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開(kāi)發(fā)一種新藥的過(guò)程可能是漫長(zhǎng),、復(fù)雜和不確定的,,但從社會(huì)、科學(xué)和經(jīng)濟(jì)的角度來(lái)看,,它也可能是高回報(bào)的,。高通量篩選(HTS)已經(jīng)成為藥物發(fā)現(xiàn)的主要工具。,,向大家介紹目前用于靶標(biāo)確認(rèn)的幾種HTS方法,,主要分為兩大類:生化水平和細(xì)胞水平。生化水平分析包括比率熒光法(FA/FP),、熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET),、時(shí)間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移(TR-FRET)等;細(xì)胞水平的分析包括細(xì)胞活力,、報(bào)告基因,、第二信使和高內(nèi)涵成像等。生化篩選利用純化的目標(biāo)蛋白,,在體外測(cè)定配體的結(jié)合或酶活性的抑制,。這些檢測(cè)通常在384孔板中以競(jìng)爭(zhēng)的形式進(jìn)行,其中所研究的化合物必須取代已知的配體或底物,。高通量篩選的特點(diǎn)是什么,。內(nèi)蒙古高通量篩選相關(guān)的實(shí)驗(yàn)
高通量篩選技術(shù)是指以分子水平和細(xì)胞水平的實(shí)驗(yàn)方法為基礎(chǔ),以微板形式作為實(shí)驗(yàn)工具載體,,以自動(dòng)化操作系統(tǒng)執(zhí)行試驗(yàn)過(guò)程,,以靈敏快速的檢測(cè)儀器采集實(shí)驗(yàn)結(jié)果數(shù)據(jù),以計(jì)算機(jī)分析處理實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),,在同一時(shí)間檢測(cè)數(shù)以千萬(wàn)的樣品,,并以得到的相應(yīng)數(shù)據(jù)庫(kù)支持運(yùn)轉(zhuǎn)的技術(shù)體系,它具有微量,、快速,、靈敏和準(zhǔn)確等特點(diǎn)。簡(jiǎn)言之就是可以通過(guò)一次實(shí)驗(yàn)獲得大量的信息,,并從中找到有價(jià)值的信息。高通量篩選時(shí)每天要對(duì)數(shù)以千萬(wàn)的樣品進(jìn)行檢測(cè),工作枯燥,,步驟單一,,操作人員容易疲勞、出錯(cuò),。自動(dòng)化操作系統(tǒng)由計(jì)算機(jī)及其操作軟件,、自動(dòng)化加樣設(shè)備、溫孵離心設(shè)備和堆棧4個(gè)部分組成,。自動(dòng)化操作系統(tǒng)代替人工操作顯然有諸多優(yōu)勢(shì),,它利用計(jì)算機(jī)通過(guò)操作軟件控制整個(gè)實(shí)驗(yàn)過(guò)程,編程過(guò)程簡(jiǎn)潔明了,。內(nèi)蒙古高通量篩選相關(guān)的實(shí)驗(yàn)高通量篩選的具備條件,。
根據(jù)計(jì)算原理,虛擬藥物篩選分為基于小分子結(jié)構(gòu)的篩選和基于藥物作用機(jī)理的篩選兩類,,前者通過(guò)對(duì)已知具有相同作用機(jī)理的化合物進(jìn)行定量構(gòu)效關(guān)系研究,,繪制出藥物的藥效團(tuán)模型,依照模型對(duì)化合物數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行搜索,,這種篩選技術(shù)本質(zhì)上是一種數(shù)據(jù)庫(kù)搜索技術(shù),;后者主要應(yīng)用分子對(duì)接技術(shù),實(shí)施這種篩選需要獲知藥物作用靶標(biāo)的分子結(jié)構(gòu),,通過(guò)分子模擬手段計(jì)算化合物庫(kù)中的小分子與靶標(biāo)結(jié)合的能力,,預(yù)測(cè)候選化合物的生理活性。 建立合理的藥效團(tuán)模型,、準(zhǔn)確測(cè)定或預(yù)測(cè)靶標(biāo)蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu),、精確和快速地計(jì)算候選化合物與靶標(biāo)相互作用的自由能變化是進(jìn)行虛擬藥物篩選的關(guān)鍵,也是限制虛擬篩選準(zhǔn)確性的瓶頸,。雖然虛擬篩選的準(zhǔn)確性有待提高,,但是其快速廉價(jià)的特點(diǎn)使之成為發(fā)展為迅速的藥物篩選技術(shù)之一。
微生物菌種的改造是現(xiàn)代微生物發(fā)酵行業(yè)中,,提高其工業(yè)化生產(chǎn)性能,,提高酶和菌的性能非常重要的一個(gè)環(huán)節(jié)。而快速高效的高通量篩選方法的建立又是菌株改造中非常重要的一個(gè)環(huán)節(jié),。以下介紹的是高通量快速篩選方法中一個(gè)環(huán)節(jié)的內(nèi)容,,如果想建立快速篩選方法,還需要有其他方面的工作要做,。何為高通量快速篩選方法,?就是通過(guò)將需要篩選的表型(高酶活,某種物質(zhì)的高產(chǎn)量)和一種能夠方便被人眼或者儀器快速識(shí)別并判斷高低的物質(zhì)或者信號(hào)想關(guān)聯(lián),,而建立起來(lái)的篩選方法,。高通量篩選藥物分析儀,。
熒光素和羅丹明等有機(jī)染料的壽命約為3-4ns,它們?cè)谶B接到分子量在0.5-10kDa范圍內(nèi)的生物分子時(shí)為敏感,?;诩?xì)胞水平的篩選的關(guān)鍵特征之一是可以一次篩選多個(gè)靶標(biāo)?;诩?xì)胞的篩選常用于以下情況下:1)所需的分子靶標(biāo)未知,,2)靶標(biāo)無(wú)法在生化測(cè)定中充分重組,3)所需的表型只存在于細(xì)胞環(huán)境中,,例如從一種細(xì)胞類型分化到另一種細(xì)胞類型,。基于細(xì)胞的檢測(cè)貫穿于藥物發(fā)現(xiàn)的所有階段:靶標(biāo)選擇和驗(yàn)證,、初步篩選,、先導(dǎo)化合物識(shí)別、先導(dǎo)化合物優(yōu)化以及安全和毒理學(xué)篩選,。介紹一些細(xì)胞水平分析的方法:細(xì)胞活力,、報(bào)告基因、第二信使和高內(nèi)涵成像等,。高通量篩選催化劑技術(shù),。安徽高通量篩選報(bào)價(jià)
高通量篩選樣品用量。內(nèi)蒙古高通量篩選相關(guān)的實(shí)驗(yàn)
正如之前提到,,在高通量篩選中Assay的檢出方法有很多,,用于衡量酶活性多的當(dāng)屬于熒光檢出法和吸光度檢出法。這兩種方法都能非常便捷的與高通量進(jìn)行匹配,。但是這兩種檢出方法也有不適用的場(chǎng)景,,比如吸光度檢出法,在終點(diǎn)法測(cè)定(endpointassay)時(shí),,如果化合物庫(kù)的吸收低于~410nm,,實(shí)驗(yàn)的背景吸收會(huì)引入假陽(yáng)性(false-positive)和假陰性(false-negative)結(jié)果。雖然假陽(yáng)性結(jié)果可以通過(guò)動(dòng)力學(xué)Assay或者驗(yàn)證Assay來(lái)解決,,但是由于微量定量板有位于340~410nm的強(qiáng)吸收,,所以仍舊會(huì)導(dǎo)致Z因子降低,直接結(jié)果就是較弱活性的苗頭化合物將很難被篩選出來(lái),。而對(duì)于熒光檢出法而言,,自發(fā)熒光化合物庫(kù)或者具有光敏特性的化合物庫(kù)同樣會(huì)遇到假陽(yáng)性和假陰性結(jié)果。在某種程度上,,選擇合適的檢出方法可以減少甚至避免上述問(wèn)題,,比如使用更長(zhǎng)波段的光源,對(duì)于熒光檢出來(lái)說(shuō),,>500nm會(huì)是比較好的選擇,。內(nèi)蒙古高通量篩選相關(guān)的實(shí)驗(yàn)