空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)作為當(dāng)今前沿的科研技術(shù),，相信很多老師都希望將其運用于自己的課題中，快速發(fā)表高分文章。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗,，致力通過質(zhì)量的服務(wù),，助力各位科研工作者取得新的突破。由上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司（以下簡稱“歐易生物”）主辦的“空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)培訓(xùn)班”落下帷幕,。培訓(xùn)中,，歐易講師團隊以其豐富的項目經(jīng)驗及專業(yè)的生信能力，從空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的發(fā)展歷程,、測序原理,、實驗實操及數(shù)據(jù)挖掘等多維度,，向遠道而來的學(xué)員們展開了系統(tǒng)性的培訓(xùn),。

Cell上發(fā)表了一篇利用空間轉(zhuǎn)錄組解析人鱗狀細胞*的文章。品質(zhì)空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域

轉(zhuǎn)錄本的空間位置信息可以通過在原位陣列上捕獲的組織切片中的轉(zhuǎn)錄本來獲取,，目前已有多種技術(shù)策略被開發(fā)報道,， 如空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)（Spatial Transcriptomics，ST）和 Visium 技術(shù),，通過將包含空間位置信息的條形碼,、UMI 標(biāo)簽、poly-dT 的探針固定在商用微陣列載玻片上,，來捕獲包含 poly(A) 尾巴的轉(zhuǎn)錄本,，并獲取全轉(zhuǎn)錄組水平的基因表達及位置信息。一些無需成像即可計算重建空間基因表達模式所需信息的技術(shù)也被開發(fā)了出來,，其中之一就是是 DNA 顯微技術(shù),，它記錄 cDNA 之間的接近度，該信息可用于重建轉(zhuǎn)錄本之間的相對位置,。貴州歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組對于 EDA 以外的任務(wù),，用戶仍然經(jīng)常需要學(xué)習(xí)新的語法，轉(zhuǎn)換對象類型,，空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)仍然面臨許多挑戰(zhàn),。

空間轉(zhuǎn)錄組的方法和技術(shù)有哪些？廣義上講,，現(xiàn)有的生成空間分辨轉(zhuǎn)錄組學(xué)的方法可分為四類：用于空間重建的計算策略和組學(xué)實驗的組合,，使用激光捕獲顯微切割（LCM）結(jié)合高通量進行直接測量，使用熒光物質(zhì)的基于圖像的原位轉(zhuǎn)錄組學(xué) ,，以及基于寡核苷酸的空間條形碼再加上高通量,。每種方法都有其優(yōu)點和缺點?？臻g重構(gòu)的計算策略：這種計算方法可以充分利用內(nèi)在基因表達模式或共表達的趨勢,，從單個細胞的大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中重構(gòu)細胞間的環(huán)境。然而，這些推論方法在某些情況下*呈現(xiàn)空間趨勢或特定組織的總體布局,?；贚CM的方法：基于LCM的轉(zhuǎn)錄組學(xué)或基因組學(xué)成功地獲得了單個細胞的空間轉(zhuǎn)錄組，盡管其通量很低,，但是在可以標(biāo)記成千上萬個單個細胞位置的多路復(fù)用條形碼策略可行之前,，將少量細胞的數(shù)據(jù)粗略地整合到構(gòu)成***的巨大背景中，可能具有一定價值,?；趫D像的原位轉(zhuǎn)錄組學(xué)：基于圖像的原位轉(zhuǎn)錄組學(xué)在很大程度上增加了可檢測區(qū)域，但也存在一些問題,，例如幾種smFISH方法很難從包括信號干擾,、轉(zhuǎn)錄本積累等復(fù)雜背景中提取單個細胞?？臻g條形碼加高通量：費用較高且無法在單個細胞中獲得轉(zhuǎn)錄組,。

空間轉(zhuǎn)錄組的一般流程2。這使得在后續(xù)步驟中覆蓋細胞組織圖像和基因表達數(shù)據(jù)成為可能,。用我們的滲透試劑對組織進行滲透,，這意味著在細胞膜上形成小孔。RNA分子可以通過這些通道離開細胞,，并與芯片上相鄰的捕獲探針結(jié)合,。因此，基因表達信息被捕獲在芯片上,。需要通過以下步驟將捕獲的RNA分子中存儲的信息轉(zhuǎn)換為數(shù)據(jù),。cDNA合成是為了創(chuàng)造穩(wěn)定的雙鏈DNA分子。這是必要的,，因為cdna - rna -雜交體的降解速度很快,。此外，這是構(gòu)建可測序文庫之前的必要步驟,。所有之前收集的信息都被匯集起來,，可以在線訪問。這意味著在實踐中,，您可以查看組織切片的圖像并選擇組織中的不同區(qū)域,。然后你可以確定哪些基因在這些區(qū)域中以什么數(shù)量表達。因此,，你可以在一個單一的實驗中進行新分析,。空間轉(zhuǎn)錄組這對于發(fā)育生物學(xué)等眾多領(lǐng)域的研究都具有重要的意義,。

歐易生物高級技術(shù)支持陳老師首先給大家介紹了空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的發(fā)展歷程,、測序流程及原理,。緊接著，歐易生物技術(shù)支持姚老師針對目前空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)發(fā)表的一系列高分文章進行了方案設(shè)計的解析,。姜老師給大家詳細介紹了空間轉(zhuǎn)錄組項目樣本準(zhǔn)備,、切片、貼片等實驗過程及注意事項,，并帶領(lǐng)大家到實驗室實地觀摩了整個實驗過程,，并就其中細節(jié)進行了講解。董老師針對空間轉(zhuǎn)錄組10x Space Ranger的分析原理及結(jié)果進行了詳細解析,，并介紹了使用Seurat包進行數(shù)據(jù)挖掘的標(biāo)準(zhǔn)分析流程,。了解空間轉(zhuǎn)錄組樣本準(zhǔn)備注意事項。廣西生物技術(shù)空間轉(zhuǎn)錄組

本次培訓(xùn)班旨在跟廣大科研工作者介紹空間轉(zhuǎn)錄組的研究熱點和方案設(shè)計,。品質(zhì)空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域

 空間重構(gòu)的計算策略：這種計算方法可以充分利用內(nèi)在基因表達模式或共表達的趨勢,，從單個細胞的大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中重構(gòu)細胞間的環(huán)境。然而,，這些推論方法在某些情況下*呈現(xiàn)空間趨勢或特定組織的總體布局,?；贚CM的方法：基于LCM的轉(zhuǎn)錄組學(xué)或基因組學(xué)成功地獲得了單個細胞的空間轉(zhuǎn)錄組,，盡管其通量很低，但是在可以標(biāo)記成千上萬個單個細胞位置的多路復(fù)用條形碼策略可行之前,，將少量細胞的數(shù)據(jù)粗略地整合到構(gòu)成***的巨大背景中,，可能具有一定價值?；趫D像的原位轉(zhuǎn)錄組學(xué)：基于圖像的原位轉(zhuǎn)錄組學(xué)在很大程度上增加了可檢測區(qū)域,，但也存在一些問題，例如幾種smFISH方法很難從包括信號干擾,、轉(zhuǎn)錄本積累等復(fù)雜背景中提取單個細胞,。空間條形碼加高通量：費用較高且無法在單個細胞中獲得轉(zhuǎn)錄組,。品質(zhì)空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司專注技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)品研發(fā),，發(fā)展規(guī)模團隊不斷壯大。公司目前擁有專業(yè)的技術(shù)員工,，為員工提供廣闊的發(fā)展平臺與成長空間,，為客戶提供高質(zhì)的產(chǎn)品服務(wù)，深受員工與客戶好評,。誠實,、守信是對企業(yè)的經(jīng)營要求，也是我們做人的基本準(zhǔn)則,。公司致力于打造***的科研服務(wù),，科研檢測,，學(xué)術(shù)研究，技術(shù)咨詢,。公司力求給客戶提供全數(shù)良好服務(wù),，我們相信誠實正直、開拓進取地為公司發(fā)展做正確的事情,，將為公司和個人帶來共同的利益和進步,。經(jīng)過幾年的發(fā)展，已成為科研服務(wù),，科研檢測,，學(xué)術(shù)研究，技術(shù)咨詢行業(yè)出名企業(yè),。