有哪些技術手段可以進行空間轉錄組研究,？已發(fā)表的關于空間轉錄組技術有Slide-seq , LCM-seq , seqFISH, MERFISH , Liver single cell zonation , Geo-seq and Tomo-seq。這些方法或是在細胞數(shù)量上限制較大,，或是存在有效測序深度不足等問題,。10x Genomics公司提供的Visium空間基因表達解決方案是目前較好的一個高通量空間轉錄組的商業(yè)化解決方案。該解決方案可以輕松地將空間轉錄組學技術應用到組織切片和染色的標準方法中,，從而研究空間分辨率下整個轉錄組mRNA的表達情況，同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息?？臻g轉錄組組織學板塊包括樣品的包埋、切片,、固定,、染色及成像，記錄切片的形態(tài)學信息,?？臻g轉錄組多少錢

1. 10x Genomics公司提供的Visium空間基因表達解決方案是目前可選的一個高通量空間轉錄組的商業(yè)化解決方案。該解決方案可以輕松地將空間轉錄組學技術應用到組織切片和染色的標準方法中,，從而研究空間分辨率下整個轉錄組mRNA的表達情況,，同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息,。空間轉錄組是一項前沿技術,，涉及到很多細節(jié)方面的準備工作,，例如組織類型的選擇、前期預實驗的設計,、病理區(qū)域的確認等一系列內容,。而且實驗中存在很多不確定性因素，處理不慎容易導致整個項目失敗,。海南空間轉錄組空間轉錄組使得在mRNA樣品處理和后續(xù)測序過程中位置信息的編碼和獲取成為可能,。

BayesSpace是一種基于空間轉錄組模型的聚類方法，通過對基因表達矩陣的低維表示進行建模并通過空間先驗鼓勵相鄰點屬于同一簇來實現(xiàn)空間聚類,。與以前的方法相比,，BayesSpace允許對聚類結構和錯誤項進行更靈活的規(guī)范。BayeSpace通過***使用的Bioconductor SingleCellExperiment數(shù)據(jù)結構將預處理數(shù)據(jù)作為輸入,，無縫集成到空間轉錄組分析工作流中,，輸出同樣存儲在SingleCellExperiment對象中，該對象可用于下游分析,。BayesSpace增強的空間聚類提供了一個更高分辨率的組織類型圖,。值得注意的是，增強后的空間聚類識別了沿**邊界的淋巴組織區(qū)域和可能的免疫浸潤到**中的區(qū)域,，這些區(qū)域在原來的分辨率下是無法辨別的,。

1. 空間轉錄組是一種用于從空間層面上解析RNA-seq數(shù)據(jù)的技術，從而解析單個組織切片中的所有mRNA,?？臻g轉錄組的條形碼逆轉錄oligo(dT)引物在顯微鏡載玻片表面的有序附著，空間轉錄組使得在mRNA樣品處理和后續(xù)測序過程中位置信息的編碼和獲取成為可能,。單細胞RNA測序或組織樣本RNA測序,，均無法為研究人員提供精確的空間信息。通過空間轉錄組技術可獲取組織中具體的位置的轉錄信息,，為研究和診斷提供有效數(shù)據(jù)支撐,。10x Genomics空間轉錄組技術可以應用于免疫、發(fā)育,、神經(jīng)和病理等研究方向,。空間轉錄組學和 10X Visium 依靠這種微陣列技術,，區(qū)別在于微陣列載玻片上的組織上的轉錄本信息,。

Visium空間轉錄組能夠做何種組織類型以及推薦切片厚度是什么？10X Genomics測試過很多組織類型，絕大多數(shù)都可以用于空間轉錄組的分析,。下圖是他們官網(wǎng)上測試過的組織類型的列表,，測試過的組織都可以運用在空間轉錄組的分析上面。但建議用戶用基因表達玻片做正式實驗前,，務必用組織優(yōu)化的玻片測試一下,，看組織能否用于空間轉錄組的實驗，同時也找到比較好的組織通透時間,。切片厚度基本上以10μm為主,，但也有少量組織例外。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗,，致力通過質量的服務,，助力各位科研工作者取得新的突破。研究通過對 ALS 小鼠疾病進程（癥狀前,、發(fā)病,、癥狀期和終末期）的脊髓組織進行空間轉錄組測序。山西生物技術空間轉錄組

除了皮膚,、胰腺和骨頭組織外,，其余樣本類型均可開展10x Genomics空間轉錄組研究?？臻g轉錄組多少錢

本文利用空間轉錄組學研究了在AD小鼠模型中,，淀粉樣斑塊周圍直徑為100mm的組織域中發(fā)生的轉錄變化。發(fā)現(xiàn)了富含髓鞘和少突膠質細胞基因（OLIGs）的基因共表達網(wǎng)絡的早期改變,，而斑塊誘導的基因（PIGs）的多細胞基因共表達網(wǎng)絡涉及補體系統(tǒng),、氧化應激、溶酶體和炎癥,，在疾病的后期非常突出,。此外作者通過對小鼠和人腦切片進行原位測序（ISS），證實了大多數(shù)觀察到的細胞水平的變化,?？臻g轉錄組學分析為探究AD和其他腦部疾病致病特征附近失調的細胞網(wǎng)絡提供了可能?？臻g轉錄組多少錢

上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司發(fā)展規(guī)模團隊不斷壯大,，現(xiàn)有一支專業(yè)技術團隊,，各種專業(yè)設備齊全,。專業(yè)的團隊大多數(shù)員工都有多年工作經(jīng)驗，熟悉行業(yè)專業(yè)知識技能,，致力于發(fā)展歐易生物的品牌,。公司以用心服務為重點價值，希望通過我們的專業(yè)水平和不懈努力，將檢驗檢測服務,。（依法須經(jīng)批準的項目,，經(jīng)相關部門批準后方可開展經(jīng)營活動，具體經(jīng)營項目以相關部門批準文件或許可證件為準）一般項目：生物醫(yī)藥產(chǎn)品,、生化產(chǎn)品的研發(fā),，醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品（除危險品化學品,、監(jiān)控化學品,、易制毒化學品）的研發(fā)、銷售,，儀器儀表的銷售,，并提供相關技術咨詢、技術服務,，會務服務,，企業(yè)管理咨詢。等業(yè)務進行到底,。上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司主營業(yè)務涵蓋科研服務,，科研檢測，學術研究,，技術咨詢,，堅持“質量保證、良好服務,、顧客滿意”的質量方針,，贏得廣大客戶的支持和信賴。