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遼寧itraq定量蛋白組學(xué)技術(shù)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-09-20

2022年2月,亞特蘭大埃默里大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Erik C. B. Johnson課題組在Nature neuroscience發(fā)表了題為 “Large-scale deep multi-layer analysis of Alzheimer’s disease brain reveals strong proteomic disease-related changes not observed at the RNA level”的研究成果,,通過基因組學(xué),、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué),、代謝組學(xué)的研究方法,,揭示了新的與AD相關(guān)的蛋白共表達(dá)模塊,部分模塊在RNA的網(wǎng)絡(luò)中不存在,。這為開發(fā)疾病***的潛在靶點(diǎn)提供依據(jù),,為臨床的蛋白質(zhì)組研究提供重要價(jià)值。蛋白質(zhì)組學(xué),修飾蛋白質(zhì)組,蛋白·修飾·代謝,。遼寧itraq定量蛋白組學(xué)技術(shù)

蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法研究案例:2021年10月,,中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在Ecotoxicology and Environmental Safety發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)對成肌細(xì)胞分化的影響,,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細(xì)胞骨架蛋白和細(xì)胞外基質(zhì)蛋白表達(dá)下調(diào),并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號(hào)通路的機(jī)理,,為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù),。山東蛋白組學(xué)雜志4D-蛋白組+代謝組雙平臺(tái)知識(shí)干貨帶您。

4D蛋白組學(xué):tims TOF Pro2依賴于雙捕集離子淌度(TIMS)和同步累積連續(xù)碎裂(PASEF)數(shù)據(jù)采集模式兩大創(chuàng)新技術(shù),,可實(shí)現(xiàn)快速采集,、更高的靈敏度和特異性。同時(shí),,其配備了***一代雙 TIMS 分析器,,離子容量可提高三倍,比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度,,讓蛋白質(zhì)組學(xué)分析再上一個(gè)新的臺(tái)階,,鹿明生物同時(shí)配備了Evosep One高通量色譜使其在短梯度下也能實(shí)現(xiàn)蛋白深度覆蓋,,結(jié)果更精細(xì),也成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具,。更高掃描速度:助力臨床大隊(duì)列項(xiàng)目研究,更高覆蓋深度:助力蛋白組鑒定到更多的蛋白數(shù)量,,超高靈敏度:助力微量樣本蛋白組分析,,鑒定更可信:助力蛋白或化合物更高可信度的鑒定。

使用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析,,與GFP-群體相比,,在GFP+細(xì)胞中TM處理后,線粒體復(fù)合物IV的多個(gè)亞基被特異性下調(diào),,對下調(diào)的蛋白質(zhì)進(jìn)行基因本體 (GO)分析,,顯示參與線粒體電子傳遞鏈 (ETC) 的通路富集。同時(shí)作者還分析了從人 LM2 細(xì)胞系中分選的 LM2 GFP+和 GFP- 細(xì)胞,,在 TM 處理 48 小時(shí)后蛋白組學(xué)分析,,揭示了GFP+細(xì)胞優(yōu)先富集,同時(shí)揭示了線粒體 ETC 相關(guān)的通路,。因此,,TM 處理特別影響具有更高細(xì)胞內(nèi)銅水平的 SOX2/OCT4+ 細(xì)胞中的線粒體 ETC 通路。蛋白質(zhì)組學(xué)分析確定了富含線粒體功能的途徑,。細(xì)胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一種線粒體金屬酶,,是線粒體ETC的終末酶。蛋白組學(xué)方案為組學(xué)研究涉及的樣本獲取,前處理,數(shù)據(jù)采集到分析的各個(gè)環(huán)節(jié)提供自動(dòng)化,。

通過蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定,、PRM靶向鑒定、iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)等研究方法,,發(fā)現(xiàn)了N-豆蔻?;诟闻K**發(fā)生中發(fā)揮重要作用,揭示了NMT1的N-豆蔻?;种瓶?*發(fā)生的NDP,,并通過干擾泛素化來刺激促**發(fā)生的NUP機(jī)制。為靶向N-豆蔻?;蚇MT1可能有助于***肝*提供了理論依據(jù),。中文標(biāo)題:NMT1依賴于POTEE發(fā)生N-豆蔻酰化并通過差異調(diào)節(jié)靶標(biāo)的泛素化來刺激肝臟**的發(fā)生研究對象:細(xì)胞,、小鼠,、人**組織發(fā)表期刊:FrontiersinOncology影響因子:6.244發(fā)表時(shí)間:2021年5月合作單位:上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心運(yùn)用生物技術(shù):iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、PRM靶向驗(yàn)證,、質(zhì)譜鑒定,、qRT-PCR,、IHC、WB,、IP文章中iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持蛋白質(zhì)組學(xué)測序 蛋白組學(xué)技術(shù)缺點(diǎn),。山東蛋白組學(xué)雜志

蛋白組學(xué)檢測一個(gè)樣多少錢。遼寧itraq定量蛋白組學(xué)技術(shù)

在本研究中,,利用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)方法對東京野茉莉種子發(fā)育的4個(gè)時(shí)間點(diǎn)采樣進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析,。獲得了2338個(gè)蛋白和1473個(gè)DEPs。Mfuzz聚類分析顯示,,在種子發(fā)育過程中,,轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)組之間存在相當(dāng)大的時(shí)序一致性。在四個(gè)發(fā)育時(shí)期中,,花后70天(種子發(fā)育活躍期)是視為東京野茉莉種仁發(fā)育的關(guān)鍵時(shí)期:在該階段與脂肪酸生物合成相關(guān)的功能基因和酶蛋白均達(dá)到表達(dá)峰值,,同時(shí)種仁內(nèi)部大部分營養(yǎng)物質(zhì)開始迅速積累。通過轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)綜合分析油脂合成的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),,乙酰CoA羧化酶和**酸脫氫酶兩個(gè)酶體系處于中心位置,,在脂肪酸的合成過程中具有主導(dǎo)作用。遼寧itraq定量蛋白組學(xué)技術(shù)

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