qpcr的檢測原理:qPCR主要是使用插入染料或熒光探針(例如TaqMan),利用實時積累的熒光信號監(jiān)測整個擴增過程,,然后通過標準曲線來對未知模板進行定量分析,。qPCR 主要是依賴于標準品制備標準曲線,進而去確定未知樣品的濃度,,因此是一種相對定量的方法,。隨著PCR的循環(huán)進行,染料熒光強度增加,,從而檢測到定量反應的DNA,。SYBR Green是一種DNA插入染料,范圍廣用于qPCR,。雖然SYBR Green方法比探針方法便宜,,但是特異性沒有熒光探針方法好。Real-timePCR是在PCR擴增過程中,,通過熒光信號,,對PCR進程進行實時檢測。珠海高效qPCR儀儀器
RealTimePCR是通過檢測反應體系中的熒光強度來檢測PCR擴增產(chǎn)物的,其熒光檢出方法可分為熒光嵌合法和熒光探針法兩大種類,。熒光嵌合法(SYBRGreenI)的原理熒光嵌合法通常使用SYBRGreenI,。SYBRGreenI是一種能夠結合于所有dsdna雙螺旋小溝區(qū)域的具有綠色激發(fā)長的染料。它與PCR合成的雙鏈DNA結合,在激發(fā)光照射下產(chǎn)生熒光,通過熒光強度的檢測,可以實時監(jiān)測PCR擴增的產(chǎn)物量,。熒光嵌合法(SYBRGreenI)的原理熒光嵌合法通常使用SYBRGreenI,。SYBRGreenI是一種能夠結合于所有dsdna雙螺旋小溝區(qū)域的具有綠色激發(fā)長的染料。它與PCR合成的雙鏈DNA結合,在激發(fā)光照射下產(chǎn)生熒光,通過熒光強度的檢測,可以實時監(jiān)測PCR擴增的產(chǎn)物量,。Quantagene q225qPCR儀采購在進行大量SNP標記分型時無需合成熒光探針和熒光引物,。可以的節(jié)省實驗成本,。
染料法是指在qPCR反應體系中加入一種與雙鏈DNA分子結合的熒光染料,,包括SYBR®Green I,、BEBO和LC Green TMI等染料,它們可以與雙鏈DNA(double strands DNA,,dsDNA)的小溝非特異性結合,,激發(fā)較強的熒光產(chǎn)生。經(jīng)熒光定量PCR儀器檢測后,,對核酸進行定性和定量分析,。qPCR 染料法原理:這種方法的優(yōu)點是,需要一對特異性引物,,操作簡單,、檢測成本低。缺點是由于熒光染料非特異結合dsDNA產(chǎn)物,,無法正確區(qū)分目的產(chǎn)物,,尤其是染料結合引物二聚體易產(chǎn)生錯誤的擴增曲線,易形成誤判,。雖然在PCR擴增程序后添加熔解曲線分析,,可以方便判斷生成的熒光擴增曲線是否屬于目的產(chǎn)物,但是對于高靈敏度要求的實驗來說,,染料法并不是比較好的選擇。
制備DNA——解交聯(lián)和DNA純化現(xiàn)在含有目標蛋白質(zhì)的染色質(zhì)片段已分離,,需要解交聯(lián)并純化DNA,。解交聯(lián)通常采用高熱孵育和/或消化來完成。注意:此時可以停止ChIP,。經(jīng)過解交聯(lián)和/或DNA純化后,,可以將樣品于-20°C儲存。定量DNA——測定目標蛋白質(zhì)-DNA水平在該步驟中,,通過qPCR定量純化的DNA產(chǎn)物,,通過qPCR,您可以確定目標蛋白是否存在于特定位點,。ChIP的qPCR如何定量分析ChIP-qPCR 數(shù)據(jù)需要針對可變性來源進行標準化,,包括染色質(zhì)數(shù)量、免疫沉淀的效率(富集效率)和 DNA 回收率,。兩種常用的標準化 ChIP-qPCR 數(shù)據(jù)方法——Percent Input法和富集倍數(shù)法(Fold Enrichmen),。與input相關的ChIP-qPCR數(shù)據(jù)包括ChIP的背景水平和input染色質(zhì)的標準化。建議ChIP 實驗重復,,盡可能將結果與背景信號和標準誤差一起顯示,。經(jīng)熒光定量PCR儀器檢測后,對核酸進行定性和定量分析,。
1983年,,美國化學家Kary Mullis發(fā)明了聚合酶鏈反應技術(polymerase chain reaction,, PCR),這一技術將DNA聚合酶的特性結合核酸雙鏈的變性復性特性,,采用適溫延伸,、高溫變性以及低溫復性,讓目的核酸片段實現(xiàn)了特異性體外擴增,,可將極微量的目標DNA特異地擴增上百萬倍,,從而提高對DNA分子的分析和檢測靈敏度。尤其是耐熱DNA聚合酶的發(fā)現(xiàn),,更是極大地促進了PCR技術在分子生物學科研,,及臨床分子診斷領域的廣泛應用。常用的 PCR 技術包括逆轉(zhuǎn)錄PCR(Reverse Transcription PCR,,RT-PCR)和實時熒光定量PCR(Real-time Quantitative PCR,,qPCR)等。q225pcr無需參比染料,、無需定期校準,,更加簡化的操作流程與減輕的維護負擔只為更好地專注于實驗。佛山Quantagene q225mxqPCR儀采購
由于在PCR擴增的指數(shù)時期,,模板的Ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線性關系,,所以成為定量的依據(jù)。珠海高效qPCR儀儀器
TaqMan qPCR:該測定不使用嵌入染料,,而是使用帶有 5' 熒光報告染料和 3' 淬滅染料的 TaqMan 探針,。 這些探針是目標特異性的,并且在退火步驟中與引物之一下游的目標 DNA 序列結合,。 當 Taq 聚合酶在延伸階段遇到 TaqMan 探針時,,它會置換并切割 5' 報告染料。 一旦報告染料與淬滅染料分離,,其在每個 qPCR 循環(huán)結束時的可測量熒光信號就會顯著增加,。 第二條 DNA 鏈是平行合成的,但由于沒有探針附著在它上面,,因此無法通過熒光測量來監(jiān)測這一過程,。與 SYBR Green 檢測相比,使用 TaqMan 探針的成本更高,,但也具有兩個顯著優(yōu)勢:TaqMan 檢測測量目標序列的擴增進程,,因為探針是目標特異性的。您可以通過向主混合物中添加不同的引物和具有不同報告染料的 TaqMan 探針來監(jiān)測單個反應中各種 qPCR 產(chǎn)物的數(shù)量,。 這種多重方法允許您在每個熱循環(huán)結束時檢測多個熒光信號,。珠海高效qPCR儀儀器
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