二代測序技術(shù)在測序方法上取得了重大突破,基于“邊合成邊測序”(sequencing by synthesis)和大規(guī)模平行測序技術(shù)(massive parallel analysis,MPS),,使測序通量和讀取速度得到極大提升,,例如Illumina Solexa測序儀。Illumina的測序原理可以簡化為四步:樣品文庫構(gòu)建,、簇生成,、測序和數(shù)據(jù)分析,。由于讀長限制,樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段,,并在3'和5'端接上3種序列:1)Index,,用于區(qū)分樣品來源;2)Adapter,,用于結(jié)合測序通道上的位點(diǎn),;3)Primer binding site,用于結(jié)合PCR引物啟動擴(kuò)增反應(yīng),。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進(jìn)行測定。成都10X Chromium X單細(xì)胞測序服務(wù)機(jī)構(gòu)
烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè),,為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù),,先后經(jīng)歷基因芯片時代、基因測序,、轉(zhuǎn)錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨(dú)占鰲頭,。2018年以來,單細(xì)胞測序進(jìn)入發(fā)展的快車道,,烈冰作為國內(nèi)首批引進(jìn)單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)雙平臺的公司,,依托自主研發(fā)的NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)分析平臺,為用戶提供一站式全流程的單細(xì)胞測序服務(wù)和解決方案,。4年的單細(xì)胞技術(shù)的積累,,烈冰已具備大鼠、小鼠,、斑馬魚,、猴、裸鼴鼠,、水稻,、擬南芥等10+物種,皮膚,、腦,、脂肪、心臟,、花序等50+組織類型,,100+細(xì)胞類型,,1000+靶標(biāo)基因,,10000+樣本處理經(jīng)驗(yàn)。陜西10X Chromium X單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析可視化強(qiáng)勢發(fā)文,!烈冰單細(xì)胞測序助力揭示愈傷組織能再生的機(jī)制,。
關(guān)于單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)樣本制備,,這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致,也就是通過酶促或機(jī)械消化,、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液,。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟,以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞,,并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片,。如有必要,您還可以使用抗體對樣本進(jìn)行染色,,標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物,,或者通過FACS來富集感興趣的細(xì)胞類型。解離樣本時采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)而定,。也許需要額外的制備步驟,,具體取決于組織質(zhì)量、樣本豐度,、細(xì)胞大小,,以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析。無論具體的考慮因素如何,,所有樣本類型都遵循同一個基本原則,,那就是生成高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液。
RNA測序(RNA-seq)或芯片分析等大量樣本的轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法作為一類強(qiáng)大的工具,,可提供混合樣本的基因表達(dá)平均數(shù)據(jù),,幫助科學(xué)家開始揭示這種異質(zhì)性。隨后,,技術(shù)創(chuàng)新的飛躍在單細(xì)胞技術(shù)上達(dá)到新高度——使得科學(xué)家能夠定義細(xì)胞類型特異的基因表達(dá),,從過去的平均數(shù)據(jù)中分辨出真正驅(qū)動其表達(dá)模式的細(xì)胞異質(zhì)性。這讓研究人員能夠更詳細(xì)地表征組織異質(zhì)性,,鑒定稀有細(xì)胞類型,,并逐個細(xì)胞地仔細(xì)分析其分子機(jī)制。當(dāng)獲得了對其研究的生物系統(tǒng)更為真實(shí)的圖譜后,,研究人員就有了更為堅(jiān)實(shí)可靠的知識基礎(chǔ),,并能在這個基礎(chǔ)上規(guī)劃下一步實(shí)驗(yàn),以獲取更深入的可行動見解,。全線搭建10x Genomics單細(xì)胞測序平臺,。
單細(xì)胞測序是指針對單個細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測序分析,可精確地描述每一個細(xì)胞的狀態(tài),,在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有特殊的應(yīng)用價值,。然而,單細(xì)胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,對于揭示發(fā)育過程,、病理微環(huán)境都存在很大的局限性,。空間轉(zhuǎn)錄組測序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測序,,可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況,。空間轉(zhuǎn)錄組測序的加入,,無疑讓單細(xì)胞測序如虎添翼,,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。過去的十年,,我們是知識的承載者,;現(xiàn)在,我們在努力構(gòu)建醫(yī)學(xué)的大數(shù)據(jù)時代,;未來我們將重新定義知識形態(tài),!蘇州10X Chromium X單細(xì)胞測序服務(wù)公司
單個細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類型,。成都10X Chromium X單細(xì)胞測序服務(wù)機(jī)構(gòu)
多樣本數(shù)據(jù)合并:Fraction of Reads Kept:合并樣本時,,各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計(jì)算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,,需要進(jìn)行Downsample處理,,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測序深度標(biāo)化到同一水平,從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量,、基因表達(dá)水平的差異,。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,;從操作便捷、結(jié)果可視化,、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程,!成都10X Chromium X單細(xì)胞測序服務(wù)機(jī)構(gòu)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,,以科技創(chuàng)新實(shí)現(xiàn)***管理的追求。烈冰生物深耕行業(yè)多年,,始終以客戶的需求為向?qū)?,為客戶提?**的單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序,。烈冰生物始終以本分踏實(shí)的精神和必勝的信念,影響并帶動團(tuán)隊(duì)取得成功,。烈冰生物創(chuàng)始人陳岱,始終關(guān)注客戶,,創(chuàng)新科技,,竭誠為客戶提供良好的服務(wù)。