樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,,在對細(xì)胞進(jìn)行清洗和計數(shù)后,,單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上,,直至用于后續(xù)的上機和文庫制備步驟,。在理想狀況下,,一旦制備好樣本,,應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟,。然而,,您還有必要了解各類細(xì)胞的不同性質(zhì),,因為這可能會影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時間,,以及它們在制備后多久便應(yīng)當(dāng)被盡快使用。例如,,有些細(xì)胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時間,,它們就開始形成團(tuán)塊。這些團(tuán)塊很難解離,,增加了堵塞的風(fēng)險,,而且每個團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計數(shù),又降低了細(xì)胞計數(shù)的準(zhǔn)確性,。此外,,有些細(xì)胞更加粘稠,形成團(tuán)塊的速度更快,。對于這些細(xì)胞,,必須盡量減少制備和使用之間的時間差。附加流式分選細(xì)胞表面Marker,,對于較低分辨率的標(biāo)志物也能有效鑒定,,助力高要求測序項目。武漢二代測序單細(xì)胞測序商業(yè)化服務(wù)
單細(xì)胞RNA-seq,、RNA-seq和逆轉(zhuǎn)錄qPCR(RT-qPCR)都采用一個共同過程,,即分離RNA并將其轉(zhuǎn)化為cDNA進(jìn)行分析。不過,,每種分析在開展方式和獲得的數(shù)據(jù)上有所不同,。RNA-seq和RT-qPCR都是先從大量細(xì)胞中分離RNA,然后將其轉(zhuǎn)化為cDNA,。RNA-seq是使用cDNA來構(gòu)建新一代測序文庫,,從而測定整個轉(zhuǎn)錄組的基因表達(dá)。RT-qPCR則是從cDNA中擴增特定靶點,,并通過熒光測定表達(dá)水平,。RT-qPCR限于已知靶點,而RNA-seq可實現(xiàn)無偏倚的全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)分析,。然而,,這兩者只能提供細(xì)胞群體內(nèi)基因表達(dá)的平均情況。單細(xì)胞RNA-seq則在分離RNA之前將單細(xì)胞分離到微孔或單個微反應(yīng)容器中,。然后用細(xì)胞特異性的條形碼標(biāo)記RNA,,確保來自每個細(xì)胞的cDNA可以追溯到起源細(xì)胞,。與RNA-seq相似,帶有條形碼的cDNA也被用于構(gòu)建新一代測序文庫,,從而能夠?qū)γ總€細(xì)胞的整個轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行基因表達(dá)測定,。蘇州10X Chromium X單細(xì)胞測序百萬通量平臺烈冰生物成立于2010年,專注于單細(xì)胞測序領(lǐng)域科研服務(wù),。
單細(xì)胞測序?qū)嶒炘贅颖炯?xì)胞上機分選簽,,需要對細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進(jìn)準(zhǔn)判斷,,這對Single Cell分選標(biāo)記,、建庫、下機數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用,。如若細(xì)胞計數(shù)偏高,,將會影響建庫的成功率;計數(shù)偏低,,則會提高雙細(xì)胞的比例,;而細(xì)胞活率過低,就會使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,,因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要,。而在鋪板過程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,,不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果,。因此烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器,其具有Prime Treat,、Cell Load,、Bead Load、Wash,、Lysis,、Retrieval多種操作模式,來對應(yīng)各種不同的操作,。通過已經(jīng)設(shè)定的程序來控制液體的流速,,大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來的差異,保證實驗操作的一致性,。
科技的發(fā)展讓單細(xì)胞測序已經(jīng)應(yīng)用于疾病發(fā)展過程中的關(guān)鍵過程和事件,,如前病變向惡性的轉(zhuǎn)化、惡性向轉(zhuǎn)移性的發(fā)展,,以及對多種用藥的反應(yīng),。單細(xì)胞測序技術(shù)作為一個需要將組織解離成為單細(xì)胞懸液,或者是采用細(xì)胞核捕獲的策略捕獲單細(xì)胞核,,進(jìn)而對于每一個單細(xì)胞或者細(xì)胞核進(jìn)行測序得到結(jié)果的技術(shù),,其空間定位信息是丟失的,。這就衍生出了一個問題就是如果單細(xì)胞A與B并不出現(xiàn)在一個組織區(qū)域中他們會互相影響或者轉(zhuǎn)化么?免疫研究中,,兩個具有非常強的PDL1-PD1的配對關(guān)系的細(xì)胞在組織切片上風(fēng)馬牛不相及,,這樣PDL1-PD1的關(guān)系會生效么?單細(xì)胞測序是高通量測序下的又一重大技術(shù)突破,。
烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),,深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,;從操作便捷,、結(jié)果可視化、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程,!此外,,烈冰生信團(tuán)隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器(Single Cell Browser),不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,,還是可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件,。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您,,詳情請咨詢烈冰生物,。烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000,開啟更大通量測序新紀(jì)元,。北京高通量測序單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析可視化
烈冰專精單細(xì)胞多組學(xué)測序領(lǐng)域,。武漢二代測序單細(xì)胞測序商業(yè)化服務(wù)
單細(xì)胞測序是指針對單個細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測序分析,可精確地描述每一個細(xì)胞的狀態(tài),,在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有特殊的應(yīng)用價值,。然而,單細(xì)胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,,對于揭示發(fā)育過程,、病理微環(huán)境都存在很大的局限性??臻g轉(zhuǎn)錄組測序以點陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測序,,可以精確指示點陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況??臻g轉(zhuǎn)錄組測序的加入,,無疑讓單細(xì)胞測序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性,。武漢二代測序單細(xì)胞測序商業(yè)化服務(wù)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司坐落在江月路999號奇亞特中心22幢,,是一家專業(yè)的生物科技,、醫(yī)藥科技、信息科技,、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查,、社會調(diào)研,、民意調(diào)查、民意測驗),,從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計算機、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】公司,。目前我公司在職員工以90后為主,,是一個有活力有能力有創(chuàng)新精神的團(tuán)隊。公司以誠信為本,,業(yè)務(wù)領(lǐng)域涵蓋單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序,,我們本著對客戶負(fù)責(zé),對員工負(fù)責(zé),,更是對公司發(fā)展負(fù)責(zé)的態(tài)度,,爭取做到讓每位客戶滿意。公司力求給客戶提供全數(shù)良好服務(wù),,我們相信誠實正直,、開拓進(jìn)取地為公司發(fā)展做正確的事情,將為公司和個人帶來共同的利益和進(jìn)步,。經(jīng)過幾年的發(fā)展,,已成為單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序行業(yè)出名企業(yè)。