進(jìn)行擴增,,檢測PCR擴增產(chǎn)物的熒光信號強度,,帶入泊松分布即可計算出起始模板DNA濃度。dPCR原理:微滴式數(shù)字PCR檢測流程:其方法與qPCR類似,,分為以下幾步,。:1、DNA提取2,、DNA濃度檢測并稀釋,。3、配置PCR反應(yīng)液,。4,、上機到PCR儀中進(jìn)行檢測。5,、PCR擴增,。6、結(jié)果判讀,。使用微滴數(shù)字PCR儀逐個對每個微滴進(jìn)行檢測,,有熒光信號的微滴判讀為1,沒有熒光信號的微滴判讀為0,,終根據(jù)泊松分布原理以及陽性微滴的比例,,計算出DNA濃度。



dPCR可用于常規(guī)qPCR所需的標(biāo)準(zhǔn)品定量,,具有計量學(xué)意義 ,。廣東qPCR儀

由于qPCR的高靈敏性,陰性對照有出現(xiàn)擴增信號的情況,,那么在針對這類問題時,,我們需要判斷其原因所在。佛山Quantagene q225qPCR儀采購

所有儀器的操作都基本一致,。設(shè)置的時候包括反應(yīng)板設(shè)置(plate setup)和程序設(shè)置(program setup),。我們以 ABI StepOne為例,詳細(xì)看一下反應(yīng)設(shè)置:A. 首先是實驗?zāi)康倪x擇:定量還是其他,。我們命名為“BioTeke”,,進(jìn)行“定量”實驗。B. 實驗方法的選擇:我們選用的比較Ct的SYBR Green方法,, Fast程序,,以cDNA為模板進(jìn)行,。C. 目的基因的設(shè)置:有幾個目的基因和目的基因的名稱。D. 樣品的設(shè)置:包括哪個是實驗組,,哪個是對照組,。以及負(fù)對照的設(shè)置和生物重復(fù)的設(shè)置。E. 對照組和內(nèi)參基因的設(shè)置:這個是為后面的定量做準(zhǔn)備F. 反應(yīng)程序的設(shè)置:PCR反應(yīng)程序的設(shè)置要根據(jù)不同公司的MasterMix,。比如BioTeke的95℃ 2分鐘就可以DNA聚合酶(ABI的需要10 分鐘),。循環(huán)反應(yīng)是95℃15秒,60℃15秒的40個循環(huán),。溶解曲線程序采用儀器默認(rèn)設(shè)置就可以,。或者是儀器說明書上建議的程序,。G. 反應(yīng)體系的設(shè)置:A-G這五個步驟簡單設(shè)置好,,可以保存,修改反應(yīng)程序或者立刻進(jìn)行反應(yīng),。


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