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Recombinant Cynomolgus TIM-1/HAVCR1 Protein

來源: 發(fā)布時(shí)間:2024-11-25

在PCR實(shí)驗(yàn)中,,為了避免引物與已知序列的交叉反應(yīng),,從而確保實(shí)驗(yàn)的特異性,,以下是一些關(guān)鍵的引物設(shè)計(jì)原則和策略:1.**選擇高保守性區(qū)域**:引物比較好設(shè)計(jì)在模板cDNA的保守區(qū)內(nèi),,這樣可以確保引物與目標(biāo)序列的特異性結(jié)合。通過比較不同物種的同一基因序列,,可以確定基因的保守區(qū),。2.**避免引物與非目標(biāo)序列的同源性**:設(shè)計(jì)引物時(shí),應(yīng)避免與基因組中的重復(fù)序列,、假基因或高同源性區(qū)域設(shè)計(jì)引物,。可以通過BLAST等工具對引物進(jìn)行同源性分析,,確保引物只與目標(biāo)序列結(jié)合,。3.**引物長度和GC含量**:引物長度一般在15-30堿基之間,常用的是18-27bp,。GC含量一般為40%-60%,,以45-55%為宜。過高或過低的GC含量都不利于引發(fā)反應(yīng),,上下游引物的GC含量和Tm值應(yīng)保持接近,。4.**避免引物的3'端錯(cuò)配**:引物3'端的堿基應(yīng)嚴(yán)格要求配對,特別是倒數(shù)第二個(gè)堿基,,以避免因末端堿基不配對而導(dǎo)致PCR失敗,。引物3'端比較好不要選擇A,比較好選擇T,,因?yàn)楫?dāng)末位鏈為T時(shí),,錯(cuò)配的引發(fā)效率降低。5.**避免引物自身及引物之間的互補(bǔ)序列**:引物自身不應(yīng)存在互補(bǔ)序列,,否則引物自身會(huì)折疊成發(fā)夾結(jié)構(gòu),,影響引物與模板的復(fù)性結(jié)合。前后引物之間也不應(yīng)具有互補(bǔ)性,,尤其應(yīng)避免3'端的互補(bǔ)重疊以防止引物二聚體的形成,。去泛素化酶(Deubiquitinating enzymes, DUBs)可以去除泛素化蛋白上的泛素鏈,使泛素分子得以回收和再利用,。Recombinant Cynomolgus TIM-1/HAVCR1 Protein,His Tag

Recombinant Cynomolgus TIM-1/HAVCR1 Protein,His Tag,標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)

蛋白A-微球菌核酸酶(pA-MNase)是一種特殊的融合蛋白,,它結(jié)合了蛋白A和微球菌核酸酶(MNase,MicrococcalNuclease)的特性,。以下是pA-MNase的一些關(guān)鍵特點(diǎn)和應(yīng)用:1.**融合表達(dá)產(chǎn)物**:pA-MNase是蛋白A與微球菌核酸酶MNase的融合表達(dá)產(chǎn)物,,因此它同時(shí)具有ProteinA的抗體結(jié)合活性和MNase的核酸內(nèi)切酶活性。2.**雙重功能**:由于其雙重功能,,pA-MNase常用于蛋白質(zhì)-DNA相互作用研究,,特別是在ChIC(ChromatinImmunocleavage)和CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)技術(shù)中。3.**ProteinA的特性**:ProteinA是一種發(fā)現(xiàn)于金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)的細(xì)胞壁表面蛋白,,分子量為42kDa,,能特異性地與哺乳動(dòng)物免疫球蛋白(Immunoglobulin,Ig)結(jié)合,通常結(jié)合部位為免疫球蛋白的Fc區(qū),。4.**微球菌核酸酶(MNase)的特性**:MNase是一種核酸內(nèi)切酶,,能夠降解核酸,常用于降解蛋白質(zhì)制備中存在的核酸,,減少細(xì)胞裂解液的粘度,,以及用于染色質(zhì)結(jié)構(gòu)分析和快速RNA測序。5.**反應(yīng)條件**:MNase的反應(yīng)條件包括1XMicrococcalNucleaseReactionBuffer,,需要補(bǔ)充100μg/ml重組白蛋白,,分子生物學(xué)級,并在37°C下孵化,。Recombinant Cynomolgus Serum Albumin Protein,His Tag在cDNA末端快速擴(kuò)增(RACE)技術(shù)中,,Ultra-Long Master Mix 可以用來擴(kuò)增5'和3'末端的長片段cDNA,。

Recombinant Cynomolgus TIM-1/HAVCR1 Protein,His Tag,標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)

T5核酸外切酶在基因編輯中確實(shí)有應(yīng)用,并且具有一些優(yōu)勢:1.**提高編輯效率**:根據(jù)一篇研究文章,,T5核酸外切酶可以與CRISPR/Cas系統(tǒng)共表達(dá)或融合,,以提高基因編輯的效率。這種共表達(dá)或融合可以增加indel(插入和缺失)頻率,,盡管增加的幅度可能不大,。2.**增強(qiáng)基因編輯效果**:在另一項(xiàng)研究中,通過使用螺旋-螺旋二聚體肽(coiled-coilpeptides)將T5核酸外切酶招募到Cas9或Cas12a蛋白上,,可以提高基因編輯的效率,,這種方法被稱為CCExo(CRISPR-Coiled-coil-Exonuclease)。這種招募方式優(yōu)于共表達(dá)和直接融合,,其中強(qiáng)的親和力CC對顯示出高的突變頻率和刪除長度,。3.**應(yīng)用于多種細(xì)胞類型**:CCExo系統(tǒng)在多種細(xì)胞系和原代細(xì)胞中都能有效地提高基因失活效率,并且在慢性髓性白血?。–ML)患者的原代細(xì)胞以及異種移植動(dòng)物模型中展示了其應(yīng)用潛力,,這表明CCExo方法可能成為CML和其他遺傳性疾病的潛在選擇。T5核酸外切酶與CRISPR核酸酶蛋白進(jìn)行融合,,并引入了核定位信號(NLS)序列以構(gòu)建表達(dá)載體,,用于基因編輯。綜上所述,,T5核酸外切酶在基因編輯中的應(yīng)用可以增強(qiáng)編輯效率和效果,,尤其是在與CRISPR/Cas系統(tǒng)結(jié)合使用時(shí)。

在PCR實(shí)驗(yàn)中,,除了BsuDNAPolymerase,,還有幾種聚合酶適合高溫?cái)U(kuò)增,包括:1.**TaqDNAPolymerase**:這是常用的PCR聚合酶,,來源于Thermusaquaticus,,能夠在72°C的比較好活性溫度下工作。它具有良好的熱穩(wěn)定性,,可以承受PCR的熱變性步驟,,且中途不需要再添加酶。2.**PfuDNAPolymerase**:來源于Pyrococcusfuriosus,,具有出色的熱穩(wěn)定性和3'→5'外切酶活性,,提供校正功能,適用于對PCR保真性要求較高的實(shí)驗(yàn),,如基因篩選,、克隆表達(dá)、突變檢測,、定點(diǎn)突變等,。3.**VentDNAPolymerase**:來源于Litoralis棲熱球菌,,具有3'→5'外切酶活性,可以去除錯(cuò)配的堿基,,具有校對功能,,保真度比TaqDNAPolymerase高5~15倍,。4.**KODDNAPolymerase**:來自Thermococcuskodakaraensis,,具有高保真性和高熱穩(wěn)定性,保真性比PfuDNAPolymerase更高,,優(yōu)化后的PCR反應(yīng)緩沖液能使得其擴(kuò)增速度達(dá)到Taq酶的2倍,、Pfu酶的5-6倍。5.**BstDNAPolymerase**:來源于Bacillusstearothermophilus,,具有3'到5'外切割活性,,適用于等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng),如LAMP技術(shù),,可在恒溫下進(jìn)行DNA擴(kuò)增,,無需繁瑣的溫度循環(huán)。E1通常被認(rèn)為是泛素化過程中的限速步驟,,因?yàn)樗婕暗椒核氐募て鸷虯TP的水解,。

Recombinant Cynomolgus TIM-1/HAVCR1 Protein,His Tag,標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)

BloodGenomicDNAIsolationKitwithMagneticBeads是一種利用磁珠技術(shù)從血液中提取基因組DNA的試劑盒。以下是一些關(guān)鍵特點(diǎn)和應(yīng)用:1.**高效提取**:該試劑盒采用特殊的磁珠和緩沖體系,,能夠快速且高效地從100μl至1ml的血液中分離和純化高質(zhì)量的基因組DNA,。2.**磁珠特性**:獨(dú)特的磁珠具有很強(qiáng)的核酸親和力,在特定條件下可以快速分離和純化核酸,。這些磁珠對磁場響應(yīng)迅速,,使得提取過程既安全又便捷。3.**提取過程**:血液樣本在裂解液和蛋白酶K的作用下迅速裂解,,釋放出的基因組DNA與磁珠特異性結(jié)合,。通過磁分離架的作用,磁珠與溶液快速分離,,經(jīng)過洗滌去除雜質(zhì),,用洗脫液將基因組DNA從磁珠上洗脫下來。4.**應(yīng)用廣**:提取的基因組DNA可用于多種分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn),,如PCR擴(kuò)增,、酶切、基因分型,、Southern雜交,、高通量測序、基因組DNA文庫構(gòu)建等,。5.**操作簡便**:整個(gè)抽提過程大約需要50分鐘,,操作簡便,,無需使用有毒有害的有機(jī)試劑,如酚或氯仿,,提高了實(shí)驗(yàn)的安全性,。6.**高純度和高回收率**:提取的DNA純度高,A260/A280通常在1.7-1.9之間,,表明蛋白和RNA的污染低,。回收率通常超過80%,。

FnCas12a需要一個(gè)crRNA,,而不需要tracrRNA,簡化了RNA的設(shè)計(jì)和構(gòu)建過程,。Recombinant Mouse FAM19A5 Protein,His Tag

泛素連接酶E3識別特定的靶蛋白,,并促進(jìn)E2上的泛素轉(zhuǎn)移到靶蛋白的賴氨酸殘基上,形成泛素化標(biāo)記,。Recombinant Cynomolgus TIM-1/HAVCR1 Protein,His Tag

在比較BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶對于復(fù)雜DNA片段擴(kuò)增的適用性時(shí),,以下是一些關(guān)鍵點(diǎn):1.**TaqDNA聚合酶**:-TaqDNA聚合酶因其高熱穩(wěn)定性和擴(kuò)增效率而被應(yīng)用于常規(guī)PCR。它擴(kuò)增速度為30-60秒/kb,,缺乏3'→5'核酸外切酶活性,,無校正功能,易產(chǎn)生錯(cuò)配堿基,。-對于結(jié)構(gòu)復(fù)雜的模板,,如GC含量高、有二級結(jié)構(gòu)等,,TaqPlus可以用于擴(kuò)增,,能有效地?cái)U(kuò)增10kb以下的片段。-有產(chǎn)品如TitaniumTaqDNA聚合酶,,它是通過基因工程改造的Taq酶,,缺失了5'-3'外切酶活性,具備更強(qiáng)大的擴(kuò)增性能,,適合擴(kuò)增高度復(fù)雜的DNA混合物,。2.**BstDNA聚合酶**:-BstDNA聚合酶具有高適溫度,能夠適應(yīng)更加苛刻的擴(kuò)增條件,,同時(shí)消除DNA二級結(jié)構(gòu),,因而能夠準(zhǔn)確并且均勻地?cái)U(kuò)增全基因組序列。-BstDNA聚合酶大片段能夠優(yōu)先擴(kuò)增短片段的DNA,,并且能夠確保擴(kuò)增得到的DNA覆蓋了整個(gè)基因組,,連貫并且無偏地?cái)U(kuò)增所有的遺傳位點(diǎn)。-翌圣生物HieffCanace®PlusHigh-FidelityDNAPolymerase基于PfuDNA聚合酶改造而成,其保真性是Taq酶的83倍,,Pfu酶的9倍,,擴(kuò)增速度高達(dá)10秒/kb,擴(kuò)增目的片段長達(dá)13kb,,具有極強(qiáng)的擴(kuò)增效率的模板適應(yīng)性,,非常適合復(fù)雜模板的高保真擴(kuò)增。

Recombinant Cynomolgus TIM-1/HAVCR1 Protein,His Tag