為什么需要單細胞分辨率,？ 生物學就像宇宙一樣,。它非常復雜，有許多獨特的單體,，也就是細胞,。這些細胞相互作用并扮演不同的角色，在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動多個過程,。就像伽利略探索宇宙的努力一樣，發(fā)現(xiàn)和定義這些細胞也需要高分辨率的工具,，才能解開促成生物學復雜性的基因表達異質(zhì)性,。單細胞測序能夠在以一個細胞為功能單位中開展生物學研究,，闡明具體細節(jié)，構(gòu)建出一幅更大,、更精細的圖譜,，說明導致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細胞之間是如何相互作用的：患者為什么會復發(fā)？是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題,。單細胞測序技術(shù)遍地開花，烈冰服務讓您的醫(yī)學研究如虎添翼,。長春單細胞測序數(shù)據(jù)分析

針對單細胞測序的細胞上樣數(shù),，為什么不建議捕獲到的細胞數(shù)量越高越好？一味地追求高數(shù)量的細胞捕獲可能會存在一些問題,。例如在上機細胞懸液濃度固定時，如果目標細胞捕獲數(shù)增加到8000甚至10000,，上樣細胞懸液體積勢必增加,，在細胞懸液質(zhì)量不是很理想（細胞活性<90%,、碎片率>5%,、結(jié)團率均>5%）的情況下，引入的背景信號會增加,，分析結(jié)果不理想的直接體現(xiàn)包括：cell、non-cell無法有效區(qū)分和Fraction reads in cells偏低,。當cell和non-cell無法有效區(qū)分時,，會使得數(shù)據(jù)出現(xiàn)假陽性和假陰性結(jié)果！當目標細胞捕獲數(shù)很大時,，多細胞率會增加,，數(shù)據(jù)分析時,，此部分“cell”表現(xiàn)為基因檢測數(shù)和UMI檢測數(shù)是正常cell的N倍（N是一個GEM包裹的細胞數(shù)）,，導致所有細胞的統(tǒng)計數(shù)據(jù)（單個細胞基因檢測中位數(shù)、單個細胞UMI檢測中位數(shù)）虛高,。此部分“cell”雖然可以通過設(shè)置數(shù)據(jù)分析閾值進行過濾,，但是容易會有此類數(shù)據(jù)的殘留和正常高基因檢測細胞的人為去除！陜西高通量測序單細胞測序商業(yè)化服務烈冰生物首批引進 Chromium X 平臺,，開啟百萬級通量單細胞測序新時代,。

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基因和基因產(chǎn)物并不是單獨運作的,，而是參與了相互關(guān)聯(lián)的復雜通路,、網(wǎng)絡(luò)和分子系統(tǒng)，這些合在一起實現(xiàn)了細胞,、組織和生物體的運作,。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用，對于了解生物系統(tǒng)如何運作至關(guān)重要,?！睘榱送苿涌茖W發(fā)現(xiàn)，科學家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復雜性的研究工具,。對于越來越多的研究人員來說，單細胞RNA測序和單細胞多組學——即在單細胞分辨率下對基因表達及其他基于DNA,、RNA或蛋白質(zhì)的分析物進行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學問題上已證實是行之有效的,。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務。

對于單細胞測序而言,，常常需要先構(gòu)建細胞圖譜,，在此基礎(chǔ)上再開展后續(xù)各項分析，并且數(shù)據(jù)分析時以細胞聚類（cell cluster）為討論對象,，而不是像常規(guī)Bulk測序一樣以組別為分析對象,，因此單細胞測序項目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴格，但是單細胞測序,，特別是目的為圖譜研究時,，需要通過提高樣本復雜度（增加樣本數(shù)），盡可能的構(gòu)建某一疾病類型,、群體細胞圖譜信息,。因此，單細胞測序?qū)嶒炘O(shè)計時首先需要保證生物學重復,，不同樣本來源的樣本建議單獨進行細胞解離和捕獲,、建庫,、測序，以保證捕獲到足夠的細胞數(shù),，單個樣本分別捕獲細胞時,，后續(xù)分析除了整體分析以外，還可以做單樣本分析,，保證分析的完備準確性,。單細胞測序技術(shù)提供了單個細胞水平下的科學研究視角。南京二代測序單細胞測序百萬通量平臺

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針對單細胞測序數(shù)據(jù)分析時的reads數(shù),、基因表達量及細胞數(shù)量判定過程中：以捕獲5000個細胞、100G的測序量為標準,，每個細胞的reads數(shù)大約在50k左右,；每個細胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細胞類型，例如成熟的B,，T,，粒細胞數(shù)量較多的組織中，由于該類型細胞表達的基因數(shù)普遍較少,，導致基因中位數(shù)下降,。而某些疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細胞等,，他們的基因表達數(shù)較高,，甚至可以超過1W，這就導致該類樣本基因中位數(shù)非常高,。因此,，我們對細胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認時，需要考察實際組織的細胞組成,。長春單細胞測序數(shù)據(jù)分析

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