單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽,，需要對細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進(jìn)準(zhǔn)判斷,，這對Single Cell分選標(biāo)記,、建庫,、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細(xì)胞計數(shù)偏高,，將會影響建庫的成功率,；計數(shù)偏低，則會提高雙細(xì)胞的比例,；而細(xì)胞活率過低,，就會使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣，因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要,。而在鋪板過程中,，由于不同操作人員手法具有不可避免的差異，不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果,。因此烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器,，其具有Prime Treat、Cell Load,、Bead Load,、Wash、Lysis,、Retrieval多種操作模式,，來對應(yīng)各種不同的操作。通過已經(jīng)設(shè)定的程序來控制液體的流速,，大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來的差異,，保證實(shí)驗(yàn)操作的一致性。強(qiáng)勢發(fā)文,！烈冰單細(xì)胞測序助力揭示愈傷組織能再生的機(jī)制,。吉林高通量測序單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析

烈冰生物成立于2010年，與時俱進(jìn),，堅持為科研學(xué)者提供國際前沿的高通量測序?qū)嶒?yàn)和深度的生物信息數(shù)據(jù)分析服務(wù),，已逐步發(fā)展為單細(xì)胞多組學(xué)檢測服務(wù)****。專注于“單細(xì)胞測序系列技術(shù)服務(wù)”的專精領(lǐng)域,，在上海,、北京、廣州,、西安和江西等地?fù)碛袛?shù)千平辦公場所,，并布局多中心產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)基地和營銷、運(yùn)營中心,。2016年起連續(xù)被評為上海市****,，60+項自主知識產(chǎn)權(quán)，轉(zhuǎn)化率近80%,。產(chǎn)品覆蓋從單細(xì)胞測序,，核測序,，單細(xì)胞多組學(xué)，空間轉(zhuǎn)錄組測序等多組學(xué)聯(lián)合的實(shí)驗(yàn)+數(shù)據(jù)分析全流程服務(wù)平臺,。為600+國內(nèi)高校和醫(yī)院,、5000+深度合作學(xué)者用戶、10000+生命科學(xué)探索的重要科研項目在醫(yī)藥開發(fā),、科學(xué)研究,、醫(yī)學(xué)及臨床研究，疾病分子標(biāo)志物篩選,、生命和神經(jīng)發(fā)育研究等提供多層次,、多組學(xué)檢測服務(wù)和解決方案，助力300+CNS國際學(xué)術(shù)期刊文章發(fā)表,，30+篇單細(xì)胞技術(shù)聯(lián)合（助力）發(fā)文，IF 10+文章占比＞65%,。天津10X Chromium X單細(xì)胞測序服務(wù)公司豐富的測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),，烈冰配套全程個性化、定制化地數(shù)據(jù)分析服務(wù),。

一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲,，小心得不償失，原因在這：單細(xì)胞測序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進(jìn)行,，而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后,，獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜,，通過降維（pca）,，無監(jiān)督聚類以及可視化（t-SNE）得到的。進(jìn)行細(xì)胞聚類時需要考慮到每個細(xì)胞的基因表達(dá)模式,，因此即使是相同的數(shù)據(jù),，在剔除幾個細(xì)胞的情況下，前后獲得的聚類圖也會出現(xiàn)明顯不同,。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過多時,，無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù)，都會對正常細(xì)胞聚類產(chǎn)生影響,，造成聚類結(jié)果失真,。這也是很多文章，特別是很多高分文章,，為什么單個樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了,。烈冰建議單個樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個時，數(shù)據(jù)量在100G左右時,，可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求,。

針對單細(xì)胞測序的細(xì)胞上樣數(shù),，為什么不建議捕獲到的細(xì)胞數(shù)量越高越好？一味地追求高數(shù)量的細(xì)胞捕獲可能會存在一些問題,。例如在上機(jī)細(xì)胞懸液濃度固定時,，如果目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)增加到8000甚至10000，上樣細(xì)胞懸液體積勢必增加,，在細(xì)胞懸液質(zhì)量不是很理想（細(xì)胞活性<90%,、碎片率>5%、結(jié)團(tuán)率均>5%）的情況下,，引入的背景信號會增加,，分析結(jié)果不理想的直接體現(xiàn)包括：cell、non-cell無法有效區(qū)分和Fraction reads in cells偏低,。當(dāng)cell和non-cell無法有效區(qū)分時,，會使得數(shù)據(jù)出現(xiàn)假陽性和假陰性結(jié)果！當(dāng)目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)很大時,，多細(xì)胞率會增加,，數(shù)據(jù)分析時，此部分“cell”表現(xiàn)為基因檢測數(shù)和UMI檢測數(shù)是正常cell的N倍（N是一個GEM包裹的細(xì)胞數(shù)）,，導(dǎo)致所有細(xì)胞的統(tǒng)計數(shù)據(jù)（單個細(xì)胞基因檢測中位數(shù),、單個細(xì)胞UMI檢測中位數(shù)）虛高。此部分“cell”雖然可以通過設(shè)置數(shù)據(jù)分析閾值進(jìn)行過濾,，但是容易會有此類數(shù)據(jù)的殘留和正常高基因檢測細(xì)胞的人為去除,！高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次突破性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進(jìn)行測定,。

單細(xì)胞多組學(xué)提升見解 基于測序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強(qiáng)大之處,，因?yàn)樗軌蛄私馔粏渭?xì)胞的多種生物分析指標(biāo)。如果說單細(xì)胞基因表達(dá)提供了一種顏色的詳細(xì)信息,，那么單細(xì)胞多組學(xué)提供了同一細(xì)節(jié)的全彩色圖譜,，為您帶來樣本的真實(shí)視圖。烈冰2021年強(qiáng)勢引進(jìn)的10x Genomics Chromium單細(xì)胞平臺能夠從同一單細(xì)胞中讀取細(xì)胞復(fù)雜性的多組學(xué)特征,。與傳統(tǒng)方法不同,，單細(xì)胞多組學(xué)簡化了您需要開展的實(shí)驗(yàn)，也節(jié)省了您需要分析的樣本,，而能獲得相同的結(jié)果,。這不但節(jié)省了寶貴的樣本，還保證了更高的生物學(xué)準(zhǔn)確性,，因?yàn)槟恍枰ヅ洳鸱謽颖镜臄?shù)據(jù)集并通過計算來推斷各個組學(xué)之間的關(guān)系,。測序的革新讓科學(xué)研究從個體基因差異逐漸轉(zhuǎn)為個體細(xì)胞的基因差異。陜西10X Chromium X單細(xì)胞測序服務(wù)

單細(xì)胞多組學(xué)測序可識別重要的轉(zhuǎn)錄因子，進(jìn)行譜系和發(fā)育追蹤,。吉林高通量測序單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析

10X Genomics 是一種基于 drop 的微流控技術(shù),，液體在配套芯片中的微管道中流動，因此細(xì)胞直徑會受到芯片中微管道直徑的限制,，微流體通道的直徑約為 50 ~ 60 um,，因此捕獲細(xì)胞的直徑不能超過 40um。當(dāng)細(xì)胞直徑過大時,，容易出現(xiàn)管道堵塞,，造成GEM生成失敗，對于神經(jīng)科學(xué)研究和心血管疾病研究的老師而言,，準(zhǔn)備采用單細(xì)胞技術(shù)用于課題研究的時候,，往往會遇到一個尷尬的問題，就是目標(biāo)細(xì)胞,，例如神經(jīng)元細(xì)胞,、成熟心肌細(xì)胞由于體積過大，不適用于 10X 單細(xì)胞技術(shù),。其中神經(jīng)元細(xì)胞的直徑很大,，直接超過了芯片中管道的直徑，雖然心肌細(xì)胞直徑低于 50um,，但是成熟心肌細(xì)胞的長度很長，有可能堵塞通道造成實(shí)驗(yàn)失敗,，這也是為什么現(xiàn)在很多已發(fā)表的心臟單細(xì)胞文章,，主要研究方向是心臟發(fā)育的原因了，主要還是因?yàn)槲窗l(fā)育成熟的心肌細(xì)胞比較小,，不會出現(xiàn)堵塞管道的風(fēng)險,。因此可以考慮組織解離后過 40um 濾網(wǎng)，過濾掉大細(xì)胞,，避免出現(xiàn)管道堵塞,、實(shí)驗(yàn)失敗的風(fēng)險。此種方案的缺點(diǎn)是大細(xì)胞被過濾掉,，丟失相關(guān)細(xì)胞數(shù)據(jù),；另外組織解離獲得高質(zhì)量細(xì)胞懸液以后，繼續(xù)做細(xì)胞裂解抽細(xì)胞核,，開展細(xì)胞核測序,。具體可訪問烈冰官網(wǎng)給我們留言，烈小冰將安排專業(yè)技術(shù)為您詳細(xì)解答,。吉林高通量測序單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號奇亞特中心22幢,，擁有一支專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊。在烈冰生物近多年發(fā)展歷史,，公司旗下現(xiàn)有品牌NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造等,。我公司擁有強(qiáng)大的技術(shù)實(shí)力,，多年來一直專注于生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢，市場營銷策劃,，市場信息咨詢與調(diào)查（不得從事社會調(diào)查,、社會調(diào)研、民意調(diào)查,、民意測驗(yàn)）,，從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù)，計算機(jī),、軟件及耗材（除?？兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目,，經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】的發(fā)展和創(chuàng)新,，打造高指標(biāo)產(chǎn)品和服務(wù)。上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主營業(yè)務(wù)涵蓋單細(xì)胞測序,，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細(xì)胞多組學(xué)測序,，堅持“質(zhì)量保證,、良好服務(wù)、顧客滿意”的質(zhì)量方針,，贏得廣大客戶的支持和信賴,。