基于10X Next GEM技術(shù),,單細(xì)胞測序一次實(shí)驗(yàn)可以同時(shí)檢測近萬個(gè)細(xì)胞,,可在一個(gè)樣本中同時(shí)獲3'端mRNA表達(dá)譜、如需和免疫組庫(TCR和BCR)的數(shù)據(jù)進(jìn)行聯(lián)合時(shí),即某些研究還需結(jié)合基因的表達(dá)譜和V(D)J數(shù)據(jù)進(jìn)行復(fù)雜組織樣本的是影響免疫應(yīng)答分析,,監(jiān)測免疫療法的效果,研究疾病發(fā)生,、發(fā)展的分子機(jī)制,,可進(jìn)行單細(xì)胞免疫組庫測序: 烈冰單細(xì)胞免疫組庫平臺具備:1000+項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),一次實(shí)驗(yàn)可同時(shí)獲取1000-20000個(gè)細(xì)胞的文庫構(gòu)建,,獲得轉(zhuǎn)錄組和免疫組數(shù)據(jù),; 具備完善的免疫組庫測序和實(shí)驗(yàn)質(zhì)控流程,獲取V(D)J全長序列的配對信息,;豐富的免疫組庫測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),,實(shí)現(xiàn)專屬個(gè)性化數(shù)據(jù)分析服務(wù),搭配單細(xì)胞分析云平臺,,一鍵導(dǎo)出交互性的動態(tài)結(jié)果報(bào)告,。烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測序通過雙文庫構(gòu)建,,實(shí)現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡。重慶10X單細(xì)胞測序服務(wù)公司
單細(xì)胞多組學(xué)帶來的突破 單細(xì)胞測序方法不但改進(jìn)了實(shí)驗(yàn)過程,,還幫助科學(xué)家在健康和疾病研究的關(guān)鍵領(lǐng)域取得新進(jìn)展,。那些過去從轉(zhuǎn)錄平均值或單項(xiàng)參數(shù)讀取中無法獲得的新發(fā)現(xiàn)正在改變我們對傳染病、神經(jīng)退行性疾病等疾病的認(rèn)識,。從鑒定新的細(xì)胞類型和狀態(tài),,到揭開疾病用藥應(yīng)答和耐藥的潛在機(jī)制,單細(xì)胞測序正在推動突破性的研究,,有望改變生物學(xué)和醫(yī)療,。無論是無法解釋的疾病,還是人體或自然界中尚未探索的系統(tǒng),,曾經(jīng)模糊的東西正變得越來越清晰,。隨著我們邁向科學(xué)的未來,我們手頭的工具就像伽利略的望遠(yuǎn)鏡一樣能夠提高焦距和放大倍數(shù),,而定義科學(xué)未來的知識新深度是十年前的人們所無法想象的,。武漢10X Chromium X單細(xì)胞測序多組學(xué)測序烈冰生物首批引進(jìn) Chromium X 平臺,開啟百萬級通量單細(xì)胞測序新時(shí)代,。
二代測序技術(shù)在測序方法上取得了重大突破,,基于“邊合成邊測序”(sequencing by synthesis)和大規(guī)模平行測序技術(shù)(massive parallel analysis,MPS),使測序通量和讀取速度得到極大提升,,例如Illumina Solexa測序儀,。Illumina的測序原理可以簡化為四步:樣品文庫構(gòu)建、簇生成,、測序和數(shù)據(jù)分析,。由于讀長限制,樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段,,并在3'和5'端接上3種序列:1)Index,,用于區(qū)分樣品來源;2)Adapter,,用于結(jié)合測序通道上的位點(diǎn),;3)Primer binding site,用于結(jié)合PCR引物啟動擴(kuò)增反應(yīng),。
關(guān)于單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)樣本制備,這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致,,也就是通過酶促或機(jī)械消化,、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個(gè)樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟,,以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞,,并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片,。如有必要,您還可以使用抗體對樣本進(jìn)行染色,,標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物,,或者通過FACS來富集感興趣的細(xì)胞類型。解離樣本時(shí)采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)而定,。也許需要額外的制備步驟,,具體取決于組織質(zhì)量、樣本豐度,、細(xì)胞大小,,以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析。無論具體的考慮因素如何,,所有樣本類型都遵循同一個(gè)基本原則,,那就是生成高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液。烈冰對于一個(gè)細(xì)胞群體中的每個(gè)細(xì)胞單獨(dú)進(jìn)行建庫測序分析,。
關(guān)于10X Genomics單細(xì)胞平臺的樣本類型和樣本制備 :10X平臺在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊,,獲得分離良好的細(xì)胞懸液、無細(xì)胞隨便,、極少的細(xì)胞團(tuán)塊,,且細(xì)胞活力高(>70%);此外,,了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要,。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān)。各種尺寸不同的細(xì)胞(一般直徑不大于50μm)均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的10X Genomics平臺兼容,。一般來說,,細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來源和細(xì)胞類型而變化。每種組織類型都是獨(dú)特的,,因此,,必須在開始任何單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)之前優(yōu)化樣本制備,烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗(yàn),,累積10+物種,、50+組織的消化protocol,若您的樣本為組織,,且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液,,烈冰將盡可能提供技術(shù)及實(shí)驗(yàn)上的幫助。單細(xì)胞多組學(xué)測序可識別重要的轉(zhuǎn)錄因子,,進(jìn)行譜系和發(fā)育追蹤,。南昌10X Genomics單細(xì)胞測序
烈冰引進(jìn)國際主流單細(xì)胞和空間轉(zhuǎn)錄組測序平臺,保障細(xì)胞精度的前提下提供組織內(nèi)部精細(xì)區(qū)域的空間信息,。重慶10X單細(xì)胞測序服務(wù)公司
現(xiàn)有的單細(xì)胞測序技術(shù)陣營在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別,。一個(gè)是分隔單個(gè)細(xì)胞以在其中進(jìn)行微反應(yīng)的物理平臺,。在這個(gè)空間,單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放,,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引,,以便下游識別。現(xiàn)有技術(shù)的另一個(gè)主要區(qū)別是如何添加索引,,就像生成測序文庫所涉及的流程步驟一樣,。10X Genomics單細(xì)胞測序平臺采用動態(tài)微流控技(Drop-Seq具有類似的技術(shù)原理)。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,,其中一列縱向孔道輸入細(xì)胞,,凝膠微珠與細(xì)胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上,并通過微流控技術(shù),,將之輸入到第二縱向孔道,即油相孔道中,。這時(shí)候,,就形成了一個(gè)個(gè)油滴并輸出并收集在EP管中。每一個(gè)油滴中會落入一個(gè)細(xì)胞以及一個(gè)凝膠微珠,,那么在每一個(gè)凝膠微珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,,再加上一端PolyT的抓手,,構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠,。而這個(gè)凝膠微珠抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫。重慶10X單細(xì)胞測序服務(wù)公司
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司坐落在江月路999號奇亞特中心22幢,,是一家專業(yè)的生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查,、社會調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計(jì)算機(jī)、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】公司,。目前我公司在職員工以90后為主,,是一個(gè)有活力有能力有創(chuàng)新精神的團(tuán)隊(duì)。公司以誠信為本,,業(yè)務(wù)領(lǐng)域涵蓋單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序,,我們本著對客戶負(fù)責(zé),對員工負(fù)責(zé),,更是對公司發(fā)展負(fù)責(zé)的態(tài)度,,爭取做到讓每位客戶滿意。公司憑著雄厚的技術(shù)力量,、飽滿的工作態(tài)度,、扎實(shí)的工作作風(fēng)、良好的職業(yè)道德,,樹立了良好的單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序形象,,贏得了社會各界的信任和認(rèn)可。