歐易生物高級(jí)技術(shù)支持陳老師首先給大家介紹了空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的發(fā)展歷程、測(cè)序流程及原理,。緊接著，歐易生物技術(shù)支持姚老師針對(duì)目前空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)發(fā)表的一系列高分文章進(jìn)行了方案設(shè)計(jì)的解析,。姜老師給大家詳細(xì)介紹了空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目樣本準(zhǔn)備、切片,、貼片等實(shí)驗(yàn)過程及注意事項(xiàng),，并帶領(lǐng)大家到實(shí)驗(yàn)室實(shí)地觀摩了整個(gè)實(shí)驗(yàn)過程，并就其中細(xì)節(jié)進(jìn)行了講解,。董老師針對(duì)空間轉(zhuǎn)錄組10x Space Ranger的分析原理及結(jié)果進(jìn)行了詳細(xì)解析,，并介紹了使用Seurat包進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘的標(biāo)準(zhǔn)分析流程,。scRNA-seq 技術(shù)的進(jìn)步啟發(fā)了利用高分辨率轉(zhuǎn)錄組定量分析與空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)的互補(bǔ)性質(zhì)的新方法,。河北歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組做什么

空間轉(zhuǎn)錄組的應(yīng)用有哪些？一,、構(gòu)建空間轉(zhuǎn)錄組圖譜：借助于空間分辨的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué),，建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結(jié)構(gòu)的重要步驟。目前的多項(xiàng)研究通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)結(jié)合空間轉(zhuǎn)錄技術(shù),，得到多個(gè)***的時(shí)空轉(zhuǎn)錄組圖譜（相關(guān)研究后續(xù)會(huì)在如下專輯更新）,。二、描繪胚胎發(fā)育和空間藍(lán)圖：胚胎發(fā)育是一個(gè)復(fù)雜的過程,，其中動(dòng)態(tài)變化在生物分子水平上迅速發(fā)生,。對(duì)這種微觀變化的時(shí)間和空間方面的分析都具有挑戰(zhàn)性。預(yù)期使用空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)可以表征胚胎發(fā)育的空間表達(dá)藍(lán)圖。山東空間轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用空間轉(zhuǎn)錄組組織學(xué)板塊包括樣品的包埋,、切片,、固定、染色及成像,，記錄切片的形態(tài)學(xué)信息,。

10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的準(zhǔn)確性高嗎？下圖是一個(gè)將10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)應(yīng)用于小鼠海馬體研究的案例,。A圖為腦組織切片的HE染色結(jié)果,，從10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果中，可以清晰看到Tmsb4x（B圖）和Selenow（C圖）在海馬體區(qū)域高表達(dá),，和已知的研究結(jié)果一致性較高,。開展10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組需要做哪些準(zhǔn)備？空間轉(zhuǎn)錄組是一項(xiàng)十分前沿的技術(shù),，涉及到很多細(xì)節(jié)方面的準(zhǔn)備工作,，例如組織類型的選擇、前期預(yù)實(shí)驗(yàn)的設(shè)計(jì),、病理區(qū)域的確認(rèn)等一系列內(nèi)容,。而且實(shí)驗(yàn)中存在很多不確定性因素，處理不慎容易導(dǎo)致整個(gè)項(xiàng)目失敗,。

轉(zhuǎn)錄本的空間位置信息可以通過在原位陣列上捕獲的組織切片中的轉(zhuǎn)錄本來獲取,，目前已有多種技術(shù)策略被開發(fā)報(bào)道， 如空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)（Spatial Transcriptomics,，ST）和 Visium 技術(shù),，通過將包含空間位置信息的條形碼、UMI 標(biāo)簽,、poly-dT 的探針固定在商用微陣列載玻片上,，來捕獲包含 poly(A) 尾巴的轉(zhuǎn)錄本，并獲取全轉(zhuǎn)錄組水平的基因表達(dá)及位置信息,。一些無需成像即可計(jì)算重建空間基因表達(dá)模式所需信息的技術(shù)也被開發(fā)了出來,，其中之一就是是 DNA 顯微技術(shù)，它記錄 cDNA 之間的接近度,，該信息可用于重建轉(zhuǎn)錄本之間的相對(duì)位置,。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn)，致力通過質(zhì)量的服務(wù),，助力各位科研工作者取得新的突破,。

空間基因表達(dá)技術(shù)能夠在保留空間背景信息的同時(shí)，多方位測(cè)量轉(zhuǎn)錄組譜,。然而,，現(xiàn)有的分析方法并沒有解決技術(shù)分辨率有限或有效利用空間信息的問題。來自美國的科研團(tuán)隊(duì)開發(fā)了BayesSpace，這是一種完全貝葉斯統(tǒng)計(jì)方法,，它使用來自空間鄰域的信息來增強(qiáng)空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分辨率并進(jìn)行聚類分析,。BayeSpace通過使用的Bioconductor SingleCellExperiment數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)將預(yù)處理數(shù)據(jù)作為輸入，無縫集成到空間轉(zhuǎn)錄組分析工作流中,，輸出同樣存儲(chǔ)在SingleCellExperiment對(duì)象中,，該對(duì)象可用于下游分析。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn),，致力通過質(zhì)量的服務(wù),，助力各位科研工作者取得新的突破?？臻g轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)主要包括 MERFISH 和 seqFISH,。河南歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組質(zhì)量

研究的***主要集中于人類和小鼠的大腦，而其他***（例如肝臟）的空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究相對(duì)滯后,。河北歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組做什么

1. 空間轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)步驟A,。切片制備和優(yōu)化：取新鮮組織、冷凍,、切片,，并進(jìn)行HE染色成像，優(yōu)化確定切片是否覆蓋靶向區(qū)域,?？臻g轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)步驟B。切片固定和透化：將組織切片放置在含有與RNA結(jié)合捕獲探針的載玻片上,，并進(jìn)行固定和透化,，使細(xì)胞中的 mRNA 得到釋放，并結(jié)合到相應(yīng)的捕獲探針上,，從而獲取基因表達(dá)信息,。空間轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)步驟c,。逆轉(zhuǎn)和文庫構(gòu)建：以捕獲的 RNA 為模板,，進(jìn)行 cDNA 合成，和測(cè)序文庫制備,?？臻g轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)步驟d,。高通量上機(jī)測(cè)序：對(duì)制備好的測(cè)序文庫,，進(jìn)行二代高通量短讀長測(cè)序?？臻g轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)步驟e,。數(shù)據(jù)可視化分析：結(jié)合HE結(jié)果，確定哪些基因有表達(dá)，表達(dá)量高低,，以及這些基因的空間位置信息,。河北歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組做什么

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司位于聯(lián)航路1188號(hào)25幢，是一家專業(yè)的檢驗(yàn)檢測(cè)服務(wù),。（依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,，經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動(dòng)，具體經(jīng)營項(xiàng)目以相關(guān)部門批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn)）一般項(xiàng)目：生物醫(yī)藥產(chǎn)品,、生化產(chǎn)品的研發(fā),，醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品（除危險(xiǎn)品化學(xué)品,、監(jiān)控化學(xué)品,、易制毒化學(xué)品）的研發(fā)、銷售,，儀器儀表的銷售,，并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),，會(huì)務(wù)服務(wù),，企業(yè)管理咨詢。公司,。在歐易生物近多年發(fā)展歷史,，公司旗下現(xiàn)有品牌歐易生物等。公司以用心服務(wù)為重點(diǎn)價(jià)值,，希望通過我們的專業(yè)水平和不懈努力,，將檢驗(yàn)檢測(cè)服務(wù)。（依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,，經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動(dòng),，具體經(jīng)營項(xiàng)目以相關(guān)部門批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn)）一般項(xiàng)目：生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),，醫(yī)藥中間體,、化工原料及產(chǎn)品（除危險(xiǎn)品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品,、易制毒化學(xué)品）的研發(fā),、銷售，儀器儀表的銷售,，并提供相關(guān)技術(shù)咨詢,、技術(shù)服務(wù)，會(huì)務(wù)服務(wù),，企業(yè)管理咨詢,。等業(yè)務(wù)進(jìn)行到底,。歐易生物始終以質(zhì)量為發(fā)展，把顧客的滿意作為公司發(fā)展的動(dòng)力,，致力于為顧客帶來***的科研服務(wù),，科研檢測(cè)，學(xué)術(shù)研究,，技術(shù)咨詢,。