有哪些技術(shù)手段可以進(jìn)行空間轉(zhuǎn)錄組研究？已發(fā)表的關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide-seq , LCM-seq , seqFISH, MERFISH , Liver single cell zonation , Geo-seq and Tomo-seq,。這些方法或是在細(xì)胞數(shù)量上限制較大,，或是存在有效測(cè)序深度不足等問(wèn)題。10x Genomics公司提供的Visium空間基因表達(dá)解決方案是目前較好的一個(gè)高通量空間轉(zhuǎn)錄組的商業(yè)化解決方案,。該解決方案可以輕松地將空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)應(yīng)用到組織切片和染色的標(biāo)準(zhǔn)方法中,，從而研究空間分辨率下整個(gè)轉(zhuǎn)錄組mRNA的表達(dá)情況，同時(shí)在同一組織切片中獲得組織學(xué)相關(guān)信息,。研究通過(guò)對(duì) ALS 小鼠疾病進(jìn)程（癥狀前,、發(fā)病、癥狀期和終末期）的脊髓組織進(jìn)行空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,。吉林歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組規(guī)格

10xVisium空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理為將新鮮冷凍的組織切片,，置于文庫(kù)制備載玻片上，經(jīng)過(guò)固定,、染色和透化后，釋放出mRNA,，mRNA與空間條形碼捕獲探針相結(jié)合,，從而捕獲基因表達(dá)信息。然后將捕獲的mRNA合成cDNA并制備測(cè)序文庫(kù)進(jìn)行測(cè)序,，并對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行可視化分析,?？臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)作為當(dāng)今**前沿的科研技術(shù)，相信很多老師都希望將其運(yùn)用于自己的課題中,，快速發(fā)表高分文章,。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn)，致力通過(guò)質(zhì)量的服務(wù),，助力各位科研工作者取得新的突破,。天津空間轉(zhuǎn)錄組報(bào)價(jià)對(duì)于 EDA 以外的任務(wù)，用戶仍然經(jīng)常需要學(xué)習(xí)新的語(yǔ)法,，轉(zhuǎn)換對(duì)象類型,，空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)仍然面臨許多挑戰(zhàn)。

空間基因表達(dá)技術(shù)能夠在保留空間背景信息的同時(shí),，多方位測(cè)量轉(zhuǎn)錄組譜,。然而，現(xiàn)有的分析方法并沒(méi)有解決技術(shù)分辨率有限或有效利用空間信息的問(wèn)題,。來(lái)自美國(guó)的科研團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了BayesSpace,，這是一種完全貝葉斯統(tǒng)計(jì)方法，它使用來(lái)自空間鄰域的信息來(lái)增強(qiáng)空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分辨率并進(jìn)行聚類分析,。BayeSpace通過(guò)使用的Bioconductor SingleCellExperiment數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)將預(yù)處理數(shù)據(jù)作為輸入,，無(wú)縫集成到空間轉(zhuǎn)錄組分析工作流中，輸出同樣存儲(chǔ)在SingleCellExperiment對(duì)象中,，該對(duì)象可用于下游分析,。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn)，致力通過(guò)質(zhì)量的服務(wù),，助力各位科研工作者取得新的突破,。

高通量空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)的處理和分析需要新穎的方法和工具支撐，尤其是在預(yù)處理,、scRNA-seq 數(shù)據(jù)的空間重構(gòu),、基于微陣列數(shù)據(jù)的細(xì)胞類型去卷積、空間高變基因的識(shí)別,、細(xì)胞間相互作用的推導(dǎo)等,。scRNA-seq 技術(shù)的進(jìn)步啟發(fā)了利用高分辨率轉(zhuǎn)錄組定量分析與空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)的互補(bǔ)性質(zhì)的新方法。對(duì)于未進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的 smFISH 和 ISS 數(shù)據(jù),，可通過(guò) scRNA-seq 數(shù)據(jù)估算空間數(shù)據(jù)中未分析的基因的表達(dá)模式,。此外，“空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)”這一術(shù)語(yǔ)的變體,，也用于描述將轉(zhuǎn)錄本定位到細(xì)胞器的技術(shù)（例如 APEX-seq）,，盡管該技術(shù)沒(méi)有記錄任何空間坐標(biāo)。只聽(tīng)名字就想嘗試，不清楚空間轉(zhuǎn)錄組的原理及通過(guò)該技術(shù)究竟能拿到什么結(jié)果,。

美國(guó)腦計(jì)劃啟動(dòng)的 BICCN 項(xiàng)目,，該項(xiàng)目將整合不同類型細(xì)胞的分子、解剖學(xué)和生理學(xué)特性,，創(chuàng)建小鼠腦細(xì)胞 3D 參考圖譜,，同時(shí)也將基于人類和非人類靈長(zhǎng)類腦組織樣本，繪制腦細(xì)胞參考圖譜 ,，其涉及空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)主要包括 MERFISH 和 seqFISH,。一些實(shí)現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的重要技術(shù)，可以追溯到二十世紀(jì)七十年代,，長(zhǎng)期以來(lái),，各種形式的原位雜交技術(shù)（ISH）已用于可視化空間中的基因表達(dá)。從技術(shù)原理中不難看出,，空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)重要為特殊的載玻片,。空間轉(zhuǎn)錄組可以進(jìn)行細(xì)胞間通訊分析,，區(qū)別在于空間位置信息可以同時(shí)用于識(shí)別潛在的細(xì)胞間相互作用,。海南歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組規(guī)格

空間轉(zhuǎn)錄組樣本的組織切片的細(xì)胞中會(huì)釋放出mRNA，遷移到每個(gè)spot的mRNA會(huì)被標(biāo)記上相應(yīng)的barcode序列,。吉林歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組規(guī)格

1. 10x  Genomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫(kù)構(gòu)建的每張載玻片上有四個(gè)捕獲區(qū)域,，每個(gè)捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個(gè)被條形碼標(biāo)記的點(diǎn)（barcoded spots）,，每個(gè)點(diǎn)的直徑為55 μm,，點(diǎn)和點(diǎn)之間中心的距離為100 μm，并且每個(gè)點(diǎn)都有一個(gè)barcode序列,。10X Visium空間轉(zhuǎn)錄組的實(shí)驗(yàn)主要分為兩部分：組織學(xué)板塊和組學(xué)板塊,。組織學(xué)板塊包括樣品的包埋、切片,、固定,、染色及成像，記錄切片的形態(tài)學(xué)信息,；組學(xué)板塊包括cDNA的合成,、擴(kuò)增、接頭連接和測(cè)序,，記錄切片的轉(zhuǎn)錄本信息和空間位置信息 ,。吉林歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組規(guī)格

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司位于聯(lián)航路1188號(hào)25幢，交通便利,，環(huán)境優(yōu)美,，是一家服務(wù)型企業(yè),。歐易生物是一家私營(yíng)合伙企業(yè)企業(yè),，一直“以人為本,，服務(wù)于社會(huì)”的經(jīng)營(yíng)理念;“誠(chéng)守信譽(yù)，持續(xù)發(fā)展”的質(zhì)量方針,。公司始終堅(jiān)持客戶需求優(yōu)先的原則,，致力于提供高質(zhì)量的科研服務(wù)，科研檢測(cè),，學(xué)術(shù)研究,，技術(shù)咨詢。歐易生物順應(yīng)時(shí)代發(fā)展和市場(chǎng)需求,，通過(guò)**技術(shù),，力圖保證高規(guī)格高質(zhì)量的科研服務(wù)，科研檢測(cè),，學(xué)術(shù)研究,，技術(shù)咨詢。