烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),，針對(duì)龐大的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù),，能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快,、精,、準(zhǔn)：一鍵導(dǎo)入gene list構(gòu)建個(gè)性化基因列表,；輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Feature plot,；任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型,；一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖：輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖,、Heatmap,、Violin圖，還可以通過(guò)調(diào)節(jié)寬,、高和系數(shù)比例來(lái)調(diào)節(jié)美觀,。平臺(tái)上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,，幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動(dòng)化分析,，節(jié)省工作時(shí)間并提升整體工作效率。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測(cè)序服務(wù),。烈冰科技單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班

現(xiàn)有的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)陣營(yíng)在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別,。一個(gè)是分隔單個(gè)細(xì)胞以在其中進(jìn)行微反應(yīng)的物理平臺(tái)。在這個(gè)空間,，單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放,，轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引，以便下游識(shí)別?，F(xiàn)有技術(shù)的另一個(gè)主要區(qū)別是如何添加索引,，就像生成測(cè)序文庫(kù)所涉及的流程步驟一樣。10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)采用動(dòng)態(tài)微流控技（Drop-Seq具有類似的技術(shù)原理）,。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,，其中一列縱向孔道輸入細(xì)胞，凝膠微珠與細(xì)胞碰撞后會(huì)吸附在凝膠微珠上,，并通過(guò)微流控技術(shù),，將之輸入到第二縱向孔道，即油相孔道中,。這時(shí)候,，就形成了一個(gè)個(gè)油滴并輸出并收集在EP管中。每一個(gè)油滴中會(huì)落入一個(gè)細(xì)胞以及一個(gè)凝膠微珠,，那么在每一個(gè)凝膠微珠中上長(zhǎng)滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,，再加上一端PolyT的抓手，構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠,。而這個(gè)凝膠微珠抓手就會(huì)使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫(kù),。吉林10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序商業(yè)化服務(wù)烈冰開(kāi)展了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞多組學(xué)以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案,。

10X Genomics 是一種基于 drop 的微流控技術(shù)，液體在配套芯片中的微管道中流動(dòng),，因此細(xì)胞直徑會(huì)受到芯片中微管道直徑的限制,，微流體通道的直徑約為 50 ~ 60 um，因此捕獲細(xì)胞的直徑不能超過(guò) 40um。當(dāng)細(xì)胞直徑過(guò)大時(shí),，容易出現(xiàn)管道堵塞,，造成GEM生成失敗，對(duì)于神經(jīng)科學(xué)研究和心血管疾病研究的老師而言,，準(zhǔn)備采用單細(xì)胞技術(shù)用于課題研究的時(shí)候,，往往會(huì)遇到一個(gè)尷尬的問(wèn)題，就是目標(biāo)細(xì)胞,，例如神經(jīng)元細(xì)胞,、成熟心肌細(xì)胞由于體積過(guò)大，不適用于 10X 單細(xì)胞技術(shù),。其中神經(jīng)元細(xì)胞的直徑很大,，直接超過(guò)了芯片中管道的直徑，雖然心肌細(xì)胞直徑低于 50um,，但是成熟心肌細(xì)胞的長(zhǎng)度很長(zhǎng),，有可能堵塞通道造成實(shí)驗(yàn)失敗，這也是為什么現(xiàn)在很多已發(fā)表的心臟單細(xì)胞文章,，主要研究方向是心臟發(fā)育的原因了,，主要還是因?yàn)槲窗l(fā)育成熟的心肌細(xì)胞比較小，不會(huì)出現(xiàn)堵塞管道的風(fēng)險(xiǎn),。因此可以考慮組織解離后過(guò) 40um 濾網(wǎng),，過(guò)濾掉大細(xì)胞，避免出現(xiàn)管道堵塞,、實(shí)驗(yàn)失敗的風(fēng)險(xiǎn),。此種方案的缺點(diǎn)是大細(xì)胞被過(guò)濾掉，丟失相關(guān)細(xì)胞數(shù)據(jù),；另外組織解離獲得高質(zhì)量細(xì)胞懸液以后,，繼續(xù)做細(xì)胞裂解抽細(xì)胞核，開(kāi)展細(xì)胞核測(cè)序,。具體可訪問(wèn)烈冰官網(wǎng)給我們留言,，烈小冰將安排專業(yè)技術(shù)為您詳細(xì)解答。

10× Genomics單細(xì)胞方案要求使用具有較高活性的單細(xì)胞懸液,。在實(shí)際實(shí)驗(yàn)中,，我們發(fā)現(xiàn)因?yàn)闃颖绢愋秃椭苽鋯渭?xì)胞懸液方法的不同，容易出現(xiàn)單細(xì)胞懸液中死亡細(xì)胞的比例較高的情況,。去除單細(xì)胞懸液中的死細(xì)胞和其他污染物對(duì)獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)是至關(guān)重要的,。這是因?yàn)椋劳龅募?xì)胞易裂解導(dǎo)致其中的RNA釋放出來(lái),。這種cell-free RNA會(huì)導(dǎo)致檢測(cè)的背景噪聲,，并會(huì)影響單細(xì)胞數(shù)據(jù)的質(zhì)量,。因此當(dāng)樣本活性較差時(shí)，對(duì)細(xì)胞懸液中細(xì)胞活性檢測(cè)后,，需要進(jìn)行一般死細(xì)胞去除的工作（一般懸液活性小于70%時(shí)考慮此操作）,，以保證較高的上機(jī)捕獲細(xì)胞的質(zhì)量。烈冰科技成立10余年,，為科研學(xué)者提供專注的測(cè)序數(shù)據(jù)分析服務(wù),。

烈冰生物成立于2010年，與時(shí)俱進(jìn),，堅(jiān)持為科研學(xué)者提供國(guó)際前沿的高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)和深度的生物信息數(shù)據(jù)分析服務(wù),，已逐步發(fā)展為單細(xì)胞多組學(xué)檢測(cè)服務(wù)****。專注于“單細(xì)胞測(cè)序系列技術(shù)服務(wù)”的專精領(lǐng)域,，在上海,、北京、廣州,、西安和江西等地?fù)碛袛?shù)千平辦公場(chǎng)所,，并布局多中心產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)基地和營(yíng)銷、運(yùn)營(yíng)中心,。2016年起連續(xù)被評(píng)為上海市****,，60+項(xiàng)自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)，轉(zhuǎn)化率近80%,。產(chǎn)品覆蓋從單細(xì)胞測(cè)序,，核測(cè)序，單細(xì)胞多組學(xué),，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序等多組學(xué)聯(lián)合的實(shí)驗(yàn)+數(shù)據(jù)分析全流程服務(wù)平臺(tái),。為600+國(guó)內(nèi)高校和醫(yī)院、5000+深度合作學(xué)者用戶,、10000+生命科學(xué)探索的重要科研項(xiàng)目在醫(yī)藥開(kāi)發(fā),、科學(xué)研究、醫(yī)學(xué)及臨床研究,，疾病分子標(biāo)志物篩選,、生命和神經(jīng)發(fā)育研究等提供多層次、多組學(xué)檢測(cè)服務(wù)和解決方案,，助力300+CNS國(guó)際學(xué)術(shù)期刊文章發(fā)表,，30+篇單細(xì)胞技術(shù)聯(lián)合（助力）發(fā)文，IF 10+文章占比＞65%,。全線搭建10X Genomics Chromium X單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)測(cè)序平臺(tái),。西安高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序百萬(wàn)通量平臺(tái)

測(cè)序的革新讓科學(xué)研究從個(gè)體基因差異逐漸轉(zhuǎn)為個(gè)體細(xì)胞的基因差異。烈冰科技單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是在單細(xì)胞水平上高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),，突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,，組織解離后,，單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-20000個(gè)細(xì)胞， 基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序,，獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài)，并鑒定細(xì)胞的類型,，可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,，反映細(xì)胞間的異質(zhì)性。而2021年橫空出世的10X Genomics Chromium X平臺(tái)實(shí)現(xiàn)了單塊chip上的百萬(wàn)級(jí)別通量的細(xì)胞捕獲,，系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)16個(gè)通道同時(shí)運(yùn)行,，每個(gè)通道可捕獲2000-20000個(gè)細(xì)胞（不混樣），并支持原Chromium Controller體統(tǒng)外的多種細(xì)胞捕獲百萬(wàn)級(jí)別通量實(shí)驗(yàn),，可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類型和適配大規(guī)模單細(xì)胞研究,。烈冰科技單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康，以科技創(chuàng)新實(shí)現(xiàn)***管理的追求,。烈冰生物深耕行業(yè)多年,，始終以客戶的需求為向?qū)В瑸榭蛻籼峁?**的單細(xì)胞測(cè)序,，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,。烈冰生物始終以本分踏實(shí)的精神和必勝的信念,，影響并帶動(dòng)團(tuán)隊(duì)取得成功。烈冰生物創(chuàng)始人陳岱,，始終關(guān)注客戶,，創(chuàng)新科技，竭誠(chéng)為客戶提供良好的服務(wù),。