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陜西高通量測序單細(xì)胞測序百萬通量平臺

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-06-29

科研的魅力之處,,在于無窮盡的探尋生命的本底,,通過單細(xì)胞測序,我們對組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級到深層,,并在單細(xì)胞層面逐漸達(dá)成一致,,那么不禁要問一句,,組織的空間位置到底重不重要?空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征,,細(xì)胞的位置信息更能反應(yīng)細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控機(jī)制和細(xì)胞譜系發(fā)生過程,。因此時(shí)間和空間即像組織的AB面,,而不可否認(rèn)的是,此時(shí)空間坐標(biāo)的記錄,,像一個還未長大的娃娃,,雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層,但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個高峰,。烈冰測序數(shù)據(jù)分析平臺,,不依賴已有物種信息,可研究非模式物種,,針對不同平臺的數(shù)據(jù),,制定多套流程;陜西高通量測序單細(xì)胞測序百萬通量平臺

二代測序技術(shù)在測序方法上取得了重大突破,,基于“邊合成邊測序”(sequencing by synthesis)和大規(guī)模平行測序技術(shù)(massive parallel analysis,MPS),,使測序通量和讀取速度得到極大提升,例如Illumina Solexa測序儀,。Illumina的測序原理可以簡化為四步:樣品文庫構(gòu)建,、簇生成、測序和數(shù)據(jù)分析,。由于讀長限制,樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段,,并在3'和5'端接上3種序列:1)Index,用于區(qū)分樣品來源,;2)Adapter,用于結(jié)合測序通道上的位點(diǎn),;3)Primer binding site,,用于結(jié)合PCR引物啟動擴(kuò)增反應(yīng),。上海10X Chromium X單細(xì)胞測序價(jià)格烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平臺。

作為單細(xì)胞測序的一個重要里程碑,,10x genomic公司于2016年2月推出10x Chromium Single Cell Gene Expression Solution,,此平臺整合了儀器,、試劑盒和信息學(xué)軟件,能精確對接illumina測序儀,,因此可實(shí)現(xiàn)大量大細(xì)胞的快速高效標(biāo)記,、測序和分析,獲得單細(xì)胞水平的基因表達(dá)譜和差異情況,,并通過對復(fù)雜細(xì)胞群體進(jìn)行深入細(xì)致分析,,繪制大規(guī)模單細(xì)胞表達(dá)圖譜。 以量化細(xì)胞內(nèi)的群體異質(zhì)性,,并逐個鑒定細(xì)胞類型、細(xì)胞狀態(tài)和動態(tài)細(xì)胞躍遷,。除了有望鑒定新的細(xì)胞亞型和稀有細(xì)胞群體,,單細(xì)胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系,。

高通量測序技術(shù)(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測序技術(shù)(“Next-generation” sequencing),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定和一般讀長較短等為標(biāo)志,。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定,,因此在有些文獻(xiàn)中稱其為下一代測序技術(shù)(next generation sequencing)足見其劃時(shí)代的改變,,同時(shí)高通量測序使得對一個物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的 分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deep sequencing),。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務(wù)經(jīng)驗(yàn),,已助力Nature,immunity等在內(nèi)的300+篇CNS文章發(fā)表,。十二年測序經(jīng)驗(yàn),,烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)領(lǐng)域的佼佼者,。

科技的發(fā)展讓單細(xì)胞測序已經(jīng)應(yīng)用于疾病發(fā)展過程中的關(guān)鍵過程和事件,如前病變向惡性的轉(zhuǎn)化,、惡性向轉(zhuǎn)移性的發(fā)展,,以及對多種用藥的反應(yīng)。單細(xì)胞測序技術(shù)作為一個需要將組織解離成為單細(xì)胞懸液,,或者是采用細(xì)胞核捕獲的策略捕獲單細(xì)胞核,,進(jìn)而對于每一個單細(xì)胞或者細(xì)胞核進(jìn)行測序得到結(jié)果的技術(shù),其空間定位信息是丟失的,。這就衍生出了一個問題就是如果單細(xì)胞A與B并不出現(xiàn)在一個組織區(qū)域中他們會互相影響或者轉(zhuǎn)化么,?免疫研究中,兩個具有非常強(qiáng)的PDL1-PD1的配對關(guān)系的細(xì)胞在組織切片上風(fēng)馬牛不相及,,這樣PDL1-PD1的關(guān)系會生效么,?單細(xì)胞測序因其強(qiáng)大的探究疾病--細(xì)胞--基因的關(guān)系,一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”,。成都10X Genomics單細(xì)胞測序

豐富的測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),,烈冰配套全程個性化、定制化地?cái)?shù)據(jù)分析服務(wù),。陜西高通量測序單細(xì)胞測序百萬通量平臺

關(guān)于單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)樣本制備,,這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致,也就是通過酶促或機(jī)械消化,、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液,。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟,以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞,,并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片。如有必要,,您還可以使用抗體對樣本進(jìn)行染色,,標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物,或者通過FACS來富集感興趣的細(xì)胞類型,。解離樣本時(shí)采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)而定,。也許需要額外的制備步驟,具體取決于組織質(zhì)量,、樣本豐度,、細(xì)胞大小,以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析,。無論具體的考慮因素如何,,所有樣本類型都遵循同一個基本原則,那就是生成高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液,。陜西高通量測序單細(xì)胞測序百萬通量平臺

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技,、醫(yī)藥科技,、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除專控),,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】的公司,是一家集研發(fā),、設(shè)計(jì),、生產(chǎn)和銷售為一體的專業(yè)化公司。烈冰生物作為生物科技,、醫(yī)藥科技,、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除專控),,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】的企業(yè)之一,為客戶提供良好的單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序。烈冰生物不斷開拓創(chuàng)新,,追求出色,,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺,,以應(yīng)用為重點(diǎn),,以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價(jià)值,,提供更優(yōu)服務(wù),。烈冰生物創(chuàng)始人陳岱,始終關(guān)注客戶,,創(chuàng)新科技,,竭誠為客戶提供良好的服務(wù)。