單細胞轉(zhuǎn)錄組測序是在單細胞水平上高通量測序分析基因表達譜的技術,突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性,組織解離后,,單個樣本一次上機能捕獲500-20000個細胞,, 基于每個細胞分別建庫測序,獲得單個細胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達狀態(tài),,并鑒定細胞的類型,,可以在不同樣本間從細胞類型的組成和豐度角度進行比較,反映細胞間的異質(zhì)性。而2021年橫空出世的10X Genomics Chromium X平臺實現(xiàn)了單塊chip上的百萬級別通量的細胞捕獲,,系統(tǒng)實現(xiàn)16個通道同時運行,,每個通道可捕獲2000-20000個細胞(不混樣),并支持原Chromium Controller體統(tǒng)外的多種細胞捕獲百萬級別通量實驗,,可準確鑒別稀有細胞類型和適配大規(guī)模單細胞研究,。單個細胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達狀態(tài),并鑒定細胞的類型,。蘇州高通量測序單細胞測序商業(yè)化服務
所謂的高通量測序技術,,又名大規(guī)模平行測序,是將 DNA(或者 cDNA)隨機片段化,、加接頭,,制備測序文庫,通過對文庫中數(shù)以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,,檢測對應的信號,,獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法(Sanger法等)相比,,高通量測序技術在處理大規(guī)模樣品時具有明顯的優(yōu)勢,,又快(兩天)又多(數(shù)百萬克隆),,成為目前組學研究的主要技術,。單細胞測序是一個系統(tǒng)的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,,如果匹配,,實驗過程如何規(guī)劃,實驗平臺如何選擇,,樣本如何制備,,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,,我們的服務就已經(jīng)開始了,,從銷售到實驗到專業(yè)技術支持,我們開通全線對接渠道,,幫助您快速定位項目訴求,,提供從實驗設計到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學合作伙伴,。廣州10X Chromium X單細胞測序百萬通量平臺烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務,。
10× Genomics官方建議,當單細胞懸液活性低于70%時應做去除死細胞操作,,并推薦使用MACS? Dead Cell Removal Kit(Miltenyi Biotec),。需要注意到,,去除死細胞的操作會損失一定的細胞數(shù)量,10× Genomics和Miltenyi Biotec都沒有給出單細胞懸液含有多少細胞數(shù)量才建議做去除死細胞的操作,?;诹冶嗄陠渭毎麥y序?qū)嶒灲?jīng)驗,建議當細胞懸液進行質(zhì)量和活性檢測后,,考慮對細胞活性在50%-70%的懸液進行去除死細胞的操作,。而太低活性的懸液(小于30%),懸液中細胞大量死亡,,可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細胞比例和狀態(tài),,失真嚴重,建議重新收集樣本進行新的實驗,,保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實驗結(jié)果的準確性,。
現(xiàn)有的單細胞測序技術陣營在幾個主要領域存在差別。一個是分隔單個細胞以在其中進行微反應的物理平臺,。在這個空間,,單個細胞的內(nèi)容物釋放,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標記或添加索引,,以便下游識別?,F(xiàn)有技術的另一個主要區(qū)別是如何添加索引,就像生成測序文庫所涉及的流程步驟一樣,。10X Genomics單細胞測序平臺采用動態(tài)微流控技(Drop-Seq具有類似的技術原理),。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,其中一列縱向孔道輸入細胞,,凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上,,并通過微流控技術,將之輸入到第二縱向孔道,即油相孔道中,。這時候,,就形成了一個個油滴并輸出并收集在EP管中,。每一個油滴中會落入一個細胞以及一個凝膠微珠,那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,,再加上一端PolyT的抓手,構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠,。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫,。全線搭建10x Genomics單細胞測序平臺。
細胞中基因的表達是嚴格按照時間和空間順序發(fā)生,,因此細胞類型和基因表達具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序來分析,。但是單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(scRNA-Seq)在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結(jié)構(gòu),,無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個問題,,其以點陣形式記錄組織切片細胞的空間信息,,在保留組織形態(tài)結(jié)構(gòu)的基礎上,獲得細胞/基因的空間表達特異性,。烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機的全套實驗平臺,。蘇州10X單細胞測序數(shù)據(jù)分析可視化
強勢發(fā)文!烈冰單細胞測序助力揭示愈傷組織能再生的機制,。蘇州高通量測序單細胞測序商業(yè)化服務
烈冰生物成立于2010年,,與時俱進,堅持為科研學者提供國際前沿的高通量測序?qū)嶒灪蜕疃鹊纳镄畔?shù)據(jù)分析服務,,已逐步發(fā)展為單細胞多組學檢測服務****,。專注于“單細胞測序系列技術服務”的專精領域,在上海,、北京,、廣州、西安和江西等地擁有數(shù)千平辦公場所,,并布局多中心產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)基地和營銷,、運營中心。2016年起連續(xù)被評為上海市****,,60+項自主知識產(chǎn)權(quán),,轉(zhuǎn)化率近80%。產(chǎn)品覆蓋從單細胞測序,,核測序,,單細胞多組學,空間轉(zhuǎn)錄組測序等多組學聯(lián)合的實驗+數(shù)據(jù)分析全流程服務平臺,。為600+國內(nèi)高校和醫(yī)院,、5000+深度合作學者用戶、10000+生命科學探索的重要科研項目在醫(yī)藥開發(fā),、科學研究,、醫(yī)學及臨床研究,疾病分子標志物篩選,、生命和神經(jīng)發(fā)育研究等提供多層次,、多組學檢測服務和解決方案,,助力300+CNS國際學術期刊文章發(fā)表,30+篇單細胞技術聯(lián)合(助力)發(fā)文,,IF 10+文章占比>65%,。蘇州高通量測序單細胞測序商業(yè)化服務
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號奇亞特中心22幢,是一家專業(yè)的生物科技,、醫(yī)藥科技,、信息科技、計算機科技領域內(nèi)的技術開發(fā),、技術服務,、技術轉(zhuǎn)讓、技術咨詢,,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測驗),從事貨物及技術的進出口業(yè)務,,計算機,、軟件及耗材(除專控),,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,,經(jīng)相關部門批準后方可開展經(jīng)營活動】公司。專業(yè)的團隊大多數(shù)員工都有多年工作經(jīng)驗,,熟悉行業(yè)專業(yè)知識技能,,致力于發(fā)展NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造的品牌。公司以用心服務為重點價值,,希望通過我們的專業(yè)水平和不懈努力,,將生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計算機科技領域內(nèi)的技術開發(fā)、技術服務,、技術轉(zhuǎn)讓、技術咨詢,,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測驗),,從事貨物及技術的進出口業(yè)務,計算機,、軟件及耗材(除??兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,,經(jīng)相關部門批準后方可開展經(jīng)營活動】等業(yè)務進行到底,。誠實、守信是對企業(yè)的經(jīng)營要求,,也是我們做人的基本準則,。公司致力于打造***的單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細胞多組學測序。