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天津霉菌高通量篩選

來源: 發(fā)布時間:2022-09-13

高通量篩選時每天要對數(shù)以千萬的樣品進(jìn)行檢測,工作枯燥,,步驟單一,操作人員容易疲勞,、出錯,。自動化操作系統(tǒng)由計(jì)算機(jī)及其操作軟件、自動化加樣設(shè)備,、溫孵離心設(shè)備和堆棧4個部分組成,。自動化操作系統(tǒng)代替人工操作顯然有諸多優(yōu)勢,它利用計(jì)算機(jī)通過操作軟件控制整個實(shí)驗(yàn)過程,,編程過程簡潔明了,。微量篩選系統(tǒng) 由于高通量篩選采用的是細(xì)胞、分子水平的篩選模型.樣品用量一般在微克級(μg),,節(jié)省了樣品資源,,奠定了“一藥多篩”的物質(zhì)基礎(chǔ),同時節(jié)省了實(shí)驗(yàn)材料,,降低了單藥篩選成本,。高通量篩選技術(shù)的應(yīng)用。天津霉菌高通量篩選

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開發(fā)一種新藥的過程可能是漫長,、復(fù)雜和不確定的,,但從社會、科學(xué)和經(jīng)濟(jì)的角度來看,,它也可能是高回報(bào)的,。高通量篩選(HTS)已經(jīng)成為藥物發(fā)現(xiàn)的主要工具。,,向大家介紹目前用于靶標(biāo)確認(rèn)的幾種HTS方法,,主要分為兩大類:生化水平和細(xì)胞水平。生化水平分析包括比率熒光法(FA/FP),、熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET),、時間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移(TR-FRET)等;細(xì)胞水平的分析包括細(xì)胞活力,、報(bào)告基因,、第二信使和高內(nèi)涵成像等,。生化篩選利用純化的目標(biāo)蛋白,在體外測定配體的結(jié)合或酶活性的抑制,。這些檢測通常在384孔板中以競爭的形式進(jìn)行,,其中所研究的化合物必須取代已知的配體或底物。熒光法由于其使用簡便,、靈敏度高和靈活性強(qiáng)等特點(diǎn),,廣受科研人員的歡迎,主要有比率熒光法(FA/FP),、熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET),、時間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移(TR-FRET)。西藏酶的高通量篩選微流控高通量篩選技術(shù),。

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正如之前提到,,在高通量篩選中Assay的檢出方法有很多,用于衡量酶活性多的當(dāng)屬于熒光檢出法和吸光度檢出法,。這兩種方法都能非常便捷的與高通量進(jìn)行匹配,。但是這兩種檢出方法也有不適用的場景,比如吸光度檢出法,,在終點(diǎn)法測定(endpointassay)時,,如果化合物庫的吸收低于~410nm,實(shí)驗(yàn)的背景吸收會引入假陽性(false-positive)和假陰性(false-negative)結(jié)果,。雖然假陽性結(jié)果可以通過動力學(xué)Assay或者驗(yàn)證Assay來解決,,但是由于微量定量板有位于340~410nm的強(qiáng)吸收,所以仍舊會導(dǎo)致Z因子降低,,直接結(jié)果就是較弱活性的苗頭化合物將很難被篩選出來,。而對于熒光檢出法而言,自發(fā)熒光化合物庫或者具有光敏特性的化合物庫同樣會遇到假陽性和假陰性結(jié)果,。在某種程度上,,選擇合適的檢出方法可以減少甚至避免上述問題,比如使用更長波段的光源,,對于熒光檢出來說,,>500nm會是比較好的選擇。

作者通過對酶抑制劑的高通量篩選的總結(jié),,揭示了當(dāng)下的新藥發(fā)展的病癥主要圍繞,、細(xì)菌和病毒,研究靶標(biāo)也以激酶,、磷酸化酶,、肽酶等為主要的研究點(diǎn)。作為當(dāng)下主流的Assay方法,基于熒光的Assay在新藥發(fā)現(xiàn)中起到非常重要的作用,。作者還通過對73個苗頭化合物到先導(dǎo)化合物的優(yōu)化和結(jié)構(gòu)改性案例分析,,印證了類藥五原則的重要指導(dǎo)意義,也提煉了特殊環(huán)系在新藥發(fā)現(xiàn)中的重要作用,。另外,,也總結(jié)了影響苗頭化合物檢出率的其他重要因素,包括Z因子,、化合物庫質(zhì)量,、假陽性化合物的甄別以及選取合適的Assay檢出方法。這對藥物篩選和后期優(yōu)化,,具有非常大的指導(dǎo)意義,。高通量篩選技術(shù)的方法有哪些。

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高通量藥物篩選的一個基本假設(shè)是:只要嘗試了足夠多的化合物,,總能找到一個具有某種生化活性的化合物,。篩選的化合物越多,獲得具有良好生化活性的先導(dǎo)化合物的機(jī)率就越大,。因此,,一個龐大的化合物庫也是高通量篩選不可或缺的部分,。藥物研發(fā)與開發(fā)是一個復(fù)雜與漫長的過程,,特別是小分子藥物的研發(fā),其難點(diǎn)和關(guān)鍵在于如何快速高效的找到先導(dǎo)化合物(LeadCompound),。采用高通量藥物篩選(High-throughputscreening,,HTS)來發(fā)現(xiàn)新的先導(dǎo)化合物仍然是小分子藥物研發(fā)的優(yōu)先。高通量篩選催化劑技術(shù),。西藏酶的高通量篩選

高通量篩選的實(shí)驗(yàn)方案,。天津霉菌高通量篩選

化合物庫的質(zhì)量包括三個方面:多樣性、有效濃度,、化合物庫大小,。化合物庫的多樣性制約著苗頭化合物的新穎性,,而化合物的有效濃度則影響著活性化合物的檢出概率,。因此化合物庫的多樣性越大,化合物的有效濃度越高意味著苗頭化合物檢出率更有保證,。但是兩者之前需要有一個平衡,,一個化合物庫里單一化合物簇(Cluster)維持在4~12個化合物的時候,多樣性和有效濃度都能得到保障,。另外,,對于化合物庫大小而言,理論情況下(基于多樣性、有效濃度以及靶點(diǎn)的成藥難度基本一致的隨機(jī)篩選而言),,大的化合物庫有利于發(fā)現(xiàn)更多的苗頭化合物,。但是基于此次有限的匯總數(shù)據(jù)來看(有4個化合物庫達(dá)到了百萬級(0.6M~1.8M)),定向化合物庫(FocusLibrary)(圖七中紅色圈部分)由于其自身的特點(diǎn)檢出率較好,,而大的化合物庫并沒有帶來更高的苗頭化合物檢出率以及更高質(zhì)量的苗頭化合物天津霉菌高通量篩選

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