單細(xì)胞測(cè)序是指針對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,，可精確地描述每一個(gè)細(xì)胞的狀態(tài)，在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有特殊的應(yīng)用價(jià)值,。然而,，單細(xì)胞測(cè)序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息，對(duì)于揭示發(fā)育過程,、病理微環(huán)境都存在很大的局限性,。空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測(cè)序,，可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況,。空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的加入,，無疑讓單細(xì)胞測(cè)序如虎添翼,，更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。過去的十年,，我們是知識(shí)的承載者,；現(xiàn)在，我們?cè)谂?gòu)建醫(yī)學(xué)的大數(shù)據(jù)時(shí)代,；未來我們將重新定義知識(shí)形態(tài),！蘇州10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)支持

單細(xì)胞RNA-seq、RNA-seq和逆轉(zhuǎn)錄qPCR（RT-qPCR）都采用一個(gè)共同過程,，即分離RNA并將其轉(zhuǎn)化為cDNA進(jìn)行分析,。不過，每種分析在開展方式和獲得的數(shù)據(jù)上有所不同,。RNA-seq和RT-qPCR都是先從大量細(xì)胞中分離RNA,，然后將其轉(zhuǎn)化為cDNA,。RNA-seq是使用cDNA來構(gòu)建新一代測(cè)序文庫，從而測(cè)定整個(gè)轉(zhuǎn)錄組的基因表達(dá),。RT-qPCR則是從cDNA中擴(kuò)增特定靶點(diǎn),，并通過熒光測(cè)定表達(dá)水平。RT-qPCR限于已知靶點(diǎn),，而RNA-seq可實(shí)現(xiàn)無偏倚的全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)分析,。然而，這兩者只能提供細(xì)胞群體內(nèi)基因表達(dá)的平均情況,。單細(xì)胞RNA-seq則在分離RNA之前將單細(xì)胞分離到微孔或單個(gè)微反應(yīng)容器中,。然后用細(xì)胞特異性的條形碼標(biāo)記RNA，確保來自每個(gè)細(xì)胞的cDNA可以追溯到起源細(xì)胞,。與RNA-seq相似,，帶有條形碼的cDNA也被用于構(gòu)建新一代測(cè)序文庫，從而能夠?qū)γ總€(gè)細(xì)胞的整個(gè)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行基因表達(dá)測(cè)定,。吉林10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析測(cè)序可準(zhǔn)確地分析基因表達(dá)差異,、基因結(jié)構(gòu)變異、篩選分子標(biāo)記（SNPs或SSR）等生命科學(xué)重要問題,。

10X Genomics 是一種基于 drop 的微流控技術(shù),，液體在配套芯片中的微管道中流動(dòng)，因此細(xì)胞直徑會(huì)受到芯片中微管道直徑的限制,，微流體通道的直徑約為 50 ~ 60 um,，因此捕獲細(xì)胞的直徑不能超過 40um。當(dāng)細(xì)胞直徑過大時(shí),，容易出現(xiàn)管道堵塞,，造成GEM生成失敗，對(duì)于神經(jīng)科學(xué)研究和心血管疾病研究的老師而言,，準(zhǔn)備采用單細(xì)胞技術(shù)用于課題研究的時(shí)候,，往往會(huì)遇到一個(gè)尷尬的問題，就是目標(biāo)細(xì)胞,，例如神經(jīng)元細(xì)胞,、成熟心肌細(xì)胞由于體積過大，不適用于 10X 單細(xì)胞技術(shù),。其中神經(jīng)元細(xì)胞的直徑很大,，直接超過了芯片中管道的直徑，雖然心肌細(xì)胞直徑低于 50um,，但是成熟心肌細(xì)胞的長度很長,，有可能堵塞通道造成實(shí)驗(yàn)失敗，這也是為什么現(xiàn)在很多已發(fā)表的心臟單細(xì)胞文章,，主要研究方向是心臟發(fā)育的原因了,，主要還是因?yàn)槲窗l(fā)育成熟的心肌細(xì)胞比較小,，不會(huì)出現(xiàn)堵塞管道的風(fēng)險(xiǎn),。因此可以考慮組織解離后過 40um 濾網(wǎng),，過濾掉大細(xì)胞，避免出現(xiàn)管道堵塞,、實(shí)驗(yàn)失敗的風(fēng)險(xiǎn),。此種方案的缺點(diǎn)是大細(xì)胞被過濾掉，丟失相關(guān)細(xì)胞數(shù)據(jù),；另外組織解離獲得高質(zhì)量細(xì)胞懸液以后,，繼續(xù)做細(xì)胞裂解抽細(xì)胞核，開展細(xì)胞核測(cè)序,。具體可訪問烈冰官網(wǎng)給我們留言,，烈小冰將安排專業(yè)技術(shù)為您詳細(xì)解答。

基于10X Next GEM技術(shù),，單細(xì)胞測(cè)序一次實(shí)驗(yàn)可以同時(shí)檢測(cè)近萬個(gè)細(xì)胞,，可在一個(gè)樣本中同時(shí)獲3'端mRNA表達(dá)譜、如需和免疫組庫（TCR和BCR）的數(shù)據(jù)進(jìn)行聯(lián)合時(shí),，即某些研究還需結(jié)合基因的表達(dá)譜和V(D)J數(shù)據(jù)進(jìn)行復(fù)雜組織樣本的是影響免疫應(yīng)答分析,，監(jiān)測(cè)免疫療法的效果，研究疾病發(fā)生,、發(fā)展的分子機(jī)制,，可進(jìn)行單細(xì)胞免疫組庫測(cè)序： 烈冰單細(xì)胞免疫組庫平臺(tái)具備：1000+項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)，一次實(shí)驗(yàn)可同時(shí)獲取1000-20000個(gè)細(xì)胞的文庫構(gòu)建,，獲得轉(zhuǎn)錄組和免疫組數(shù)據(jù),； 具備完善的免疫組庫測(cè)序和實(shí)驗(yàn)質(zhì)控流程，獲取V(D)J全長序列的配對(duì)信息,；豐富的免疫組庫測(cè)序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),，實(shí)現(xiàn)專屬個(gè)性化數(shù)據(jù)分析服務(wù)，搭配單細(xì)胞分析云平臺(tái),，一鍵導(dǎo)出交互性的動(dòng)態(tài)結(jié)果報(bào)告,。截至2021年10月，烈冰助力發(fā)表單細(xì)胞測(cè)序文章近20篇,。

多樣本數(shù)據(jù)合并：Fraction of Reads Kept：合并樣本時(shí),，各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計(jì)算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,，需要進(jìn)行Downsample處理,，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平，從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量,、基因表達(dá)水平的差異,。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,；從操作便捷,、結(jié)果可視化、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,，加速科研進(jìn)程！烈冰生物成立于2010年,，專注于單細(xì)胞測(cè)序領(lǐng)域科研服務(wù),。重慶高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)公司

單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析，認(rèn)準(zhǔn)烈冰NovelBrain生物信息數(shù)據(jù)分析平臺(tái),。蘇州10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)支持

機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激,，其細(xì)胞會(huì)從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時(shí),，往往會(huì)經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,，導(dǎo)致一些基因被沉默，一些基因被重新“喚醒”,，但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的,；scRNA-seq擬時(shí)序分析可以讓我們?cè)诓恍枰兓那闆r下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時(shí)序分析,，即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時(shí)間的變化情況,，構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育，但這里的時(shí)間并不是真時(shí)間,，而是一個(gè)虛擬的時(shí)間,，是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個(gè)樣本中,，也會(huì)存在多種不同的細(xì)胞形態(tài),。因此，不論測(cè)定了多少樣本,，我們都可以采用擬時(shí)序分析對(duì)樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述,。蘇州10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)支持

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主營品牌有NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造，發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊(duì)不斷壯大,，該公司服務(wù)型的公司,。公司是一家有限責(zé)任公司（自然）企業(yè)，以誠信務(wù)實(shí)的創(chuàng)業(yè)精神,、專業(yè)的管理團(tuán)隊(duì),、踏實(shí)的職工隊(duì)伍，努力為廣大用戶提供***的產(chǎn)品,。公司始終堅(jiān)持客戶需求優(yōu)先的原則,，致力于提供高質(zhì)量的單細(xì)胞測(cè)序,，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái)，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,。烈冰生物以創(chuàng)造***產(chǎn)品及服務(wù)的理念，打造高指標(biāo)的服務(wù),，引導(dǎo)行業(yè)的發(fā)展,。