空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)作為當今前沿的科研技術(shù),，相信很多老師都希望將其運用于自己的課題中，快速發(fā)表高分文章,。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗,，致力通過質(zhì)量的服務(wù)，助力各位科研工作者取得新的突破,。由上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司（以下簡稱“歐易生物”）主辦的“空間轉(zhuǎn)錄組學培訓班”落下帷幕,。培訓中，歐易講師團隊以其豐富的項目經(jīng)驗及專業(yè)的生信能力,，從空間轉(zhuǎn)錄組學的發(fā)展歷程,、測序原理、實驗實操及數(shù)據(jù)挖掘等多維度,，向遠道而來的學員們展開了系統(tǒng)性的培訓,。

Cell上發(fā)表了一篇利用空間轉(zhuǎn)錄組解析人鱗狀細胞*的文章。品質(zhì)空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域

轉(zhuǎn)錄本的空間位置信息可以通過在原位陣列上捕獲的組織切片中的轉(zhuǎn)錄本來獲取,，目前已有多種技術(shù)策略被開發(fā)報道,， 如空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)（Spatial Transcriptomics,，ST）和 Visium 技術(shù)，通過將包含空間位置信息的條形碼,、UMI 標簽,、poly-dT 的探針固定在商用微陣列載玻片上，來捕獲包含 poly(A) 尾巴的轉(zhuǎn)錄本,，并獲取全轉(zhuǎn)錄組水平的基因表達及位置信息,。一些無需成像即可計算重建空間基因表達模式所需信息的技術(shù)也被開發(fā)了出來，其中之一就是是 DNA 顯微技術(shù),，它記錄 cDNA 之間的接近度,，該信息可用于重建轉(zhuǎn)錄本之間的相對位置。貴州歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組對于 EDA 以外的任務(wù),，用戶仍然經(jīng)常需要學習新的語法,，轉(zhuǎn)換對象類型，空間轉(zhuǎn)錄組學仍然面臨許多挑戰(zhàn),。

空間轉(zhuǎn)錄組的方法和技術(shù)有哪些,？廣義上講,，現(xiàn)有的生成空間分辨轉(zhuǎn)錄組學的方法可分為四類：用于空間重建的計算策略和組學實驗的組合,，使用激光捕獲顯微切割（LCM）結(jié)合高通量進行直接測量，使用熒光物質(zhì)的基于圖像的原位轉(zhuǎn)錄組學 ,，以及基于寡核苷酸的空間條形碼再加上高通量,。每種方法都有其優(yōu)點和缺點?？臻g重構(gòu)的計算策略：這種計算方法可以充分利用內(nèi)在基因表達模式或共表達的趨勢,，從單個細胞的大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中重構(gòu)細胞間的環(huán)境。然而,，這些推論方法在某些情況下*呈現(xiàn)空間趨勢或特定組織的總體布局,。基于LCM的方法：基于LCM的轉(zhuǎn)錄組學或基因組學成功地獲得了單個細胞的空間轉(zhuǎn)錄組,，盡管其通量很低,，但是在可以標記成千上萬個單個細胞位置的多路復用條形碼策略可行之前，將少量細胞的數(shù)據(jù)粗略地整合到構(gòu)成***的巨大背景中,，可能具有一定價值,。基于圖像的原位轉(zhuǎn)錄組學：基于圖像的原位轉(zhuǎn)錄組學在很大程度上增加了可檢測區(qū)域,，但也存在一些問題,，例如幾種smFISH方法很難從包括信號干擾、轉(zhuǎn)錄本積累等復雜背景中提取單個細胞,?？臻g條形碼加高通量：費用較高且無法在單個細胞中獲得轉(zhuǎn)錄組,。

空間轉(zhuǎn)錄組的一般流程2。這使得在后續(xù)步驟中覆蓋細胞組織圖像和基因表達數(shù)據(jù)成為可能,。用我們的滲透試劑對組織進行滲透,，這意味著在細胞膜上形成小孔。RNA分子可以通過這些通道離開細胞,，并與芯片上相鄰的捕獲探針結(jié)合,。因此，基因表達信息被捕獲在芯片上,。需要通過以下步驟將捕獲的RNA分子中存儲的信息轉(zhuǎn)換為數(shù)據(jù),。cDNA合成是為了創(chuàng)造穩(wěn)定的雙鏈DNA分子。這是必要的,，因為cdna - rna -雜交體的降解速度很快,。此外，這是構(gòu)建可測序文庫之前的必要步驟,。所有之前收集的信息都被匯集起來,，可以在線訪問。這意味著在實踐中,，您可以查看組織切片的圖像并選擇組織中的不同區(qū)域,。然后你可以確定哪些基因在這些區(qū)域中以什么數(shù)量表達。因此,，你可以在一個單一的實驗中進行新分析,。空間轉(zhuǎn)錄組這對于發(fā)育生物學等眾多領(lǐng)域的研究都具有重要的意義,。

歐易生物高級技術(shù)支持陳老師首先給大家介紹了空間轉(zhuǎn)錄組學的發(fā)展歷程,、測序流程及原理。緊接著,，歐易生物技術(shù)支持姚老師針對目前空間轉(zhuǎn)錄組學發(fā)表的一系列高分文章進行了方案設(shè)計的解析,。姜老師給大家詳細介紹了空間轉(zhuǎn)錄組項目樣本準備、切片,、貼片等實驗過程及注意事項,，并帶領(lǐng)大家到實驗室實地觀摩了整個實驗過程，并就其中細節(jié)進行了講解,。董老師針對空間轉(zhuǎn)錄組10x Space Ranger的分析原理及結(jié)果進行了詳細解析,，并介紹了使用Seurat包進行數(shù)據(jù)挖掘的標準分析流程。了解空間轉(zhuǎn)錄組樣本準備注意事項,。廣西生物技術(shù)空間轉(zhuǎn)錄組

本次培訓班旨在跟廣大科研工作者介紹空間轉(zhuǎn)錄組的研究熱點和方案設(shè)計,。品質(zhì)空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域

 空間重構(gòu)的計算策略：這種計算方法可以充分利用內(nèi)在基因表達模式或共表達的趨勢，從單個細胞的大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中重構(gòu)細胞間的環(huán)境,。然而,，這些推論方法在某些情況下*呈現(xiàn)空間趨勢或特定組織的總體布局,。基于LCM的方法：基于LCM的轉(zhuǎn)錄組學或基因組學成功地獲得了單個細胞的空間轉(zhuǎn)錄組,，盡管其通量很低,，但是在可以標記成千上萬個單個細胞位置的多路復用條形碼策略可行之前，將少量細胞的數(shù)據(jù)粗略地整合到構(gòu)成***的巨大背景中,，可能具有一定價值,。基于圖像的原位轉(zhuǎn)錄組學：基于圖像的原位轉(zhuǎn)錄組學在很大程度上增加了可檢測區(qū)域,，但也存在一些問題,，例如幾種smFISH方法很難從包括信號干擾、轉(zhuǎn)錄本積累等復雜背景中提取單個細胞,?？臻g條形碼加高通量：費用較高且無法在單個細胞中獲得轉(zhuǎn)錄組。品質(zhì)空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域

上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司專注技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)品研發(fā),，發(fā)展規(guī)模團隊不斷壯大,。公司目前擁有專業(yè)的技術(shù)員工，為員工提供廣闊的發(fā)展平臺與成長空間,，為客戶提供高質(zhì)的產(chǎn)品服務(wù),，深受員工與客戶好評。誠實,、守信是對企業(yè)的經(jīng)營要求,，也是我們做人的基本準則,。公司致力于打造***的科研服務(wù),，科研檢測，學術(shù)研究,，技術(shù)咨詢,。公司力求給客戶提供全數(shù)良好服務(wù)，我們相信誠實正直,、開拓進取地為公司發(fā)展做正確的事情,，將為公司和個人帶來共同的利益和進步。經(jīng)過幾年的發(fā)展,，已成為科研服務(wù),，科研檢測，學術(shù)研究,，技術(shù)咨詢行業(yè)出名企業(yè),。